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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD56288.1
DDBJ      :             putative transporter
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  33/68 : Bacteria  531/915 : Eukaryota  48/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.38.1
:526 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   33->86 2gfpA PDBj 3e-05 35.2 %
:RPS:SCOP  24->143 1pw4A  f.38.1.1 * 2e-07 19.5 %
:HMM:SCOP  1->506 1pw4A_ f.38.1.1 * 7.5e-73 29.7 %
:RPS:PFM   25->143 PF07690 * MFS_1 9e-13 37.3 %
:HMM:PFM   16->408 PF07690 * MFS_1 1.1e-53 29.7 344/353  
:BLT:SWISS 25->420 QACA_STAAU 2e-38 29.4 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID BAD56288.1 GT:GENE BAD56288.1 GT:PRODUCT putative transporter GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 1625697..1627277 GB:FROM 1625697 GB:TO 1627277 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT putative transporter GB:PROTEIN_ID BAD56288.1 LENGTH 526 SQ:AASEQ MTTTSSRPRSLVLAVLCLCVIAIYMDAMIVNLALPSLVRELGSSTTGLQWIIDAYALTFAALVLAAGSLGDRFGRRNTLLLGLVIFTVATGLGALCTSTGQLIAARTVMGLGAALIFPSTLSILTNVFVERTERAAAIGVWGAVSGIGVVLGPIVGGLLLEYFWWGSVFVVVVPVGLVCLVLTVLVVPDSRDPATPGLDVPGLVLSTAGIGVLVYSIIEAPNRGWLAAPTLLGFAGAAALLALLVARELRTPHPMIDMRLFANLRFSAACATITITFFTLNGFTFLVTQYFQFLKDYTPLGAGVRLIPVAVAIVVGSVLGGKLVLKVGTRAVVTTGLVLMALAYAWFSVDGVDTSYSLIAAQMVLIGLGIGSVAVPATESIMAVVPADKAGIGSAMNDATRLFGGTLGIAVVGSVHHSLYTGELPDSLPGLPADLLDHSRDSVGAALGVAARVAESGGQGVAAALVDSAEHAFLHGFQVSCLVVTGICAVAAVVAGSLLPTRAPVPDADPAPADSESRQTPEGMSS GT:EXON 1|1-526:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 25->420|QACA_STAAU|2e-38|29.4|395/514| TM:NTM 12 TM:REGION 11->33| TM:REGION 51->73| TM:REGION 77->99| TM:REGION 105->127| TM:REGION 137->159| TM:REGION 168->189| TM:REGION 197->219| TM:REGION 227->249| TM:REGION 299->321| TM:REGION 326->348| TM:REGION 361->383| TM:REGION 478->500| SEG 11->23|lvlavlclcviai| SEG 144->160|vsgigvvlgpivgglll| SEG 168->187|vfvvvvpvglvclvltvlvv| SEG 226->249|laaptllgfagaaallallvarel| SEG 272->279|tititfft| SEG 314->328|vvgsvlggklvlkvg| SEG 443->454|vgaalgvaarva| SEG 503->514|apvpdadpapad| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 33->86|2gfpA|3e-05|35.2|54/375| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 25->143|PF07690|9e-13|37.3|118/347|MFS_1| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 16->408|PF07690|1.1e-53|29.7|344/353|MFS_1| GO:PFM:NREP 1 GO:PFM GO:0055085|"GO:transmembrane transport"|PF07690|IPR011701| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 24->143|1pw4A|2e-07|19.5|118/434|f.38.1.1| HM:SCP:REP 1->506|1pw4A_|7.5e-73|29.7|397/447|f.38.1.1|1/1|MFS general substrate transporter| OP:NHOMO 2247 OP:NHOMOORG 612 OP:PATTERN ------7243334452-21----1----------11--1111-463221-231-------12211--- 1134p42666633483566-6811DA666668999AJTGG5H9S89543782833415--KK8283CURR1----1-----121311111-1-2-----1-21--8-2-2---------------11111-111--4332311133---------11----1-1-----2--------------21----14-566767788588777831661597712144324344449C13223222222222242244323-88--21133119751342511---------12------------------------------1------6911121211111433-221-----2--2-123331--231-1----1--6--------2163521134222--1--111115-1-2--4-317--B22157-6851322-----11111---2222222211111-13-----------------12------------2812154457CDED864566CCCD667546G8E4668--656-15334-318214--1--1--111111-1---1-1211-1-11-111-1-12111-111313-1-------------1---------11-11113-21--1-1-----1--211----------1----------5344-723333333333-33333333333333333316B8574535424344444435344B33133221-644444444444----44333------1-311112--11-----133333131113-55451527225432545------------------------54222222231-----------11-----------------------------------------------11 -------------11121-111-2221-------121---------223611221-121-------1-11----12-----------1-25-21131113-3-1----2-------------------------------------------------1-----------------------------------2---- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 54 STR:RPRED 10.3 SQ:SECSTR ################################HHHHHHTTcccTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHTTcccccccHHHHHHH######################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 1-4, 500-526| PSIPRED cccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccc //