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Nitrosococcus oceani ATCC 19707 (noce0)
Gene : ABA58618.1
DDBJ      :             Flagellar biosynthesis protein FlhA
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  500/915 : Eukaryota  3/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.4.5
:690 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   421->607 1bvoA PDBj 9e-37 16.1 %
:RPS:SCOP  497->588 1w7pD2  a.4.5.54 * 4e-16 15.4 %
:RPS:PFM   46->682 PF00771 * FHIPEP 0.0 53.0 %
:HMM:PFM   27->682 PF00771 * FHIPEP 2.1e-276 56.2 653/658  
:BLT:SWISS 47->689 FLHA_PROMI e-159 53.0 %
:PROS 143->166|PS00994|FHIPEP
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ABA58618.1 GT:GENE ABA58618.1 GT:PRODUCT Flagellar biosynthesis protein FlhA GT:DATABASE GIB00281CH01 GT:ORG noce0 GB:ACCESSION GIB00281CH01 GB:LOCATION complement(2492619..2494691) GB:FROM 2492619 GB:TO 2494691 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT Flagellar biosynthesis protein FlhA GB:PROTEIN_ID ABA58618.1 GB:DB_XREF GI:76883937 InterPro:IPR001712 InterPro:IPR006301 LENGTH 690 SQ:AASEQ MNTAAVRGHLREVGRNGLGAPLLLLLMLAMMVLPLPAALLDLLFTFNISLALVVLLAGVYARRPLDFSSFPTILLLATLMRLALNVASTRVVLLEGHTGSDAAGKVIQAFGEFVIGGNYAVGLVVFFILVLINFVVVTKGATRISEVSARFTLDAMPGKQMAIDADLNAGLIDQEEARLRREEVMQEADFYGSMDGAGKFVRGDAIAGILILLINVAGGLAVGLLQHDLSFSEAARNYTLLTIGDGLVAQIPSLVLSTAAGILVTRVSHAQDMGSQILAQLFKNPKSLAVVAVVLGSMGLIPGMPNLAFLGLALLCGFGVWWLGKRQKAEVAPTPPMAAPSETPELSWEDIPPVDPIGLEVGYRLIPLVDKTQGGQLMGRIKGVRKKLSQDWGFLIPPVHIRDNLNLAPIAYRITLFGVTVGEAEVFPEREMAINPGQVFGKVEGTPAQDPAFGLEALWIEPAQREQAQMHGYTVVDAGTVIATHLSQILQNHAHGLLGREEVQKLLENLAKTAPKLVEGLVPEILPLSIVQKVLQQLLEEGVPIRDMRTIVESLTEHGLRSQDPAILTAIIRIALGRFIIQCFNGLEKELQVISIAPALEQLLLASLQTASEGGGLNMEPGLAEKLHLTLRDSVQRQEAAGKPAILLVQGVLRPWLARFVRHAIPELKVLSYNEIPEDKQVRIVASVGS GT:EXON 1|1-690:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 47->689|FLHA_PROMI|e-159|53.0|638/696| PROS 143->166|PS00994|FHIPEP|PDOC00763| TM:NTM 6 TM:REGION 28->50| TM:REGION 70->92| TM:REGION 114->136| TM:REGION 204->226| TM:REGION 245->267| TM:REGION 291->313| SEG 18->43|lgaplllllmlammvlplpaalldll| SEG 50->57|lalvvlla| SEG 74->84|lllatlmrlal| SEG 121->137|vglvvffilvlinfvvv| SEG 203->221|gdaiagilillinvaggla| SEG 307->319|laflglallcgfg| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 421->607|1bvoA|9e-37|16.1|168/175| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 46->682|PF00771|0.0|53.0|632/656|FHIPEP| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 27->682|PF00771|2.1e-276|56.2|653/658|FHIPEP| GO:PFM:NREP 2 GO:PFM GO:0009306|"GO:protein secretion"|PF00771|IPR001712| GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF00771|IPR001712| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 497->588|1w7pD2|4e-16|15.4|91/117|a.4.5.54| OP:NHOMO 747 OP:NHOMOORG 503 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 1111------------------------------------1---1---1----1--------1-1------------------11111--------------------1-222222222222221--------------------1---------------------------------------------11111111-111111111111111111111111111111111------------------------------------------------------------------------------------------12111111111111111111---111--111111111111111111-1--11111111----1131111112112--11--11111-2222212222112111223111111-1111112222111--------1111-121--------------------------------111121123222532333122214445141222111--112112111--121111211141-------111111111-1111111222211111111122122-1-1111-1111111111111111111---13-111111111312131211121122221---11-111111121122131442122222-4212222222423221112---2132233233333333333331111211241333345524343--2------1111--411-------------------------1122121111311111232---------1111211111341111122222223------111111111111111111--------------------------1-11111111-1- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1--------------1---------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 293 STR:RPRED 42.5 SQ:SECSTR ################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHTccccccccccccGGGcEEEEcTTTccEEEEEEccTTEEEEEcccccEEEEEEETTEEEccEEETTEEEEEEGGGTEEEEccccccTTcE#EEEcccTTccccccGGGcccccccccTTcccccccccEEEEEEccccccccEcccccEEEEEEEccccTTccccccEEEcTTTEETTEEEEccHHHEccTTTcEEEccccEEEcccHHHHHHHHHHHHHHTccTTccTTGGGTcGGGccTTEEEEEEEEEEEcccTTcEcHHHEEEcccEEcccEEccGGGcHHH############################################################################ DISOP:02AL 1-4, 175-187, 324-354, 607-617| PSIPRED cccHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEccccHHHHHHHHHHHHccccccEEEHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHccEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHccccccccccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEcccccccEEEEEEEEEEEEEEEEEcccEEEEcccccccccccEEccccccccccccccHHHHHHHHHcccEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEcHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEccccccEEEEEEEEcc //