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Nitrosococcus oceani ATCC 19707 (noce0)
Gene : ABA56781.1
DDBJ      :             Fimbrial assembly protein pilQ precursor
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  446/915 : Eukaryota  3/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.102.1
:699 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   283->360 2a02A PDBj 2e-12 25.6 %
:RPS:SCOP  594->695 2nvpA1  a.102.1.8 * 2e-11 17.3 %
:RPS:PFM   61->127 PF11741 * AMIN 1e-04 33.3 %
:RPS:PFM   313->355 PF07660 * STN 4e-04 41.9 %
:RPS:PFM   385->445 PF03958 * Secretin_N 2e-05 37.7 %
:RPS:PFM   544->693 PF00263 * Secretin 3e-27 44.7 %
:HMM:PFM   539->694 PF00263 * Secretin 2.7e-47 39.7 156/166  
:HMM:PFM   308->354 PF07660 * STN 3.8e-13 38.3 47/52  
:HMM:PFM   382->445 PF03958 * Secretin_N 2.3e-13 35.9 64/83  
:HMM:PFM   41->127 PF11741 * AMIN 4.2e-09 22.4 85/115  
:HMM:PFM   163->264 PF11741 * AMIN 6.6e-05 21.0 100/115  
:BLT:SWISS 47->697 PILQ_PSEAE e-147 48.7 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ABA56781.1 GT:GENE ABA56781.1 GT:PRODUCT Fimbrial assembly protein pilQ precursor GT:DATABASE GIB00281CH01 GT:ORG noce0 GB:ACCESSION GIB00281CH01 GB:LOCATION 276042..278141 GB:FROM 276042 GB:TO 278141 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT Fimbrial assembly protein pilQ precursor GB:PROTEIN_ID ABA56781.1 GB:DB_XREF GI:76882100 InterPro:IPR001775 InterPro:IPR004846 InterPro:IPR005644 InterPro:IPR011662 LENGTH 699 SQ:AASEQ 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-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2------------------------1-----1---- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 78 STR:RPRED 11.2 SQ:SECSTR 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