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Nitrosococcus oceani ATCC 19707 (noce0)
Gene : ABA57619.1
DDBJ      :             Proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  40/68 : Bacteria  670/915 : Eukaryota  23/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:481 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   223->431 2c1wA PDBj 1e-13 9.5 %
:RPS:PFM   120->396 PF00361 * Oxidored_q1 6e-11 31.6 %
:HMM:PFM   120->395 PF00361 * Oxidored_q1 6e-62 33.6 268/270  
:BLT:SWISS 30->431 NUON_ERWT9 8e-89 48.1 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABA57619.1 GT:GENE ABA57619.1 GT:PRODUCT Proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N GT:DATABASE GIB00281CH01 GT:ORG noce0 GB:ACCESSION GIB00281CH01 GB:LOCATION complement(1215603..1217048) GB:FROM 1215603 GB:TO 1217048 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT Proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N GB:PROTEIN_ID ABA57619.1 GB:DB_XREF GI:76882938 InterPro:IPR001750 InterPro:IPR010096 LENGTH 481 SQ:AASEQ MSSLDFTALLPLILITLASLTLTLIVAGYRQHRLTMVATLIALVLCLAVIPLAAAVSPQHVPPLFIIDRYALFYMGLIFTAALAITLLAYGYMKGLVDQPEEFYVLLLLASLGAAILAASNHFASLFLGLEILSVSLFALLAYPRRFQLSLEAGVKYLILSSASSALLLFGMALIYAETGALGFGQLSTLLSTGALSSEIFFLAGLALIMTGLGFKLSWVPFHLWAADVYQGAPAPVTAFLATVSKGAVFALLLRLFVQVDGPQHHTLIVLLSFIAVATILAGNLLALLQNNIKRILAYSSIAHLGYLLVALLASGNLGVEAVTFYWVAYFIMNLGAFGVVTVLSSPTQEKENLEDYRGLFWHRPGLAGIFTFMLLSLAGIPLTVGFIGKFYIFAAGVEATLWLLLFTFVMGSILGLFYYLRIIIALYQTPTIEKEALASPSSLPLMGSLTLALLTLLLIWWGVYPDPLMRIIQAVAMALI GT:EXON 1|1-481:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 30->431|NUON_ERWT9|8e-89|48.1|401/485| TM:NTM 13 TM:REGION 5->27| TM:REGION 34->56| TM:REGION 65->87| TM:REGION 111->133| TM:REGION 155->177| TM:REGION 194->216| TM:REGION 237->259| TM:REGION 268->290| TM:REGION 298->320| TM:REGION 325->346| TM:REGION 363->385| TM:REGION 401->423| TM:REGION 440->462| SEG 7->27|tallplilitlasltltliva| SEG 77->89|liftaalaitlla| SEG 106->119|llllaslgaailaa| SEG 160->169|lssassalll| SEG 187->198|lstllstgalss| SEG 278->292|atilagnllallqnn| SEG 444->459|lplmgsltlalltlll| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 223->431|2c1wA|1e-13|9.5|200/273| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 120->396|PF00361|6e-11|31.6|253/268|Oxidored_q1| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 120->395|PF00361|6e-62|33.6|268/270|Oxidored_q1| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0008137|"GO:NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity"|PF00361|IPR001750| GO:PFM GO:0042773|"GO:ATP synthesis coupled electron transport"|PF00361|IPR001750| GO:PFM GO:0055114|"GO:oxidation reduction"|PF00361|IPR001750| OP:NHOMO 1768 OP:NHOMOORG 733 OP:PATTERN 112-212-------1-3-1-2-1133333443-------------1-112422-42244853112-22 434132-2111---11111-12--121111112232222211111211311-112111--22111213332-----------32312311112---1--2-22--33522--------------1532335532633444422263432644765453343334333556322222222212211111--2-31222222222222222422221222433242122211122-222122222222221111------------------------------------------------------------------------3--3----------1--------2---3--124412--1242111----351222322233222223335443322222222223-33233234223232234564334422333234232232222222222333-42362233344443442222222222222333322222-344443333332222233333333233353332222222222222342233223322222222222344333-2-221-243--2-43424432B344315-2243333333333333233332433422112-2--1--1------32-----223-352--942311-22232322222222222222-2222222222222222222222222213333333333333333233222222-23333333333311243333233335112-----1----------222222323321333322325222242222222222223----11111-----33232332222222322-222222------------------------------------121111-11-361 ---------------------------1---111-2-----------1------121-------1----------------------------1---22------1---------1--------1-------------------------------------------1----1-1----------2-5-11------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 200 STR:RPRED 41.6 SQ:SECSTR ##############################################################################################################################################################################################################################cccccccccccccccEEEEcHHHHTTTcTHHHHHHH#########HHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHTTccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHTTcccccccccccccHHHHHHHHHTTcEEEEccccccccccTTccEEEEEEEETTcccccEEEEccccHHHHHHHHHHHHHTcc################################################## DISOP:02AL 481-482| PSIPRED ccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEccccEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcc //