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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD57254.1
DDBJ      :             putative transporter
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  19/68 : Bacteria  479/915 : Eukaryota  10/199 : Viruses  1/175   --->[See Alignment]
f.38.1
:449 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   149->221 2d33D PDBj 1e-04 14.9 %
:RPS:SCOP  35->401 1pv6A  f.38.1.2 * 3e-07 13.8 %
:HMM:SCOP  13->431 1pv7A_ f.38.1.2 * 5.3e-61 24.1 %
:RPS:PFM   33->416 PF00083 * Sugar_tr 1e-12 28.5 %
:HMM:PFM   26->226 PF00083 * Sugar_tr 3.6e-31 29.2 192/451  
:HMM:PFM   286->431 PF07690 * MFS_1 4.2e-14 24.8 141/353  
:BLT:SWISS 19->427 YHJE_ECOLI 2e-62 38.2 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID BAD57254.1 GT:GENE BAD57254.1 GT:PRODUCT putative transporter GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION complement(2570651..2572000) GB:FROM 2570651 GB:TO 2572000 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT putative transporter GB:PROTEIN_ID BAD57254.1 LENGTH 449 SQ:AASEQ MQVELSAPPATVDRPALRRVAGSVLVGTTIEWYDFQIYGASAAVVFAPLFFSGVEPWLATILSFATFAVGFVARPLGGIVMGHFGDRIGRKKMLVVALLLMGAATFAVGLLPTSQQIGMWAPVLLVVLRLIQGFGVGGEWGGAVLTAVEYAPKNRRGFYGSMPQVGVPAGLLLATGVMFGTRAVTGDQFLVWGWRIPFLLSIVLVALGLYIRVALAETPSFTRVKQTGAEVEVPLADAFRTYPRQIVLAAGSMISTGAYFYILNTYSLTYADQFDLLSGNLMLVAVMVSAAVAVIFIPVFGQISERYGRRRILMVGIGGMGVWIFAAFAAIDTGNFALTTGALAVGALMLSISYGPQATFIAELFDARVRYSASSISFQIGVLLGGAIAPMVAATLVAKTGTSFTVALYIAVLSAISLASVYFVRESDLRRGSTDMFIDDDGVYRPVAQ GT:EXON 1|1-449:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 19->427|YHJE_ECOLI|2e-62|38.2|408/440| TM:NTM 12 TM:REGION 38->60| TM:REGION 65->87| TM:REGION 93->115| TM:REGION 117->138| TM:REGION 168->190| TM:REGION 197->219| TM:REGION 242->264| TM:REGION 279->301| TM:REGION 312->334| TM:REGION 337->359| TM:REGION 375->397| TM:REGION 404->426| SEG 93->104|mlvvalllmgaa| SEG 133->142|gfgvggewgg| SEG 284->294|vavmvsaavav| SEG 337->350|alttgalavgalml| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 149->221|2d33D|1e-04|14.9|67/499| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 33->416|PF00083|1e-12|28.5|365/433|Sugar_tr| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 26->226|PF00083|3.6e-31|29.2|192/451|Sugar_tr| HM:PFM:REP 286->431|PF07690|4.2e-14|24.8|141/353|MFS_1| GO:PFM:NREP 4 GO:PFM GO:0005215|"GO:transporter activity"|PF00083|IPR005828| GO:PFM GO:0006810|"GO:transport"|PF00083|IPR005828| GO:PFM GO:0016021|"GO:integral to membrane"|PF00083|IPR005828| GO:PFM GO:0055085|"GO:transmembrane transport"|PF00083|IPR005828| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 35->401|1pv6A|3e-07|13.8|349/417|f.38.1.2| HM:SCP:REP 13->431|1pv7A_|5.3e-61|24.1|394/417|f.38.1.2|1/1|MFS general substrate transporter| OP:NHOMO 2628 OP:NHOMOORG 509 OP:PATTERN ------3766887684-623332--------------------------------------113---- -1--131588C-2153322-27--1U2222215999DNno--224-1-1441PJL626-----328Q76311111222-13-A--111--------1--1-2---2-2-2-----------------1-1---1-------11111--------------131---------1-----1-----1--------1222222211222222------222-23--1-------1-1111111111111111-112----11-2-----11-----11--------------------------------------------------------------------------------------------------1--44461442452F551-32323244444443435-66A55G7C221-566622433444B4-----5-----1-32333333344-21-1442332221122467A64E4474473233-1564-63345WOOVQSBEHHCUUZLJLIHBHWJXAHCB-5FC832521611-8336---1131-------11--1-1--1----21--------------111111-----1-5455341-2222212-------1-1---------------1--------------1---------77771764668577755-665567555667555455678766--26656666666556566833643441-322222222222----11111575711-11-------22211--188889571125-99B8BDD91EFFF-B8A955449555----------1----55545444451111---------------------------------------------------------1- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------3------------------------------------------------------3------------11-----1----1---241---1 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------- STR:NPRED 67 STR:RPRED 14.9 SQ:SECSTR ####################################################################################################################################################ccccEEEEccccTTccHHHHHHHHcccEEEEEEEEcc######TTcTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccc#################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-17, 221-235, 427-444, 447-449| PSIPRED cccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHccccccccccccc //