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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD56383.1
DDBJ      :             putative phage tail
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  1/68 : Bacteria  99/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  20/175   --->[See Alignment]
d.3.1
:1494 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   151->327 3d9bA PDBj 8e-05 15.2 %
:RPS:SCOP  1015->1082 2evrA2  d.3.1.16 * 4e-07 25.0 %
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:HMM:PFM   1037->1065 PF00877 * NLPC_P60 3.4e-05 39.3 28/105  
:HMM:PFM   637->752 PF04582 * Reo_sigmaC 0.00012 23.3 116/326  
:BLT:SWISS 145->263 YOMI_BACSU 2e-04 22.9 %
:BLT:SWISS 627->984 EBH_STAAR 1e-04 21.9 %
:TM
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD56383.1 GT:GENE BAD56383.1 GT:PRODUCT putative phage tail GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 1689491..1693975 GB:FROM 1689491 GB:TO 1693975 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT putative phage tail GB:PROTEIN_ID BAD56383.1 LENGTH 1494 SQ:AASEQ 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1037->1065|PF00877|3.4e-05|39.3|28/105|NLPC_P60| HM:PFM:REP 637->752|PF04582|0.00012|23.3|116/326|Reo_sigmaC| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 1015->1082|2evrA2|4e-07|25.0|64/148|d.3.1.16| HM:SCP:REP 1013->1061|2evrA2|0.00026|24.5|49/0|d.3.1.16|1/1|Cysteine proteinases| OP:NHOMO 145 OP:NHOMOORG 120 OP:PATTERN -----------------------------------------1-------------------------- 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ccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEHHccccccccccccccccccccccccccccHHHHHccHHHHHHccccccccEEEcccccHHccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHcccccEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEcccccccccccccccccccEEEEEEccccccccccEEEccccccccccccEEEccccccccccccccEEEEcccccccccccccccHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHcccHHEEccccccccccEEEEcccccEEEEEcHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHcccHHHHccccccc 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