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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : hsdR
DDBJ      :hsdR         putative restriction-modification system endonuclease
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  12/68 : Bacteria  270/915 : Eukaryota  7/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1d.126.1
:1147 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   311->739 2fwrB PDBj 4e-07 27.9 %
:RPS:PDB   309->710 1cxpC PDBj 6e-39 14.2 %
:RPS:SCOP  318->541 2fwrA2  c.37.1.19 * 1e-18 25.2 %
:RPS:SCOP  578->742 1z5zA1  c.37.1.19 * 8e-06 15.5 %
:RPS:SCOP  901->1017 1jdwA  d.126.1.2 * 8e-06 16.2 %
:HMM:SCOP  320->596 1z3iX2 c.37.1.19 * 3.3e-42 24.9 %
:HMM:SCOP  490->742 2fwrA1 c.37.1.19 * 7e-19 22.7 %
:RPS:PFM   375->527 PF04851 * ResIII 1e-15 38.9 %
:RPS:PFM   902->1143 PF12082 * DUF3559 2e-38 43.9 %
:HMM:PFM   373->528 PF04851 * ResIII 9e-34 37.1 151/184  
:HMM:PFM   943->1142 PF12082 * DUF3559 4.7e-17 23.3 193/311  
:HMM:PFM   257->335 PF04313 * HSDR_N 1.6e-07 31.7 63/185  
:HMM:PFM   689->742 PF00271 * Helicase_C 2.2e-08 25.0 52/78  
:BLT:SWISS 237->949 T1RK_ECOLI 8e-45 31.7 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD57612.1 GT:GENE hsdR GT:PRODUCT putative restriction-modification system endonuclease GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 2929350..2932793 GB:FROM 2929350 GB:TO 2932793 GB:DIRECTION + GB:GENE hsdR GB:PRODUCT putative restriction-modification system endonuclease GB:PROTEIN_ID BAD57612.1 LENGTH 1147 SQ:AASEQ 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DISOP:02AL 1-2, 1143-1147| PSIPRED cccccHHHccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHcccHHHcccHHHHHHHHHHHHccccEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccEEEEEEcccccccccEEEEEEEcccEEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEcccEEEEEccccccccHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEcccccccEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEccccccccHHHHHHHHHccccEEEEEcHHHHHHcccccccEEcEEEccccHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHcHHHcccEEEEEEcccHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEcHHHcccccccccEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccccEEEEEEEccHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHcccHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEccccccccEEcccccEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccc 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