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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD56656.1
DDBJ      :             putative transcriptional regulator
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  52/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.4.6c.23.1c.37.1
:894 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   834->894 1zlkA PDBj 1e-06 36.1 %
:RPS:PDB   809->891 3cloA PDBj 3e-15 27.7 %
:RPS:SCOP  781->862 1qo0D  c.23.1.3 * 2e-04 17.8 %
:RPS:SCOP  835->894 1fseA  a.4.6.2 * 3e-14 33.3 %
:HMM:SCOP  2->244 1iqpA2 c.37.1.20 * 2.1e-13 25.4 %
:HMM:SCOP  816->895 1p4wA_ a.4.6.2 * 1.2e-16 40.0 %
:RPS:PFM   837->888 PF00196 * GerE 6e-09 48.1 %
:HMM:PFM   836->890 PF00196 * GerE 4.5e-19 41.8 55/58  
:BLT:SWISS 809->890 Y914_MYCBO 4e-13 48.1 %
:PROS 518->525|PS00369|PTS_HPR_HIS
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID BAD56656.1 GT:GENE BAD56656.1 GT:PRODUCT putative transcriptional regulator GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION complement(1973903..1976587) GB:FROM 1973903 GB:TO 1976587 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT putative transcriptional regulator GB:PROTEIN_ID BAD56656.1 LENGTH 894 SQ:AASEQ 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781->862|1qo0D|2e-04|17.8|73/189|c.23.1.3| RP:SCP:REP 835->894|1fseA|3e-14|33.3|60/67|a.4.6.2| HM:SCP:REP 2->244|1iqpA2|2.1e-13|25.4|197/0|c.37.1.20|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| HM:SCP:REP 816->895|1p4wA_|1.2e-16|40.0|80/0|a.4.6.2|1/1|C-terminal effector domain of the bipartite response regulators| OP:NHOMO 150 OP:NHOMOORG 52 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ----D--2222---12233-34114733333184441-32--1562---11--4------2-2-4222B31---------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1---1----------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1----------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 115 STR:RPRED 12.9 SQ:SECSTR ################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################cccccccTTccHHHHHHHHHHHHHHTT###########HHccccccccEEEETTTEEEEcccHHHHTTcccHHHHHHHHHHHTTccHHHHHHHHTccHHHHHHHHHHHHHHTTcccHHHHHHHHHH DISOP:02AL 822-838| PSIPRED ccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEccccccHHHHHHHHHHccccEEEEEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEcccccccccccccEEEcccccHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHcccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHc //