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Nitrosococcus oceani ATCC 19707 (noce0)
Gene : ABA59125.1
DDBJ      :             DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  8/68 : Bacteria  549/915 : Eukaryota  1/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.157.1
:784 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   542->615 2p4zB PDBj 1e-04 34.3 %
:RPS:PDB   530->773 3bk1A PDBj 6e-17 13.5 %
:RPS:SCOP  534->759 1wraA1  d.157.1.8 * 7e-27 15.5 %
:HMM:SCOP  527->780 2bibA2 d.157.1.8 * 1e-47 25.9 %
:RPS:PFM   220->476 PF03772 * Competence 4e-24 40.4 %
:HMM:PFM   220->504 PF03772 * Competence 3.1e-75 42.5 268/271  
:HMM:PFM   540->708 PF00753 * Lactamase_B 1.3e-14 16.8 161/194  
:BLT:SWISS 136->759 YCAI_ECOLI 3e-42 27.6 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABA59125.1 GT:GENE ABA59125.1 GT:PRODUCT DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2 GT:DATABASE GIB00281CH01 GT:ORG noce0 GB:ACCESSION GIB00281CH01 GB:LOCATION 3026909..3029263 GB:FROM 3026909 GB:TO 3029263 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2 GB:PROTEIN_ID ABA59125.1 GB:DB_XREF GI:76884444 InterPro:IPR001279 InterPro:IPR004477 InterPro:IPR004797 LENGTH 784 SQ:AASEQ MTRVPNMLLNALAFLTGIVILQQLPLLPDPTWSLLLLGLLPWTLFQQRLRPLLLLVIGFLWALFRADLLLSQELPLALEGQDILLEGTVASIPEVLDHRLRFAFAPQRIIFKSQTWHGPKRVRLSWYRHPLFKLKAGDRWQLLVRLKRPRGFMNPGGFDYEGWLFRQGFRATGYVRSATTNRLIESHWYHHPLDRARQYLLEHMVPLLADSPQRGLVQALTLGERGAITPQQWQVLERTGTNHLVAISGLHIGLLAGIAYFLGRRLWSLRAANILTLPASQAAAVSAIISALFYAALAGFSIPTQRALIMVSVVMLAVLAKRPIHTSRALAFALILVLLWDPLSVLSPGFWLSFGAVAVLTFGLTGQRPLPGTKTPGFSSLSSYLEHFWRRWGKAQWVVAIGLAPILLYQFQRLSLIAPVTNLVAVPWMGFLVVPPLLLGTILLIPFPLLGTALISLGDYLLALLWNILAWCSTLPVAQWEHAGPPLWALLPAILGSLLLLAPRGLPGRWLGLLALLPLLLTSSPRPSYGTLWFTLLDVGQGLAAVVRTHHHTLVFDAGPRYSERFNTGEAVVAPFLRSQNINTIDTLVVSHGDNDHIGGVAGLLHHFPAKRILTSAPEQLRWLHPKSCARGQQWRWDGVYFHILHPQSTVGRGNNHSCVLLITSGAQRILIAADIERSAEQTLLTATTDGLAATILVVPHHGSLTSSSPPFIAAVNPEHALFSAGYRNRWGFPKSAIVQRYLRQGTKLWSTAQHGAITFHLDQNPLSKPETFRQSNRHYWTGN GT:EXON 1|1-784:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 136->759|YCAI_ECOLI|3e-42|27.6|586/754| TM:NTM 11 TM:REGION 4->26| TM:REGION 29->48| TM:REGION 50->72| TM:REGION 242->263| TM:REGION 275->297| TM:REGION 312->334| 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111---------------------------------------1---------------11----1-1-1---------1---1--1--11-1--11--------1--111---------------1-111-------111211111-------------------------------------2-1------1133333223233322312111123221122212222221--111111-1111111-11-11111111-1111111111-11-----1111111111111111111111111-1111-111-11111111-231---------21211222---2321-1111122221223111122--11-1----1111111--1-11-11-1----------1-11111111111--11111111111111-11111111111--------1----1111111-11-1111-------------1-11----1111--1111111111111111111111111111111111111-11111112121111111111111111111-111111-11111-111-11111111111111-------------------------11111111111111111111111111111111---1121------1111111111111111--111111111111111111111111111111-111111-111--1111---1--111111111111--11-----1111111111111111111-1111-1111-1111111111-1111111111-11-1--111-11111111111111111111111111111--1-----------------1--------1----------------------------1 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