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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD56575.1
DDBJ      :             putative cytochrome b component
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  23/68 : Bacteria  465/915 : Eukaryota  15/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.21.1f.32.1
:543 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   13->212 2zt9A PDBj 1e-27 35.7 %
:RPS:SCOP  20->212 1q90B  f.21.1.2 * 2e-21 27.7 %
:HMM:SCOP  9->292 1ezvC3 f.21.1.2 * 1.2e-58 29.7 %
:HMM:SCOP  259->388 1vf5B_ f.32.1.1 * 0.00014 22.7 %
:RPS:PFM   32->210 PF00033 * Cytochrom_B_N 4e-07 32.9 %
:RPS:PFM   383->458 PF09940 * DUF2172 4e-05 34.7 %
:HMM:PFM   43->229 PF00033 * Cytochrom_B_N 3.4e-09 19.5 133/188  
:BLT:SWISS 5->506 QCRB_MYCLE 0.0 74.3 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD56575.1 GT:GENE BAD56575.1 GT:PRODUCT putative cytochrome b component GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 1879480..1881111 GB:FROM 1879480 GB:TO 1881111 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT putative cytochrome b component GB:PROTEIN_ID BAD56575.1 LENGTH 543 SQ:AASEQ MSPSVAAQANEMDERYRAAAFVKRSINKVFPTHWSFLLGEIALYSFIILLLSGVYLTLYFDPSMAHVVYDGAYQPLRGVGMSRAYETALQISFEVRGGLFVRQVHHWAALLFAASIIVHLFRIFFTGAFRKPREANWVIGSLLLILAMFEGFFGYSLPDDLLSGTGLRAAFSGITIGIPVIGTWIHWLIFGGDFPGEIIIPRLYIAHVLLFPGIMLALIAAHIALVWYQKHTQFPGPGRTENNVVGARIVPVFAADQGAFFAFTLGIVGLMGGLFQINPIWNLGPYNPSQVSAGSQPDFYMMWTDGMARLMPPWELYLGRYTIPAVFWVALVMGLVFTVLIAYPWIEKRLTGDDVHHNLLQRPRDAPVRTAIGAMAIAFYVVLTLSCVNDIIALKFDISLNATTWIGRIGMLVAPPLAYFFTYRFCIGLQRSDRQVLEHGIETGVIKRLPHGEYIEVHQPLGPVDDHGHPIPLEYQGAPVPKKMNKLGSAGKPGTGSFLFPDPPQESERNFELEHAAEQKQLEALAKAQEKAAQEVRGGSGGH GT:EXON 1|1-543:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 5->506|QCRB_MYCLE|0.0|74.3|502/551| TM:NTM 9 TM:REGION 33->55| TM:REGION 107->129| TM:REGION 133->155| TM:REGION 168->190| TM:REGION 203->225| TM:REGION 249->271| TM:REGION 322->344| TM:REGION 372->394| TM:REGION 403->425| SEG 214->225|imlaliaahial| SEG 512->535|elehaaeqkqlealakaqekaaqe| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 13->212|2zt9A|1e-27|35.7|182/215| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 32->210|PF00033|4e-07|32.9|140/172|Cytochrom_B_N| RP:PFM:REP 383->458|PF09940|4e-05|34.7|75/383|DUF2172| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 43->229|PF00033|3.4e-09|19.5|133/188|Cytochrom_B_N| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0009055|"GO:electron carrier activity"|PF00033|IPR005797| GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF00033|IPR005797| GO:PFM GO:0016491|"GO:oxidoreductase activity"|PF00033|IPR005797| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 20->212|1q90B|2e-21|27.7|173/212|f.21.1.2| HM:SCP:REP 9->292|1ezvC3|1.2e-58|29.7|259/261|f.21.1.2|1/1|Transmembrane di-heme cytochromes| HM:SCP:REP 259->388|1vf5B_|0.00014|22.7|110/138|f.32.1.1|1/1|a domain/subunit of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)| OP:NHOMO 551 OP:NHOMOORG 503 OP:PATTERN ------2233333333-21-1---2112122---------------------------------1-11 1-41111111111121111-111111111111111111111121111111111111111111211111311-----------2-1111-------------------------------------1--11111-1---------1-111111111111111111111111111111111111111111----111111111111111111111111111111111------111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1-11----------------1-1111----1111111111111111111111111-11111111121-111111111111111111111111111---------111-11-111-1111111111111111111111-1-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111---1-----------2221322--1111-1--1----11111111111111111-112211-11-111111111111111111111111---1111------1-------------------------------------------------------------------------------------1-----1111111------------------------1111111111111111111------------11111111111111111111111111-1-111------------------------------------------------------1- -----------------------------------1--------11----------1-----1---1--------------------------------------------------------------------------------------------------1-------1-2--------11116-1-------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 194 STR:RPRED 35.7 SQ:SECSTR ############HHHHcHHHHHHHHTTccccTTccGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTccccTTTT######HHHHHHHHTTHHHHHHHHHHTcTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTcGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTccHHHHHHHHHHHTTGGGGcTTTHHHHHHHHHTcccccHHHHHHHHHHHHTHHH########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-3, 478-497, 527-543| PSIPRED cccHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHcccHHccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHccccccHHcccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHcccHHHHcccccHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEcccccEEEEcccccHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccc //