[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Nitrosococcus oceani ATCC 19707 (noce0)
Gene : ABA57706.1
DDBJ      :             conserved hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  11/68 : Bacteria  230/915 : Eukaryota  1/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1d.115.1
:919 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   162->452 2w00B PDBj 7e-11 33.1 %
:RPS:PDB   162->260 1d9xA PDBj 1e-08 23.4 %
:RPS:SCOP  162->349 2fwrA2  c.37.1.19 * 3e-10 27.9 %
:RPS:SCOP  417->518 1k7jA  d.115.1.1 * 7e-04 20.8 %
:HMM:SCOP  107->381 1z3iX2 c.37.1.19 * 6.3e-39 24.4 %
:HMM:SCOP  310->553 2fwrA1 c.37.1.19 * 1.6e-13 18.2 %
:RPS:PFM   162->347 PF04851 * ResIII 4e-19 36.9 %
:RPS:PFM   592->918 PF12082 * DUF3559 1e-26 31.8 %
:HMM:PFM   575->919 PF12082 * DUF3559 9.5e-108 42.2 308/311  
:HMM:PFM   161->348 PF04851 * ResIII 4.6e-41 36.7 166/184  
:HMM:PFM   50->122 PF04313 * HSDR_N 2.4e-07 32.3 65/185  
:HMM:PFM   497->553 PF00271 * Helicase_C 0.00047 19.6 56/78  
:BLT:SWISS 9->914 T1RK_ECOLI 2e-50 28.5 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABA57706.1 GT:GENE ABA57706.1 GT:PRODUCT conserved hypothetical protein GT:DATABASE GIB00281CH01 GT:ORG noce0 GB:ACCESSION GIB00281CH01 GB:LOCATION complement(1312360..1315119) GB:FROM 1312360 GB:TO 1315119 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT conserved hypothetical protein GB:PROTEIN_ID ABA57706.1 GB:DB_XREF GI:76883025 InterPro:IPR006935 InterPro:IPR007409 InterPro:IPR011545 LENGTH 919 SQ:AASEQ MTSPNQHPEQVARNRIDLQLKAAGWVVQDSQALDFNAGPGLAVREYRTDAGPADYVLFVNRQAVGVIEAKPEAWGQRITTVEEQSTGYANATLKWVNNSAPLPFVYESTGIITRFTDGRDPKPRSREVFNFHRPESLAEWLTQSASLRARLHALPPLARVGLRDCQIGAIENLEASFKADRPRALVQMATGSGKTYTAITAGYRLLKHADAKRILFLVDTKNLGEQAEQEFMAFLPNDDNRKFTELYNVQRLKSSFVAQDSQVCISTIQRMYALLKDEPLDEAAEENHPAERRLKPKQSLPVVYNGKLPPEFFDFIIIDECHRSIYNLWRQVIEYFDAFLIGLTATPDNRTYGFFRKNVVSEYGHEQAVADGVNVGNEVYVIETERTRQGGTLKAHQQVEKRERLTRKRRWETQDEEQAYSAKQLDRDIVNPDQIRTVIRAFKGKLPEIFPGRNEVPKTLIFAKTDSHADDIIQTVREEFGEGNPFCKKVTYQAKEDPKSVLAQFRNDYYPRIAVTVDMIATGTDVKPLECLLFMRDVKSRNYFEQMKGRGTRTLDADSLRKVTPSATAAKTHYVIVDAIGVTQSLKTASQPLITKPSVSLKDLAMGVMMGARDEDTVSSLAGRLARLDKQLNDKDKARIREAAGGMTLTDMVGALVQAIDPDRIEEKTREFSGAGEPGHSEREKARDQLVGQAAQVFTGPLIALIEGIRRDKEQTLDHDNLDTLLRAGWAGDSTENAKALAQEFARYLSEHRDDIEALTLYFQTPARRAEVTYAMIKALLERLKQDRPKLAPLRVWQAYAHLDDYQGEHPISELTALVALIRRVCGLDPTLSTYAATVRRNFQHWIMQHHSGAGEKFNEAQMAWLRMIRDHIISSFHMEHDDLEMAPFDAQGGMGRMYQLFGDRMDEVIGELNRELVA GT:EXON 1|1-919:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 9->914|T1RK_ECOLI|2e-50|28.5|833/1188| SEG 144->159|saslrarlhalpplar| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 162->452|2w00B|7e-11|33.1|242/839| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 162->260|1d9xA|1e-08|23.4|94/590| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 162->347|PF04851|4e-19|36.9|160/177|ResIII| RP:PFM:REP 592->918|PF12082|1e-26|31.8|289/297|DUF3559| HM:PFM:NREP 4 HM:PFM:REP 575->919|PF12082|9.5e-108|42.2|308/311|DUF3559| HM:PFM:REP 161->348|PF04851|4.6e-41|36.7|166/184|ResIII| HM:PFM:REP 50->122|PF04313|2.4e-07|32.3|65/185|HSDR_N| HM:PFM:REP 