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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD56902.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  3/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.24.9
:614 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   87->196 1gwiB PDBj 2e-04 27.8 %
:RPS:SCOP  162->233 1h6gA1  a.24.9.1 * 3e-04 22.2 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD56902.1 GT:GENE BAD56902.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 2235148..2236992 GB:FROM 2235148 GB:TO 2236992 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT hypothetical protein GB:PROTEIN_ID BAD56902.1 LENGTH 614 SQ:AASEQ MVAGSNPVSPTETEDRGRYPNLDGYRLDGTGALGVWLRRCRSSERCPLSRPQRASSPNSQWDGGRRRYRSTVPKKPNIEQTGPLAGHIKRGKRIFLPPLAATDVLHMGDWVRDDVPDLLWPILLLHHSGTEKAKAFAEWQRAVISDAKNSVEPRALGEGLDGRLTSLDRLVQEYPALVEIIRTRAESLHMLPPAVVDALALYPTTPARWLIGEELKDATKDSLDLMTAALFDVLRDGHREALVKCISIWSRVQAGTFSAGQEIIDLLITYPNDPRKQGAADSVIRASWGAYKGALLHHTPDRFDEALKWAKVFWGANSVTTRCIRRRELRIQKVTEDVQHADPQANEVATMSAEVQETDDGGRQQIAKDLASSFVEALETAAQRLYDPERQEVISGLVMRAARDVIAVLGAPDLWCFEHGAHIGRCLVEVRIYIEWMARQDPSIYREFQDYGAGKAKLYAQIVGELPEGMKTPAVQESIEAFRKLSRNHPDLDTRVVDTRDTFAGKSLRGMAQECGLLDYYRHAYAVASGVSHSEWWSVETHAMERCMNILHRGHLIPSLSLQVGADKLLADSWIGALHALIKRSLEILGTDEDAIQSAFAWLEGEEEPEDSTE GT:EXON 1|1-614:0| SEG 493->502|dtrvvdtrdt| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 87->196|1gwiB|2e-04|27.8|108/400| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 162->233|1h6gA1|3e-04|22.2|72/131|a.24.9.1| OP:NHOMO 3 OP:NHOMOORG 3 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 108 STR:RPRED 17.6 SQ:SECSTR ######################################################################################cHHHHHHHHTcTTEEccGGGcHHHHTTccc#TTcTTHHHHcccccGGGccHHHHHHHHHHHHHHccHHHH#HTTHHHHHHHHHHHHHccccccEEEHHHHTTTHHHHHHH################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 1-13, 45-67, 355-363, 604-614| PSIPRED ccccccccccccccccccccccccEEEccccHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccHHHHHHHccccccccccccccHHHHHcccEEEEccHHHHHHHHHccHHHHcHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHcccccHHHcccHHHHHHHHHHHHcccHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEcccccccccHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHccccccccccc //