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Nitrosococcus oceani ATCC 19707 (noce0)
Gene : ABA57780.1
DDBJ      :             NADH dehydrogenase (quinone)
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  64/68 : Bacteria  693/915 : Eukaryota  51/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.58.34
:499 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   222->466 2c1wA PDBj 2e-23 7.8 %
:RPS:SCOP  210->250 1qd1A2  d.58.34.1 * 1e-06 20.0 %
:RPS:PFM   129->399 PF00361 * Oxidored_q1 6e-28 39.2 %
:HMM:PFM   129->402 PF00361 * Oxidored_q1 1.5e-62 34.0 265/270  
:HMM:PFM   73->117 PF00662 * Oxidored_q1_N 1.3e-07 31.1 45/62  
:BLT:SWISS 78->399 NUOL_MYCTU 8e-39 34.0 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ABA57780.1 GT:GENE ABA57780.1 GT:PRODUCT NADH dehydrogenase (quinone) GT:DATABASE GIB00281CH01 GT:ORG noce0 GB:ACCESSION GIB00281CH01 GB:LOCATION complement(1421373..1422872) GB:FROM 1421373 GB:TO 1422872 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT NADH dehydrogenase (quinone) GB:PROTEIN_ID ABA57780.1 GB:DB_XREF GI:76883099 InterPro:IPR001750 InterPro:IPR003916 InterPro:IPR003918 LENGTH 499 SQ:AASEQ MNWSFWLPVLILLSSLGAGIVIFFLPQRAYRTRTTLNMAAATLKLLLVAALVWGVFHHQSYETRLPLLPEMDLLLRADTLSVLFITLSSILWFFTTLYAIGYLEASPHRSRFFGFFSLCVSATVGIALAGNLITFFIFYEMLTLSTYPLVTHRGTKKSLRAGKIYLGYTLMGGVLLLTGMAWLQTLAGPLSFTEGGLLAEAPPIDPQTLTIIFTLLIAGVGVKAALVPLHGWLPQAMVAPAPVSALLHAVAVVKAGAFGIVRIVDNVFGVEFVAKLGVAAPLAWLASFTIIYGSVRALFQDDLKRRLAYSTISQVSYIALGIALLNPVATIGAMAHLVHQGLMKITLFFCAGNLAQTLGIHRISEMAGVGRRMPWTMTAFTLGALGMIGVPPLAGFISKWYLGYGAVLAEAEWVLGILALSSVLNAAYFLPILYRAWFSPQKNPWPEETSRGRLETHWMLLLPPLITAAMALGAGLLAHAPFSPAEWARLIAVREYPSP GT:EXON 1|1-499:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 78->399|NUOL_MYCTU|8e-39|34.0|312/633| TM:NTM 12 TM:REGION 5->27| TM:REGION 36->58| TM:REGION 78->100| TM:REGION 120->142| TM:REGION 168->190| TM:REGION 207->229| TM:REGION 240->262| TM:REGION 275->297| TM:REGION 312->334| TM:REGION 375->397| TM:REGION 409->431| TM:REGION 458->480| SEG 39->51|aaatlklllvaal| SEG 65->75|lpllpemdlll| SEG 165->180|ylgytlmggvllltgm| SEG 468->480|aamalgagllaha| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 222->466|2c1wA|2e-23|7.8|232/273| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 129->399|PF00361|6e-28|39.2|260/268|Oxidored_q1| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 129->402|PF00361|1.5e-62|34.0|265/270|Oxidored_q1| HM:PFM:REP 73->117|PF00662|1.3e-07|31.1|45/62|Oxidored_q1_N| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0008137|"GO:NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity"|PF00361|IPR001750| GO:PFM GO:0042773|"GO:ATP synthesis coupled electron transport"|PF00361|IPR001750| GO:PFM GO:0055114|"GO:oxidation reduction"|PF00361|IPR001750| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 210->250|1qd1A2|1e-06|20.0|40/140|d.58.34.1| OP:NHOMO 3290 OP:NHOMOORG 808 OP:PATTERN 22425211222222319111111156667687-1-113111113121335746-744B4D54343-33 6673532533312253233-35--453333345565455543362524622-223242--67433555785--------41177834522333---2--3-222-66663--------------353353553365999A9666859A988887877565455B988999733443333333333411--2-5244444344344433442332244353644222222223324444444444444444445----------------------------------------------------------------------14--3----------3-------131--7--346653--234622411--6A6333444435545556636C76544444445444-444443544363477878B6449B57566676788856433333333955-457A4445466633554455444444444555533433-33334444444433335536545534447345522333224444457445555433332222222567536535-635-564226-7865A994M66764E-6245431211112322122223654766443-4-22-22------53-----333-562--E86813122233554437774744445-7777744776747577776444533344444444444444444454566573-533333333333133655554444482142----3----------555555533321444444435444454443333333335----33323-----44546445553333334-333333------------------------------------232222-2215C2 ---------------------------111-11111-------21--1------241-----2-2----------------------------1---22------3------21222-----2-31-2-11--12-----2--22--------1-1------21-1121-1--2-1----------2-6-12------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 232 STR:RPRED 46.5 SQ:SECSTR #############################################################################################################################################################################################################################ccTTTEEEccccccccccccccEEEEcHHHHTTTcTHHHHHHHHHHH#############HHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHTTccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHTcccccccccccccHHHHHHHTTcEEEEEEccccccccccTTccEEEEEEEETTcccccEEEEccccHHHHHHHHHHHHHTccccEEEEEEEETTEEEEEEEEEETTEE################################# DISOP:02AL 443-453, 495-499| PSIPRED ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHEEEcccccc //