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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD57381.1
DDBJ      :             putative multidrug efflux transporter
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  37/68 : Bacteria  544/915 : Eukaryota  105/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.38.1
:497 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   79->178 2d33D PDBj 1e-05 12.1 %
:RPS:SCOP  63->186 1pv6A  f.38.1.2 * 1e-09 19.5 %
:HMM:SCOP  1->488 1pw4A_ f.38.1.1 * 3.4e-71 32.3 %
:RPS:PFM   80->184 PF07690 * MFS_1 2e-14 44.2 %
:HMM:PFM   33->420 PF07690 * MFS_1 1.5e-57 32.6 341/353  
:BLT:SWISS 60->329 QACA_STAAU 1e-40 35.6 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID BAD57381.1 GT:GENE BAD57381.1 GT:PRODUCT putative multidrug efflux transporter GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 2696276..2697769 GB:FROM 2696276 GB:TO 2697769 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT putative multidrug efflux transporter GB:PROTEIN_ID BAD57381.1 LENGTH 497 SQ:AASEQ MTQVQAQQHADAAAPTVGSRRAWLGLAVLLLPVLLVSMDVSVLFLALPTLTTDLDPSATQQLWILDIYGFLIAGLLITMGNLGDRIGRRNILLAGAAVFGVGSVLAAFAPSAAVLIAARALMGIGGATLLPSSLALISTLFADARERAAAIGVWTAFFAGGSAVGPIIGGLLLHHFWWGSVFLINAPVLLVLLVLGPLVLPEHRSRELGPLDLPSVALSIGGILPVVYAVKHAAAEGVDLEAVLIGLLGAVVLVLFARRQRVLDEPLLDLDLFRRPQFRVAIGSSLAGMMSLAALSYLTSVYLQSVTGRDPLAAALLGIPMAIAVFVFSMGGARVGHVLGVRATFVIALLAAAVGNLMVLGVGVDGGVGWYVAGSTIAGVGYGLAFTLVSDVAVSSVPPERAGSAVGISETSFELGNALGLALLGSLAALVFRSGGDFGDTLGETVQHAAGNDAVIHAARESFVTGMHVATGVGAAVLTAMAVIAWVSTGRGRVGES GT:EXON 1|1-497:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 60->329|QACA_STAAU|1e-40|35.6|270/514| TM:NTM 14 TM:REGION 27->49| TM:REGION 60->82| TM:REGION 92->114| TM:REGION 122->144| TM:REGION 150->172| TM:REGION 179->201| TM:REGION 209->231| TM:REGION 236->257| TM:REGION 281->303| TM:REGION 310->332| TM:REGION 341->363| TM:REGION 374->396| TM:REGION 413->435| TM:REGION 466->488| SEG 3->14|qvqaqqhadaaa| SEG 24->59|lglavlllpvllvsmdvsvlflalptlttdldpsat| SEG 187->201|pvllvllvlgplvlp| SEG 240->255|leavligllgavvlvl| SEG 348->374|allaaavgnlmvlgvgvdggvgwyvag| SEG 415->430|lgnalglallgslaal| SEG 469->483|vatgvgaavltamav| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 79->178|2d33D|1e-05|12.1|99/499| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 80->184|PF07690|2e-14|44.2|104/347|MFS_1| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 33->420|PF07690|1.5e-57|32.6|341/353|MFS_1| GO:PFM:NREP 1 GO:PFM GO:0055085|"GO:transmembrane transport"|PF07690|IPR011701| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 63->186|1pv6A|1e-09|19.5|123/417|f.38.1.2| HM:SCP:REP 1->488|1pw4A_|3.4e-71|32.3|405/447|f.38.1.1|1/1|MFS general substrate transporter| OP:NHOMO 2442 OP:NHOMOORG 686 OP:PATTERN ------4211111112-1-----21--1--112121--1111-774343-231-------1342---- 4243d33777633585866-6922EB666668A98AGFB94B7F795336529445-6--FG6243DMRL11---1---1112-11-111---1-------1---7---1--------------1111---111--3442211142---------11-1-------1--1-------------221----241666666766376677552655666522134424455548D1544244444444443333433318A11212782276525213321--------11------------------------------1------681112121-11-366-332-----3--2-443331-12321111-----5--1---1-1123722-2412211221222228---1--61218--9224784AC96643-1121-1111---3333333322222--3-----------------1-------------2422354478GHEH9699A9DDFF98996CLCF5689--43611633625372251---151--11111-1---311111-2-211223-2-21111-12222511-------------1---------11-22112-21----1-----1--312---------------------44452622222222222-222222222222322222358658453321212212121212262212221--622222222222----12-11------322----1----------22223131111-44441628113411243222323222--23-22232-----33--------1-----------11-----------------------------------------------2- -------------123421426396B43321123223333233111454B579523536121--1-33-1----3-21-1-2221-22-3424-431-132--211--3-111222--1-1-1--1--1131-1-1----1-1---1------111111-2----------------------------2----2---- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 99 STR:RPRED 19.9 SQ:SECSTR ##############################################################################GcTTcccccTTccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHTTccEETTEEccccccccccGGGccc#cEEEEccccTTccHHHHHHHHcccEEEEEEEEccTT############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-21, 488-497| PSIPRED cccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccc //