[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Nitrosococcus oceani ATCC 19707 (noce0)
Gene : ABA56661.1
DDBJ      :             chemotaxis sensory transducer
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  26/68 : Bacteria  504/915 : Eukaryota  7/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.92.1h.4.5
:537 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   253->534 2ch7A PDBj 4e-16 26.3 %
:RPS:PDB   240->535 2ch7A PDBj 2e-42 23.0 %
:RPS:SCOP  284->535 3cmnA1  d.92.1.16 * 2e-28 8.0 %
:HMM:SCOP  227->535 2ch7B1 h.4.5.1 * 5.5e-72 43.3 %
:RPS:PFM   327->535 PF00015 * MCPsignal 7e-27 41.6 %
:HMM:PFM   326->535 PF00015 * MCPsignal 4.6e-53 37.6 210/213  
:HMM:PFM   255->359 PF02181 * FH2 0.00022 14.7 102/371  
:HMM:PFM   58->171 PF09820 * AAA-ATPase_like 0.00018 16.8 113/284  
:BLT:SWISS 139->537 PILJ_PSEAE e-100 54.9 %
:TM
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABA56661.1 GT:GENE ABA56661.1 GT:PRODUCT chemotaxis sensory transducer GT:DATABASE GIB00281CH01 GT:ORG noce0 GB:ACCESSION GIB00281CH01 GB:LOCATION complement(139364..140977) GB:FROM 139364 GB:TO 140977 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT chemotaxis sensory transducer GB:PROTEIN_ID ABA56661.1 GB:DB_XREF GI:76881980 InterPro:IPR003660 InterPro:IPR004089 InterPro:IPR004090 LENGTH 537 SQ:AASEQ MNIQNHIYLSILTVKKHLLLTVITVLLVFTTTAGISYATWQINKLNADIKLGSDLRVLTQRFPIFILSMISNNKTKKEKINEGISAFDKKLEELYNNKLHTPSTAATIEESRQKIQSIWSQLKKDLIDTLNTPQKSNISNLFEHSDDLFHIITGLLESYQNTRNQLQIILVASYVTGIGALILLLILFTRPVKTLRQKFNGLEIKNSHNQDAILKLLDEMGDLADGDLTVSATVTEDITGAIADSINYTIDALRTLVQDINDTAIKVSSSAQETQATVMHLADASEHQAQQITTVGAAINEMAVSIEQVSDNATKSAEVAKQSVEIASKGTETVKNAIEGMDNIREQIQETSKRIKRLGESSQQIGEIVELINDIAEQTNILSLNAAIQAAMAGEAGRGFAVVADEVQRLAERSSSATKQIDALVKTIQSDTHEAIISMEESTSGVVSGAKLSQDAGGALGQIESVSHHLAELIQNISGAAKQQAAAAAGISDTMNVIQEITDQTSKGTNETASSIGRLSEYANEMRESVAGFKLPQ GT:EXON 1|1-537:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 139->537|PILJ_PSEAE|e-100|54.9|399/682| COIL:NAA 8 COIL:NSEG 2 COIL:REGION 331->332| COIL:REGION 356->361| TM:NTM 2 TM:REGION 10->32| TM:REGION 168->190| SEG 11->32|iltvkkhllltvitvllvfttt| SEG 181->187|lilllil| SEG 386->396|aaiqaamagea| SEG 480->489|aakqqaaaaa| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 253->534|2ch7A|4e-16|26.3|281/309| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 240->535|2ch7A|2e-42|23.0|296/309| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 327->535|PF00015|7e-27|41.6|209/210|MCPsignal| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 326->535|PF00015|4.6e-53|37.6|210/213|MCPsignal| HM:PFM:REP 255->359|PF02181|0.00022|14.7|102/371|FH2| HM:PFM:REP 58->171|PF09820|0.00018|16.8|113/284|AAA-ATPase_like| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0004871|"GO:signal transducer activity"|PF00015|IPR004089| GO:PFM GO:0007165|"GO:signal transduction"|PF00015|IPR004089| GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF00015|IPR004089| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 284->535|3cmnA1|2e-28|8.0|251/294|d.92.1.16| HM:SCP:REP 227->535|2ch7B1|5.5e-72|43.3|291/0|h.4.5.1|1/1|Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signaling domain| OP:NHOMO 6537 OP:NHOMOORG 537 OP:PATTERN -----------------------2HEFC-34D---3--4664444-2I-1112-4-4-33-------- -312------------------------------------3---I---7-------------5-D---------------1---7222--------------------A-------------------------2-12233---1475858812222------333-3363--------------3-----3G8DDDDDDAIDD9CEEC7CBADACDC564d78B111111OF------------------------------------------------------------------------------------------7LJVmMMMMNNMJLTG-ONF---NHE--A8AI3VUDIA6HD9535863--4B-9EE7-----41QYg328KXLKb------------3282215C11--HJJeQQIPTS88c-8-7-1-58556E---------9763-tLd------------------------------13--387546HDECDFjFBDEAAMNGGGG8GCKO8IAF--BBFG8OA9O14J62BGG668AaO-------3211GIEDC6L2DSGifQPa3SMSRHPNDJ6775L521B423-3223231422221228B75---bO-CJBLD8C-OaZYYGKIVQRZLLHJYWN--115BD------BNce7HC4443433344-4434433434434444443---VY228766577777665755762423333--C56676767776---1---------21XDg---------------111111-1118BOOMMTdWlORPQUUjij---------BEdaVfeefeLSUklA8IFKFH7981111--TeJJ555522122222E1--------------------------4-B6B66756-2- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----2---------31----------2--3-----2---- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 328 STR:RPRED 61.1 SQ:SECSTR #################################################################################################################################################################################################################HHcEEEcccTTccccHHHHHHHHHHHHHHHcTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT DISOP:02AL 1-4, 69-81, 93-113, 130-145, 164-169, 262-296, 308-343, 347-364, 416-417, 435-457, 480-490, 501-526| PSIPRED ccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccc //