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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD57722.1
DDBJ      :             putative two-component system sensor kinase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  3/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.122.1
:759 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   215->311 3ehfB PDBj 2e-04 17.8 %
:RPS:PDB   341->400 2bu2A PDBj 2e-04 10.0 %
:RPS:SCOP  346->382 2c2aA2  d.122.1.3 * 2e-04 18.9 %
:HMM:SCOP  291->382 1s14A_ d.122.1.2 * 1.8e-06 22.8 %
:HMM:PFM   294->379 PF02518 * HATPase_c 4.7e-07 25.6 86/111  
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID BAD57722.1 GT:GENE BAD57722.1 GT:PRODUCT putative two-component system sensor kinase GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION complement(3061881..3064160) GB:FROM 3061881 GB:TO 3064160 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT putative two-component system sensor kinase GB:PROTEIN_ID BAD57722.1 LENGTH 759 SQ:AASEQ MPKGLVMPPAQLETRRITVERVVARTERIGVTVLSGVNSVVALACLLDGDGGRGGLAVNIGLLGWSLWRLSRPSMGQWWQLADLAVVSVYLLCTPLLVDGPEFTTAASPMLAVAGTAVISFSLATATIRSLGATVVVMASWAVGAAGVDEVGNPLAIFSLDFLLVEWAMAALLRRLVVRAAAATDDGFEQLDRTRIAAEVAEARAKAEREMWATMHDTAASTLTMLGQGVCADPARLRRQLQRDVHAVTAEPVFLTESGTVDVVPLIRAICDDVVTPVRLTAPTSLVLDSTVGQALVSATREALTNVDRHAHARSATVDITDDHVDIGDDGVGFDISDPEPRRRRHGIRGSMIGRITDIEGTVEVDSTPGRGTQVILRWAREDGSGTDQPDAFDHSRRLLRGYGYGLVAIAGIVTALQGLRALSADHAVAQLAVMALASAAVLAAWIDIRVGLPTLVWWTTVLAVIVAVPIQALLLSPAQLSTGANWAVAALGWQIAALAYTRPRTLSMTLLCALWLIGAVVMLVRSPATAGIAELVYTIASVLVMQATAIGFTAFLQHAVTRTSQLRATITDLQLRTTLTETLRRDHRARHRQLSTTLVPLLHRLAQETDPAADPALRAACVIESARLRRMFGGNDQSAHPLVEELRPVIDAAEHRGVAVALHVSGELPTLTPTERTRLLSAPVTLLTAARTRARVVFTGPTPEQPFPTISIVCDCDDTVRATATTIAPNSDVTTDEQLTWATFTLDPAPRPLEETTP GT:EXON 1|1-759:0| TM:NTM 11 TM:REGION 20->42| TM:REGION 79->101| TM:REGION 107->129| TM:REGION 135->157| TM:REGION 163->185| TM:REGION 399->421| TM:REGION 431->453| TM:REGION 459->481| TM:REGION 483->502| TM:REGION 508->530| TM:REGION 536->558| SEG 42->57|alaclldgdggrggla| SEG 170->183|aallrrlvvraaaa| SEG 193->213|rtriaaevaearakaeremwa| SEG 318->338|vditddhvdigddgvgfdisd| SEG 428->445|avaqlavmalasaavlaa| SEG 572->589|tdlqlrttltetlrrdhr| SEG 668->681|elptltptertrll| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 215->311|3ehfB|2e-04|17.8|90/101| RP:PDB:REP 341->400|2bu2A|2e-04|10.0|60/358| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 294->379|PF02518|4.7e-07|25.6|86/111|HATPase_c| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 346->382|2c2aA2|2e-04|18.9|37/151|d.122.1.3| HM:SCP:REP 291->382|1s14A_|1.8e-06|22.8|92/168|d.122.1.2|1/1|ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase| OP:NHOMO 4 OP:NHOMOORG 3 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ---------------------1------------2-1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 151 STR:RPRED 19.9 SQ:SECSTR ######################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHHHHHHHHH####HHHHHHTTTcHHHH#HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHH##HHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccc############################cTTTTccccccHHHHHHHHTTcEEEEEEETTEEEEEEEEEEccTTTcccccccccGGGccc####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-3, 5-6, 233-242, 340-345, 382-396, 754-759| PSIPRED cccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcEEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEEEEEEEEEcccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHccEEEEEEcccccEEEEEEEEcccccccccccHHHcccHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEccccccccHHHHHHHHccHHHHHHHHHcEEEEEEcccccccccEEEEEEcccccHHHHEEEEcccccccccccEEEEEEEEcccccccccccc //