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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : nuoN
DDBJ      :nuoN         putative NADH dehydrogenase I chain N
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  29/68 : Bacteria  576/915 : Eukaryota  11/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:538 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   279->364 2c1wA PDBj 5e-10 12.3 %
:RPS:PFM   179->442 PF00361 * Oxidored_q1 4e-13 30.9 %
:HMM:PFM   179->456 PF00361 * Oxidored_q1 1.1e-66 34.2 269/270  
:BLT:SWISS 12->492 NUON_MYCTU 1e-96 54.0 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD57502.1 GT:GENE nuoN GT:PRODUCT putative NADH dehydrogenase I chain N GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION complement(2820678..2822294) GB:FROM 2820678 GB:TO 2822294 GB:DIRECTION - GB:GENE nuoN GB:PRODUCT putative NADH dehydrogenase I chain N GB:PROTEIN_ID BAD57502.1 LENGTH 538 SQ:AASEQ MTAQPLPLAATVPAPSIEYGVLAPMLIVFGAAVAGVLVEAFVPRRFRYGTQLVLALGGSAAGFVAVLAVWGAEQTAVVGAVAVDGVTLFLQGTLLVVAALGVLLMAERRGTRSRVRSGPGTWSRAAATLDRGLDAFTPQAAAVPGSADEQAAARAGAVTTEVFPLTMLAVGGMMLLPASNDLLIMFVALEVLSLPLYLLCGLARHRRLLSQEAALKYFLLGAFSSAFFLYGVALLYGQTGTVRLGGIADALAARPQDDPLLALLGLAMLTVGLLFKVGAVPFQAWVPDVYQGAPTPVTAFMAAATKIAAVGALVRVLYVGVPGLVDDWRPVLATVAIATMVVGAVLAVTQTDVKRMLAYSSITHAGFLLTGLLAADDAGIRAVLFYLAAYALGTLGAFAVVTLVRDGDEEATGLAQWAGLGRRSPWAATVFALFLLSFAGIPLTSGFVAKFAVFEAAAGGYGAAVVVVGVLTSAVAAFFYVRVIVMMFFTEQPADAPAVLPLALTRAVITVTAAATLVLGVLPQPLLDLAEHAATLVR GT:EXON 1|1-538:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 12->492|NUON_MYCTU|1e-96|54.0|474/531| TM:NTM 13 TM:REGION 21->43| TM:REGION 49->71| TM:REGION 81->103| TM:REGION 153->175| TM:REGION 183->204| TM:REGION 220->242| TM:REGION 259->281| TM:REGION 298->320| TM:REGION 329->351| TM:REGION 382->404| TM:REGION 429->451| TM:REGION 465->487| TM:REGION 505->527| SEG 76->86|avvgavavdgv| SEG 94->106|llvvaalgvllma| SEG 218->229|fllgafssaffl| SEG 260->274|llallglamltvgll| SEG 299->309|afmaaatkiaa| SEG 365->379|agflltgllaaddag| SEG 384->399|lfylaayalgtlgafa| SEG 446->477|gfvakfavfeaaaggygaavvvvgvltsavaa| SEG 493->522|padapavlplaltravitvtaaatlvlgvl| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 279->364|2c1wA|5e-10|12.3|73/273| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 179->442|PF00361|4e-13|30.9|249/268|Oxidored_q1| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 179->456|PF00361|1.1e-66|34.2|269/270|Oxidored_q1| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0008137|"GO:NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity"|PF00361|IPR001750| GO:PFM GO:0042773|"GO:ATP synthesis coupled electron transport"|PF00361|IPR001750| GO:PFM GO:0055114|"GO:oxidation reduction"|PF00361|IPR001750| OP:NHOMO 814 OP:NHOMOORG 616 OP:PATTERN ------1-------1-2-------23312212-------------1-111211-22123331--1-11 223131-1111---11111-12--1311111121113211112111-2211-1121-1--11211222342-----------32111111111------1-11--31211--------------11111111112144422222332111111111111111111211111111111111-11111----1-2-1111111111111112-----1111111--1---1--11-------------------------------------------------------------------------------------------1--1----------1------------4--112221---212--1----331111111111212111111222111111111111-11111122112111112222112211222211111111111111111222-122311121111--11-------------222211111-111111111111111111112222121131121111111111111221111111111111111111122111-1-1---1-1----232124325223212-2111-------111111111111-1222111---------------------111-131--3211------11121112221211112-2222211212212222221111111111111111111111111121222221-11111111111111111111111113--1----------------11111111111-111111111111111111111111111--------------11111111111111111-222222-------------------------------------1--------131 -------------------------------11---------------------121-----------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------1----------2-2-11------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 73 STR:RPRED 13.6 SQ:SECSTR ######################################################################################################################################################################################################################################################################################cccTTccccccccccccccE#############EEEcHHHHTTTcTHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHH############################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 1-4| PSIPRED cccccccHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHc //