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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : nuoM
DDBJ      :nuoM         putative NADH dehydrogenase I chain M
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  62/68 : Bacteria  692/915 : Eukaryota  56/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:543 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   251->469 2c1wA PDBj 2e-23 8.1 %
:RPS:PFM   144->433 PF00361 * Oxidored_q1 1e-27 39.5 %
:HMM:PFM   143->434 PF00361 * Oxidored_q1 3.5e-59 34.1 267/270  
:HMM:PFM   80->109 PF01059 * Oxidored_q5_N 0.00014 43.3 30/110  
:BLT:SWISS 59->524 NUOM_MYCTU e-155 67.0 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID BAD57503.1 GT:GENE nuoM GT:PRODUCT putative NADH dehydrogenase I chain M GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION complement(2822291..2823922) GB:FROM 2822291 GB:TO 2823922 GB:DIRECTION - GB:GENE nuoM GB:PRODUCT putative NADH dehydrogenase I chain M GB:PROTEIN_ID BAD57503.1 LENGTH 543 SQ:AASEQ MSEAVVSDFPWLTILWLLPVAGALAVLAVPAERRTLARGLALAVSVGVLGVAAGLAVAFEPGGAQYQFVESRQWIPAFGAGYTLGLDGIALVLVVLTAALVPLLILAGWHDDREVGSGRRVAHTYVALTLLVEAMVLMSFLALDILLFYVFFEAMLIPMYFLIGGFGPRTGDLAARATRSRAAVKFLLYNLLGGLIMLAAVIGLYVLTARAGLGPDGGGTFDLRTVVAAANSGALGAGPAVLNALFLGFMFAFAVKAPLWPLHTWLPDAAVAATPSSAVLMMAVVDKVGTFGMLRFCLTLFPGASQTYAPLVITLAVIGILYGALLAIGQTDVMRLIAYTSISHFGFIILGIFAMTSQSQSGATLYMVNHGISTAALFLIAGFLVSRRGTRLIADYGGVQKVAPVLAGTFFVAGLATLSLPGLAPFVSEFLVLVGTFSRYQVAAVFATGALVLAAIYVLWLYQRMMTGPVKAGNEKLPDLVPRELLVVAPLIAGLVFLGVYPKAVLDVVDPAVGQTLTTIGRQDPAPTVPAPAAADLQEGGHP GT:EXON 1|1-543:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 59->524|NUOM_MYCTU|e-155|67.0|454/553| TM:NTM 14 TM:REGION 8->30| TM:REGION 39->61| TM:REGION 85->107| TM:REGION 122->144| TM:REGION 148->170| TM:REGION 186->208| TM:REGION 230->252| TM:REGION 273->295| TM:REGION 308->330| TM:REGION 334->355| TM:REGION 365->386| TM:REGION 408->430| TM:REGION 441->463| TM:REGION 485->507| SEG 15->31|lwllpvagalavlavpa| SEG 36->58|larglalavsvgvlgvaaglava| SEG 90->107|alvlvvltaalvpllila| SEG 187->198|llynllggliml| SEG 525->535|paptvpapaaa| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 251->469|2c1wA|2e-23|8.1|209/273| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 144->433|PF00361|1e-27|39.5|263/268|Oxidored_q1| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 143->434|PF00361|3.5e-59|34.1|267/270|Oxidored_q1| HM:PFM:REP 80->109|PF01059|0.00014|43.3|30/110|Oxidored_q5_N| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0008137|"GO:NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity"|PF00361|IPR001750| GO:PFM GO:0042773|"GO:ATP synthesis coupled electron transport"|PF00361|IPR001750| GO:PFM GO:0055114|"GO:oxidation reduction"|PF00361|IPR001750| OP:NHOMO 3139 OP:NHOMOORG 810 OP:PATTERN 22314121111111227-11111-46665575-1-112111113121425746-744A4D54233-33 6473532544422244333-34--353333333565455422352424722-223232--76433753784--------41176833533333---2--3-332-55643--------------353353553365AAA8866674888777977885555668887AA8644444444434422422--3-5233333333333333342332233353644222222223224444444444444444444----------------------------------------------------------------------14--3----------3-------131--5--336653--234611411--5A5333443335535457545B77744444444444-443443645362555778B744AA46565656586644533333333855-457A4445655533334444444444444555532322-54444333343333334445545534438345522333334555457454474433332222222467536435-624-675225-98856984M55754B-6255432322233333233333664655343-4-22-22------53-----333-462--D76613122233453436663633334-6666633665636566666444533343333333433333333344555563-533333333333333655554333381131----2----------444444533321444433324333353333333333335----22212-----44444444443333334-333333------------------------------------131222-22-5C2 --------------1--1---------21--11222-------21--2------353-1---1-1-------1-----------1--------2---22------2------21113-----2-31-2-25--22-----2--22--------2-2------12-1121-1-11-2----------2-9-13------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 209 STR:RPRED 38.5 SQ:SECSTR ##########################################################################################################################################################################################################################################################TTccccTTTEEEccccccccccccccEEEEcHHHHTTTcTHHHHHHHHHHH##########HHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHTcccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHTTccccccccccccHHHHHHHTTcEEEEEEccccccccccTTccEEEEEEEETTcccccEEEEccccHHHHHHHHHHHHHTc########################################################################## DISOP:02AL 528-543| PSIPRED ccccHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHccccccccccc //