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Nitrosococcus oceani ATCC 19707 (noce0)
Gene : ABA57343.1
DDBJ      :             Alpha amylase, catalytic region
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  28/68 : Bacteria  625/915 : Eukaryota  138/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.71.1c.1.8
:1104 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   16->502 2ze0A PDBj 2e-69 38.8 %
:BLT:PDB   915->975 2pupB PDBj 2e-04 32.8 %
:RPS:PDB   13->552 3czkA PDBj 2e-90 23.9 %
:RPS:SCOP  14->468 1m53A2  c.1.8.1 * 6e-83 33.8 %
:RPS:SCOP  473->552 1g5aA1  b.71.1.1 * 6e-19 26.0 %
:HMM:SCOP  12->468 1m53A2 c.1.8.1 * 3.8e-127 39.7 %
:HMM:SCOP  472->551 1g5aA1 b.71.1.1 * 1.5e-19 49.3 %
:RPS:PFM   46->392 PF00128 * Alpha-amylase 8e-48 42.9 %
:HMM:PFM   39->392 PF00128 * Alpha-amylase 3e-73 35.5 304/316  
:BLT:SWISS 12->551 TRES_PIMSR 0.0 61.8 %
:BLT:SWISS 898->975 MTNK_GEOKA 3e-04 28.2 %

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABA57343.1 GT:GENE ABA57343.1 GT:PRODUCT Alpha amylase, catalytic region GT:DATABASE GIB00281CH01 GT:ORG noce0 GB:ACCESSION GIB00281CH01 GB:LOCATION 907053..910367 GB:FROM 907053 GB:TO 910367 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT Alpha amylase, catalytic region GB:PROTEIN_ID ABA57343.1 GB:DB_XREF GI:76882662 InterPro:IPR006047 InterPro:IPR006589 LENGTH 1104 SQ:AASEQ 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----112-------1545426556252-------------------1223587634222323-22-2441--3-5575A6-2222513-3-1433231321-1--1--2-6111111--11111111119E1-11511-1111111111-11111112124639536BAGG12351--2A---11-111421--1---- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 628 STR:RPRED 56.9 SQ:SECSTR 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DISOP:02AL 561-562, 1016-1020, 1100-1104| PSIPRED ccccccccccccccccHHccEEEEEEccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccEEEEcccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEEcccccccccHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEcccccHHHHHHHHcccccccEEEccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEccccccccHHccccHHHHcccccccccEEEcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEEEccccEEEEEEEccccEEEEEEEcccccEEEEEcccccccEEEEEEcccccccccccccEEEEEcccEEEEEEEccccccccccccccccccccEEEEEccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccEEEEEEcccccccEEEEEEEEccccccEEEEEEEEEcccccccccHHHHHHHEEEEEEcccEEEEEEEccccHHHHHHHHHHHcccEEEccccEEEEEEccccccccccccccccccccccccccEEEEccEEEEEEEEEEcccccccEEHHHHHHHHcccccccHHcEEEEEccccccEEEHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEcccccEEEEEEcccEEEEEEcccccccHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHcccccc 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