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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : glgP
DDBJ      :glgP         putative glycogen phosphorylase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  38/68 : Bacteria  372/915 : Eukaryota  58/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.87.1
:857 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   136->639 2qn8A PDBj 8e-23 28.9 %
:RPS:PDB   86->756 3e3nH PDBj e-122 24.3 %
:RPS:SCOP  86->756 1a8iA  c.87.1.4 * e-105 22.2 %
:HMM:SCOP  1->750 1ygpA_ c.87.1.4 * 1e-204 33.7 %
:RPS:PFM   6->121 PF11897 * DUF3417 6e-25 52.6 %
:RPS:PFM   121->170,271->625 PF00343 * Phosphorylase 7e-33 37.3 %
:HMM:PFM   4->121 PF11897 * DUF3417 2e-43 48.7 117/119  
:HMM:PFM   125->171 PF00343 * Phosphorylase 2.5e-06 47.8 46/713  
:HMM:PFM   266->334 PF00343 * Phosphorylase 0.0001 20.3 69/713  
:HMM:PFM   360->631 PF00343 * Phosphorylase 2.3e-12 25.2 258/713  
:BLT:SWISS 1->852 PHSG_MYCTU 0.0 72.0 %
:PROS 603->615|PS00102|PHOSPHORYLASE
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD55925.1 GT:GENE glgP GT:PRODUCT putative glycogen phosphorylase GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 1195765..1198338 GB:FROM 1195765 GB:TO 1198338 GB:DIRECTION + GB:GENE glgP GB:PRODUCT putative glycogen phosphorylase GB:PROTEIN_ID BAD55925.1 LENGTH 857 SQ:AASEQ 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121----1111---11111-11--11111111111111111111111--11-1111-1----1-1111111-----------111---11221111---11---1-1111---------------111-111111111111---1---1311-22--111-1111122211-111---1-11-11111111--------------------11-------------------1---------------------1---------11----------111------11--11111111111-------------1--------11--11----------1-11----1-1----12---221-3--111111--11-----------1---1-1-111-------------11-1111121--1111--111111-----------------------1----11--------------------------------1---------------------11-----1--1-1-------1-----1-11---1-2-1---------2211-1-141-1121231111121222213-----161-----------------------2111--1-2-----1-----------------------112------111-1111111111111-1111111111111111111111-----1111111111111111-1111111--111111111111------------------111--1--------------------111111111-11112111111111111-111-1111111111----------------11-------------------------------------------11--1--11211 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#####################GGGGGGGcccTTccHHHHHHHHHHHHHTTcccGGGccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH#HHHHHHHHHHHHcccEEEEEcccccccccHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHTTccEEEEEEcccccccEEEEETTTEEEEEcccTTTTccTTcEEGGGcEEEEEEEEEEcccEEEEEEEEEEcccccGGGHHHHHHHHHHHHHGHHHcccccHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGHHHHEEEEEEccTTTTHHHHHHHHHHHTcccHHHHHHHHHHHEEEEcccccTTcccEEEHHHHHHHcHHHHHHHHHHHcTTccHHHHHccEEcccccEEEHHHHHHHHccEEEEccHHHHHHHHHTTTHHHHHHcTTGGGEEEccccccTcccTcHHHHHHHHTTcccGGGGcGGGGGGGGGGGcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTccHccccccccEEEEEEccccTTTTHHHHHHHHHHHHHcTTcccccEEEEEEccccTTcHHHHHHHHHHHHHHHTTTTcEEEEEEccccHHHHHHHGGGccEEEEcccTTTcccccHHHHHHHTTcEEEEcccTTHHHHHHGGGcEEccccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHcHHHHcHHHHHTHHcHHHHHHHHHHHHTTTcTTcTTTTHHHHHHHHHccTTcHHHHHHGGcHHHHHHHHHHHHHHHTcHHHHHHHHHHHHTTcGGGcHHHHHHHHHHHHHHHTTcccccccccccc##################################################################### DISOP:02AL 1-2| PSIPRED ccccEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHcHHHHHHHcccHHHHHHHccHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHcccccccccEEEEEHHHHccHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEEcccEEEEEEcccccEEEcccccccccccEEEEcccccEEEEEEEccccEEEEEEEEEEEcccccHHHHcccccccHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHcccccEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEccccccccccHHHHHHHcHHHHHHHHccccccHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEcccccEEEEEEccHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHcccEEEEccccHHHHHHHHHHccHHHccccccccccccHHHHHHHHcccEEEEccccEEEEEcccccEEEcccccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEcccccccccccccEEEEEEEEEcccccccEEEEEEEEEEEcccccEEccEEEEEEEEccccccEEEEEEEccccccccEEEEEEEEccccccccHHHcEEEEccc //