497->553|PF00271|0.00047|19.6|56/78|Helicase_C| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0003677|"GO:DNA binding"|PF04851|IPR006935| GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF04851|IPR006935| GO:PFM GO:0016787|"GO:hydrolase activity"|PF04851|IPR006935| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 162->349|2fwrA2|3e-10|27.9|136/234|c.37.1.19| RP:SCP:REP 417->518|1k7jA|7e-04|20.8|101/206|d.115.1.1| HM:SCP:REP 107->381|1z3iX2|6.3e-39|24.4|242/0|c.37.1.19|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| HM:SCP:REP 310->553|2fwrA1|1.6e-13|18.2|176/0|c.37.1.19|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 305 OP:NHOMOORG 242 OP:PATTERN -------------1---------------------1---1---1--11-1413-------1------- -----1-----1-1-------2-----------2-21-----------------------------------111-1111---------111-----------1---------------------11212---2-1----1---2-2-1-111------------1-1211-----------------------------1----1-------------11--11-------1------1-11---11--1-1----11--12--111---1-----------------22222222221------------1-11---111--1---222-111-2----------------21------111------1--113---1---------1-2--1---------------------------------11-----2-11----11-11--------------------------------------------------------1----------------------1-1----1-11---11---1-2--2-1-1---------1--2----14---1--11---11-2--111---1------1-----1-1-1------------33--12------2-21-31--3-1--1--1-1---3--1---------31--11111111---1----11-111-1-11111---1111-1--1---12--1111-111-1-1-------1----112--------------111111---------1-1------------1--1------1-1-2---1----1------11-----11112-1-111-112------1---------------1------------1-------1-----------------2- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------ ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 388 STR:RPRED 42.2 SQ:SECSTR #################################################################################################################################################################ccTTHHHHHHHHHHHHHTTccEEEEEEcTTccHHHHccccHHHHHHHHHcccEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHcTTcEEEEEccGGGccccccEETTTTTccEEcEEEEEEccccccccTHHHHHHHHHHHHTTTcccEEEEEEcccTTcccEEEEEccccEEEEEEcccTTTccTcEEEEEEEEcTTccEEEEEEcEEEccTTTHHHcGGGGcccccEEEEcGGGGccccccccEEEEccEEcccccEEEEEEEEEccHHHHHHHHTTcccccccccccccccccTTcHHHHHHHHHHHTccccccccccccHHHH###TTccccTTTTcccHHHHHHHHHHHHTTcc#cHHHHHHHHHTTccTTccGGGTcccGGGcccccccccEEEcT############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 1-4| PSIPRED ccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccEEEEcccEEEEEccccccccEEEEEEEcccEEEEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEcccEEEEEccccccccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEccccHHHHHHccccccccEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEccccccHHHHHHHHccccccccHHHHHHcccccccEEEEEEHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEccccHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEccHHHccccccccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEcccccccccEEEEEcccHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcc //