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Nitrosococcus oceani ATCC 19707 (noce0)
Gene : ABA57432.1
DDBJ      :             Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-like
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  11/68 : Bacteria  154/915 : Eukaryota  6/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.69.7c.37.1c.52.1
:1622 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   1079->1352 2wjyA PDBj 4e-05 28.2 %
:RPS:PDB   360->441 1eg7B PDBj 1e-05 15.2 %
:RPS:PDB   931->1316 3d3xB PDBj 6e-14 6.6 %
:RPS:PDB   1530->1577 1dixA PDBj 9e-05 26.7 %
:RPS:SCOP  380->458 1w36D1  c.37.1.19 * 1e-06 25.3 %
:RPS:SCOP  1079->1350 1ve6A1  b.69.7.2 * 2e-18 9.2 %
:RPS:SCOP  1387->1485 1cw0A  c.52.1.15 * 3e-10 25.8 %
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:HMM:PFM   406->458 PF05127 * DUF699 2.9e-05 32.1 53/174  
:BLT:SWISS 240->338 AAAP_ANAMV 4e-04 32.6 %
:BLT:SWISS 366->426 Y4399_DICDI 1e-04 39.3 %
:BLT:SWISS 1059->1338 Y140_MYCGE 4e-22 34.5 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ABA57432.1 GT:GENE ABA57432.1 GT:PRODUCT Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-like GT:DATABASE GIB00281CH01 GT:ORG noce0 GB:ACCESSION GIB00281CH01 GB:LOCATION complement(1013198..1018066) GB:FROM 1013198 GB:TO 1018066 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-like GB:PROTEIN_ID ABA57432.1 GB:DB_XREF GI:76882751 LENGTH 1622 SQ:AASEQ 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1------------------------1-------1-1--21-322----------------1-----2---1-----------------1111--------1----111-----------------11-21-1-----------------1----------------------1------------------1----------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------1-1-1111111-1---111----1----1--1-------1-------1-------------11133-1--11-1------------11-1---1---1-----1-11--------1----1----1-111111-------1----------------------------------11----111-11--------1-----------------------1111---------------------1--------1----1-1-----1------1---1---------------------1----1-------------121-111-12111--1-----1--1------1-----------111-----------11-1-----------------------------------11-1-----------1----------------11---------------------1-------1111-11-21------1------------------------1--1-1----------1-----------------1-------1-2-11222111111222-------1----- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------2-------------------------------1-------------------------------1---1-----1 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 621 STR:RPRED 38.3 SQ:SECSTR 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DISOP:02AL 1-3, 463-478, 489-502, 524-533, 1033-1042, 1210-1219, 1371-1384, 1495-1500, 1528-1540, 1619-1622| PSIPRED ccccEEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEccccccEEEEccccHHHHHccHHHHHHccccccccccHHHHHHHccccccccccccccccHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEEEEEEEccccccEEEEEEEEEcEEEEEccccEEEEEEcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccHHHHEEcccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHccccccccccccccccHHHHccccHHHHccccccHHHHHHHHHHHccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEccHHHHHHHHHHHHHccHHEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHccccccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHcccHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEcHHHHHHHcccccccccEEEEEccccccHHHHHHHHcccEEEEEccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccEEEEEccccEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccEEEccHHHcccccccEEEEEEEEcccccccccHHccccccHHHHHHHHHccEEEEEcccHHHHcccHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEcccccEEEEEEEEcccEEEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEcHHHHccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHHcccccHHHHHHccccccccccccccccccccHHHccHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHcccc 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