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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD57528.1
DDBJ      :             putative histidine kinase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  38/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.122.1
:747 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   411->545 3bk9F PDBj 6e-20 10.4 %
:RPS:PDB   531->627 2dvyD PDBj 4e-09 11.3 %
:RPS:SCOP  485->627 1b3qA3  d.122.1.3 * 3e-07 17.5 %
:HMM:SCOP  484->628 1b3qA3 d.122.1.3 * 1.2e-19 27.3 %
:RPS:PFM   59->280 PF08376 * NIT 2e-05 27.3 %
:RPS:PFM   522->627 PF02518 * HATPase_c 1e-06 28.6 %
:HMM:PFM   58->287 PF08376 * NIT 3.3e-36 28.5 228/247  
:HMM:PFM   519->627 PF02518 * HATPase_c 7.3e-15 29.0 107/111  
:HMM:PFM   318->400 PF00672 * HAMP 1e-13 34.8 66/70  
:BLT:SWISS 439->624 QSEC_ECOLI 2e-08 28.7 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD57528.1 GT:GENE BAD57528.1 GT:PRODUCT putative histidine kinase GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION complement(2846192..2848435) GB:FROM 2846192 GB:TO 2848435 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT putative histidine kinase GB:PROTEIN_ID BAD57528.1 LENGTH 747 SQ:AASEQ MRMFRARLGVRGRILAIALVPSLVLLVIGVGAAGYLVDEGRQARYWAVQLQAAMPSARELIEAVQQERRYTLAHLAGDPTTGPALTAARVRLDGAFRQLIEVSGDVRAASDDRYGDDLAGFATLGQHLSGLRAGVDVRQVPAADAYAFYNRLLDVVTVGTQVTRQSAPSAEVGVELTEGMRMLYAAEAMSKANALAVTLADGGSPAVPVEELLYQIGFYHTEIGLLAADIDNEQREAAAALTRSPAWQQVTAMENAVLRRVAGADTADPPMDTEQWQSAAAEVNRGLLDLWIAQNKRTQRLAEETSGDSALGSLYGGLGVMLVSVAAFLIAVVLANRIIRRLKRLRGETLALADERLPAMLRRLRAGESVDPAAETPRLDYGRDEIGQVARAFEHAHAAAVTAAVDEARTREGVKAVFLNIAHRSQIVVHRQLEILDEAESRQEDPQLLETLFRLDHLATRERRNAENLIVLGGGMPGRQWRHPIPLLDLVRAAVGETLDYARVHVHRIPDTHVLGSVVADLGHLLAELVDNAIAFSPPQSRVELSGAVVGRGVVVEVSDQGMGMSEEELARVNEMLREPPDFGVARLSADSRLGLFVVAQLAVRHGVSVRLSESPYGGVRAVVLIPSALLAAEPPAPRPAEYPLRQRYSAVPDEPAGDRADTAVATLAPPAPVRAPAAAFTPDGRPQLPRRRRQAPRAAESPATPAPAAPDRERSPEQARDLMSAIENGTRQGRRERLADGQEGEQ GT:EXON 1|1-747:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 439->624|QSEC_ECOLI|2e-08|28.7|178/449| TM:NTM 2 TM:REGION 13->35| TM:REGION 313->335| SEG 390->410|arafehahaaavtaavdeart| SEG 547->558|gavvgrgvvvev| SEG 629->646|allaaeppaprpaeyplr| SEG 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----9----------1111-11--1111111111117122-5462---1-----------64--575CDA6---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 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##########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHTTccHHHHHTTTGGGGTTccGGGcHHHHHHHHHHTcccGGGGTTTTTcHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHTccccTTccGGGHHHHHHHHHcTTTTHHHHHHHHHccccTTcccEEEEccTTccEEccTTTcccccccEEEcccccccTTccccTHHHHHHHHHTTTcccHHHHTTHHHHHHTcccc######################################################################################################################## DISOP:02AL 1-3, 408-411, 440-446, 581-591, 630-725, 727-747| PSIPRED cccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHccHHcccHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHccccccHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEEEcccEEEEEEEEccccccHHHHHHHccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEEccccEEEEEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccc //