[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Nitrosococcus oceani ATCC 19707 (noce0)
Gene : ABA59006.1
DDBJ      :             Proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  57/68 : Bacteria  689/915 : Eukaryota  56/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:504 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:RPS:PDB   216->445 2c1wA PDBj 3e-21 11.0 %
:RPS:PFM   33->121 PF01059 * Oxidored_q5_N 2e-04 32.9 %
:RPS:PFM   135->410 PF00361 * Oxidored_q1 2e-23 36.8 %
:HMM:PFM   132->412 PF00361 * Oxidored_q1 5.6e-73 34.5 267/270  
:HMM:PFM   48->123 PF01059 * Oxidored_q5_N 3.2e-08 23.7 76/110  
:BLT:SWISS 7->462 NQO13_PARDE e-117 49.7 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABA59006.1 GT:GENE ABA59006.1 GT:PRODUCT Proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M GT:DATABASE GIB00281CH01 GT:ORG noce0 GB:ACCESSION GIB00281CH01 GB:LOCATION complement(2903760..2905274) GB:FROM 2903760 GB:TO 2905274 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT Proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M GB:PROTEIN_ID ABA59006.1 GB:DB_XREF GI:76884325 InterPro:IPR001750 InterPro:IPR003918 InterPro:IPR010227 LENGTH 504 SQ:AASEQ MLTGLPLLSLVIWLPILGGFLVLAVGNHVERVRWLSLGVSGLTFVVSWSLYTGFDISTATMQFQEKLSWVEAFDVYYHLGIDGISMPLIILTTFSTVLVVIAGWRVIEHKLAQYMASFLIMEGLMNGVFAALDAVLFYFFFEGMLIPLFLIIGIWGGPNRIYATLKFFLYTFLGSVFFLLALLYLRSVTGGFSILEFHQVPLDMQAQIGIFLAFLLAFAVKVPMWPVHTWLPDAHVEAPTGGSVILAAITLKIGAYGFMRFSLPITPDASMALNWLIITLSLIAVVYIGLVAIVQEDLKKLIAYSSIAHMGFVTLGLFIAFAIFSQGVEGDGALLGLEGALVQMISHGLVSAAMFLCVGVLYDRLHTRLIKDYGGVVNKMPIFASFMVLFAMANVGLPGTSGFVGEFLVILGAFQADFWYAFFASMTLILGATYTLWMVKRVVFGDIANDKVATMEDLNSREFLVLGTLAAAVLLLGVWPQPLLEVMHTSLENLLSQMAASKLV GT:EXON 1|1-504:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 7->462|NQO13_PARDE|e-117|49.7|441/513| TM:NTM 13 TM:REGION 3->25| TM:REGION 33->55| TM:REGION 84->106| TM:REGION 124->146| TM:REGION 167->189| TM:REGION 204->226| TM:REGION 242->264| TM:REGION 273->295| TM:REGION 303->325| TM:REGION 337->359| TM:REGION 373->395| TM:REGION 418->439| TM:REGION 459->481| SEG 327->342|gvegdgallglegalv| SEG 464->478|lvlgtlaaavlllgv| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 216->445|2c1wA|3e-21|11.0|210/273| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 33->121|PF01059|2e-04|32.9|79/108|Oxidored_q5_N| RP:PFM:REP 135->410|PF00361|2e-23|36.8|253/268|Oxidored_q1| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 132->412|PF00361|5.6e-73|34.5|267/270|Oxidored_q1| HM:PFM:REP 48->123|PF01059|3.2e-08|23.7|76/110|Oxidored_q5_N| GO:PFM:NREP 7 GO:PFM GO:0005739|"GO:mitochondrion"|PF01059|IPR000260| GO:PFM GO:0006120|"GO:mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone"|PF01059|IPR000260| GO:PFM GO:0008137|"GO:NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity"|PF01059|IPR000260| GO:PFM GO:0055114|"GO:oxidation reduction"|PF01059|IPR000260| GO:PFM GO:0008137|"GO:NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity"|PF00361|IPR001750| GO:PFM GO:0042773|"GO:ATP synthesis coupled electron transport"|PF00361|IPR001750| GO:PFM GO:0055114|"GO:oxidation reduction"|PF00361|IPR001750| OP:NHOMO 2910 OP:NHOMOORG 802 OP:PATTERN 22425131333333317112122155554584---111-----3-11335735-744A4C56243-33 6452332533311133233-34--443333334454354432331423522-112222--56433633584--------41166823522322---2--3-312-65533--------------3533535533659885566564898788957883444459987A99733333333334332422--3-5244444334334433442332233352544222222223214444444444444443343----------------------------------------------------------------------14--3----------3-------13---3--226553--233511411--5A3222433223444334545A66644444444443-22222234326343345695339855445445455534422222222744-45584456555533444444444444444455433313-34444444444433334435545534447456522222233444456335564333332222222346526434-533-455225-86855682L556528-6255432222232322122223664656443-3-12--1------43-----333-553--C66523122233453436663633334-6666633665636566666444433343333333333333333344555563-33333333333323365555433338112-----3----------555555432331333322334222243333333333333----11111-----43434334443333334-333333------------------------------------132111-11-5B2 --------------1--1---------21--11222-------21--2------352-1---1-1-------1-----------1--------2---11------3------21223-----2-31-2-25--22-----2--22--------2-2---1--11-1121-2-13-2----------1-4--2------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 210 STR:RPRED 41.7 SQ:SECSTR #######################################################################################################################################################################################################################TTccccTTTEEEcccccccccccccccEEEEcHHHHTTTcTHHHHHHH#########HHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHTTcccccHH###########HHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHTTccccccccccccHHHHHHHTTcEEEEEEccccccccccTTccEEEEEEEETTcccccEEEEccccHHHHHHHHHHHHHT########################################################### PSIPRED cccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHccccccHHHHHHHHHHHHcc //