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Pyrobaculum aerophilum str. IM2 (paer1)
Gene : AAL63966.1
DDBJ      :             paREP2b
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  2/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.264.1
:991 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   789->879 3dmdA PDBj 5e-04 18.0 %
:RPS:SCOP  825->988 1g71A  d.264.1.1 * 2e-14 14.7 %
:RPS:PFM   529->718 PF07775 * PaRep2b 5e-64 71.8 %
:RPS:PFM   763->968 PF07775 * PaRep2b 4e-51 59.2 %
:HMM:PFM   468->982 PF07775 * PaRep2b 2.4e-268 70.3 512/512  
:HMM:PFM   260->357 PF06545 * DUF1116 0.00087 28.3 92/216  
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAL63966.1 GT:GENE AAL63966.1 GT:PRODUCT paREP2b GT:DATABASE GIB00076CH01 GT:ORG paer1 GB:ACCESSION GIB00076CH01 GB:LOCATION 1252640..1255615 GB:FROM 1252640 GB:TO 1255615 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT paREP2b GB:NOTE Hypothetical; Conserved within genome GB:PROTEIN_ID AAL63966.1 GB:DB_XREF GI:18160626 LENGTH 991 SQ:AASEQ MATENVIRLAEATRDDLPKIDATRGERTVTALLSLVTGGLFGVTVERALAERGKWTVGALGIASAVRSTPSNFYNAFSSVSGDEKPSEAKKLTFRIATLLADPAMREILAGRQGVEVRVEQKTENGKKYIYITFVDKDGHELLKAPWDADRGLMPLWAEGEVVELFKEVGKLAVAVSSGSKPLEELNEEEWKKVVETVRRVKKAIEWTVKAVAIGALPTDAVLLPGSEYVRGTSSYLSQTFTYWALAKDRIGLVRVYPSEEGLKPMWRVEGKYTEAVREVLSVSRAVFENLLTPNKQSEGGVDLKVALTDVKMNDELKKALETAAGEFWERVNELLALWKQLEEEAKEKKDEERKKVVMEVDKLGKYLRVLLPLAYAVEARKMGELSREEAALAVIFAVLYDGTVFRDEILLFIGGPEHVESPIMTRDHFTAFWLWALKELGLKPSSVYRGRGAHHIAFKGAELNGLLEAVTPALPALHELRDALTEFADAFKVVTREAVKRKFGIDWGYDVRNEMFFKKLEEVVTMAEDYVYRNVTVERDQLDTSGQLPKTVIRFKLGGEEVAYITVYWTGSKLLAQFDGSREKAEQLASIITALGGKAEVKPKNAKWTVHLHTDGIIAIRHDSWLNAVKGFVDELYSKGLISEDRYEQLVRDIATGPNTVNYAGVEFSVYHKTEGKYDFLEIRYHPGNEASKNAVVNALKARGLKEGVHFTVKEYGDYEIHVAVESYTKALEALARSWLRKGEYYAIDDRKRVISVKAEHKDAVVNTLKTAGLEEDRHFTVKWDGYYVIRITYEGLREIQRMALNGDVEAERFIRELEDVLRRRHGQNAVKRLIEVLTPAREEGTIDLPLEVRDERGNVVARVVDLRYEFVMGDQPVGQCAGEDCRLRIIVEYETEGERRQLKIVCYWVKKQKEKGNATVTYYYEAAWSRVKNDVEAAVLKALTGKAKRGRVQLFSSDLDTLYRFKALKDAVDKWRGGKPQSVVQRRGI GT:EXON 1|1-991:0| COIL:NAA 31 COIL:NSEG 1 COIL:REGION 325->355| SEG 188->203|eeewkkvvetvrrvkk| SEG 334->363|ellalwkqleeeakekkdeerkkvvmevdk| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 789->879|3dmdA|5e-04|18.0|89/310| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 529->718|PF07775|5e-64|71.8|181/326|PaRep2b| RP:PFM:REP 763->968|PF07775|4e-51|59.2|168/326|PaRep2b| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 468->982|PF07775|2.4e-268|70.3|512/512|PaRep2b| HM:PFM:REP 260->357|PF06545|0.00087|28.3|92/216|DUF1116| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 825->988|1g71A|2e-14|14.7|163/344|d.264.1.1| OP:NHOMO 32 OP:NHOMOORG 2 OP:PATTERN ------------------Q6------------------------------------------------ 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DISOP:02AL 1-2, 78-90, 183-187, 980-991| PSIPRED ccHHHHHHHHHccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHccccEEEccHHccccEEEEEEEcccccHHHHccccccccccEEEEEccHHHHHHHHHHHHEEEcccccHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEccEEEEEccEEEEcccHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEccccccccEEEEcEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHEEEEEEHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEccccccEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEEEEEEcccEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEccccEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHEEcccHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEEccccccccEEEEEEEEccEEEEEEEEEEEccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEEccEEEEEEEEcEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEEEEEEEccccccEEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHccHHcccEEEEEEccccEEEEccEEHHHHHHHHHHHHHcccccEEEcccEEEEEEEcccHHHHHHHHHHccHHHHHHHEEEEccEEEEEEccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHcccccHHcccccccEEEcccccEEEEEEEEEEEEEEccEEccccccccccEEEEEEEEccccEEEEEEEEEEEEEccccEEEEEEEEEEEEEEEEccHHHHHHHHHHcccccccEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccc //