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Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 (pubi0)
Gene : AAZ21747.1
DDBJ      :             Peptidase M50
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  45/915 : Eukaryota  1/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.84.1c.66.1f.46.1
:700 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   436->488 2dneA PDBj 8e-05 15.6 %
:RPS:SCOP  201->358 2o57A1  c.66.1.18 * 4e-05 10.7 %
:RPS:SCOP  430->477 1ghjA  b.84.1.1 * 2e-04 20.8 %
:RPS:SCOP  449->588 1t5eA  f.46.1.1 * 1e-08 16.5 %
:HMM:PFM   185->308 PF02163 * Peptidase_M50 1.5e-10 26.8 123/193  
:HMM:PFM   488->537 PF02403 * Seryl_tRNA_N 0.00021 28.0 50/108  
:BLT:SWISS 194->309 YYDH_BACSU 4e-06 27.0 %
:BLT:SWISS 434->556 CCD41_MOUSE 1e-04 30.4 %
:TM

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAZ21747.1 GT:GENE AAZ21747.1 GT:PRODUCT Peptidase M50 GT:DATABASE GIB00256CH01 GT:ORG pubi0 GB:ACCESSION GIB00256CH01 GB:LOCATION 919763..921865 GB:FROM 919763 GB:TO 921865 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT Peptidase M50 GB:PROTEIN_ID AAZ21747.1 GB:DB_XREF GI:71062744 LENGTH 700 SQ:AASEQ MIVPYLRQDLEVFRGNSREDGSPAWLLYDAIRNKYFTLGLTAFKLIKNWSGGEDIKNFEKKINSSGIETNEDEIKSFISFLHQNNLIVQPSGQNVSYLLQQKNSMKKSWLLYLIHSYLFFKIPLFKPDNWLSKTLKYVKYFGSKRFRNITYFFGFVGLFLVAQQFETFKSTFLYFFSFQGLMLYFLTLVFVKCLHELGHAYIAKHYGCRVSAIGIAFLVFFPFLYTDTTDAWRLRNHKERLLINFGGILTELHLALFATFIWGILPEGGFKSAAFFIATTSWISSLTINVSPFMRFDGYYVFSDWLKAENLQPRSFALARWKIRETLFGLNHSPPEEINPSRRWTFIVYAWATWLYRFFLFLGIALLVYHLAFKFLGIILFAVEIYWFIMLPVIREVNNWYKLKSEIKFNKQTKRTLIIITALLMVLFLPWKSSLKIPAVYISEQYLKIYAPYPSMIKRILVEKDDEVEKGQNLIELYSPDLENEIISLRRNIKLIKTKINRLSNSAGNMDQYLTLQQRLIALQTELSGLTKVQNKLLIKAPIKGKIKDFYNLSEDMWVSNLDQLLGIVQFGTGKVKGFIKEEQIDRFLEKNPAVFIPNDGIHDKVYLVSKSLDLSAVNNLPYISLSSIHNGPVAIRNFTGGKFQYRPQTAHYIADFKLAKRSKIQFELPGYVHIEGSRYSPFTKLFKNIIAILVRESGF GT:EXON 1|1-700:0| BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 194->309|YYDH_BACSU|4e-06|27.0|111/252| BL:SWS:REP 434->556|CCD41_MOUSE|1e-04|30.4|115/692| TM:NTM 8 TM:REGION 108->130| TM:REGION 174->196| TM:REGION 207->229| TM:REGION 243->265| TM:REGION 272->294| TM:REGION 346->368| TM:REGION 375->397| TM:REGION 417->439| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 436->488|2dneA|8e-05|15.6|45/108| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 185->308|PF02163|1.5e-10|26.8|123/193|Peptidase_M50| HM:PFM:REP 488->537|PF02403|0.00021|28.0|50/108|Seryl_tRNA_N| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 201->358|2o57A1|4e-05|10.7|140/282|c.66.1.18| RP:SCP:REP 430->477|1ghjA|2e-04|20.8|48/79|b.84.1.1| RP:SCP:REP 449->588|1t5eA|1e-08|16.5|139/231|f.46.1.1| OP:NHOMO 60 OP:NHOMOORG 46 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------1---11---11111-----------------------------------------------------------1-------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------6-------------------------------------11-1-------------------------------1-------------31------------------------------1-----1----------1--------------------1-----1----------------------------1-1----1--1---1---------------------1-------------------------------1----1----------------------------------12------------------------------------12----------------------------------------------------------2-------------------------1-----1-1---1-1--------------------------------------------4-----------------------------------------------------21- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 66 STR:RPRED 9.4 SQ:SECSTR #############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################EEcTTcEccccEETTEEEEcccccEEEEEEccccTTcEEcTTcEEEEEEccccEEEEEcHHHHEEE############################################################################################################################################################################################################# DISOP:02AL 94-107, 499-514| PSIPRED ccccccccccEEcccccccccccEEEEEEcccccEEEEcHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHccEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHccHHHHccccccEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEEEEccEEEEEEcccEEEEEEEEccccEEEcccEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEccccEEEEEEcccccccEEccccEEEEEEEccEEEEEEEEcHHHHHHcccccEEEEEEccccccEEEEEEEEEcccccccccccHHccccccEEEEEEcccccccEEcccEEEEEEEEEcccccccccccEEEEEEcccccEEEEEEEEEEEEEEEEccc //