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Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 (pubi0)
Gene : glyRS
DDBJ      :glyRS        Glycyl-tRNA synthetase beta subunit
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  671/915 : Eukaryota  15/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.203.1a.211.1
:689 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   332->474 2cqzA PDBj 9e-09 14.6 %
:RPS:SCOP  331->451 1xx7A  a.211.1.1 * 2e-05 14.5 %
:RPS:SCOP  442->543 1riqA1  a.203.1.1 * 3e-05 13.0 %
:RPS:PFM   6->540 PF02092 * tRNA_synt_2f e-100 37.8 %
:HMM:PFM   4->543 PF02092 * tRNA_synt_2f 3.3e-181 37.4 538/549  
:HMM:PFM   575->679 PF05746 * DALR_1 3.9e-12 17.5 103/119  
:BLT:SWISS 49->685 SYGB_RICCK 7e-99 33.3 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAZ21438.1 GT:GENE glyRS GT:PRODUCT Glycyl-tRNA synthetase beta subunit GT:DATABASE GIB00256CH01 GT:ORG pubi0 GB:ACCESSION GIB00256CH01 GB:LOCATION 603020..605089 GB:FROM 603020 GB:TO 605089 GB:DIRECTION + GB:GENE glyRS GB:PRODUCT Glycyl-tRNA synthetase beta subunit GB:PROTEIN_ID AAZ21438.1 GB:DB_XREF GI:71062435 GB:GENE:GENE glyRS LENGTH 689 SQ:AASEQ MSDFFIELFSEEIPAGLQSNSRNVLLENFQNLFEEKKILFKKSSSFSTPNRLIILFEGLSKEIIQKAEEIKGPNVKAPEKAIEGFLRSNQIEKKDLLKKTLEKGEFYFFKKASSKINTIDLLQEYTPIILDKLQWKKSMTWGNYNLSWARPLKSILAVFDDKSLNFKFHHLIASNSTFIDKEFEDKKKIFKNFKSYKDFFSQSGIIIDHVLRKEFIVKEIEKISRKNNFIVEPNNKLLDEVTDIVEQPNILVCKFDQKFLNIPKEILIITMQYHQKYFPTFDKKGKITNEFLVVANNNDEKGYIKMGNERVVEARLSDAQFFWEKNKSQNLVKQVSKLKNMNYFKGLGSYFDKIQRMRKLGGIISDELLISKDQVELSASICKVDLVSDIVGEFPELQGIMGGHFAEVQGFDKEIALAISEHYQPVGLDSKTPKKPFSIALALTDKIDTLVGFFGINQKPTSSKDPYALRRSALGVIKLLIDNNKEFKIKDLISYSTSLHKDQGFIFSNDSSQKELSDFLMDRLKYYMKEKKIRSEIIEASIKAHGLDHMNKIYKKASTLNGLISKVIGEDIITSYKRAYSILESELKNTDLELSNTTDPGIFKNDYEKNLFKKINEIRKYFTNIGKDENYRETLEILAGAKKATSEFFDNVKVNDDDKNIKKNRLELLQMLCRTFDNYINFSNIDIKQ GT:EXON 1|1-689:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 49->685|SYGB_RICCK|7e-99|33.3|619/667| SEG 32->47|lfeekkilfkksssfs| SEG 92->105|ekkdllkktlekge| SEG 178->194|fidkefedkkkifknfk| SEG 650->664|dnvkvndddknikkn| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 332->474|2cqzA|9e-09|14.6|137/173| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 6->540|PF02092|e-100|37.8|532/547|tRNA_synt_2f| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 4->543|PF02092|3.3e-181|37.4|538/549|tRNA_synt_2f| HM:PFM:REP 575->679|PF05746|3.9e-12|17.5|103/119|DALR_1| GO:PFM:NREP 6 GO:PFM GO:0000166|"GO:nucleotide binding"|PF02092|IPR002311| GO:PFM GO:0004820|"GO:glycine-tRNA ligase activity"|PF02092|IPR002311| GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF02092|IPR002311| GO:PFM GO:0005737|"GO:cytoplasm"|PF02092|IPR002311| GO:PFM GO:0006412|"GO:translation"|PF02092|IPR002311| GO:PFM GO:0006426|"GO:glycyl-tRNA aminoacylation"|PF02092|IPR002311| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 331->451|1xx7A|2e-05|14.5|117/172|a.211.1.1| RP:SCP:REP 442->543|1riqA1|3e-05|13.0|100/212|a.203.1.1| OP:NHOMO 695 OP:NHOMOORG 686 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 111--------------------------------------111--------------111---1-------------1111-11111----------------------111111111111111---------------------1111111111111111111111111111111111111-----111--1---------------111111-------11111111111--------------------1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111----------------1---------111--111111111111----111-1-111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111------------------------------------------1111111111--- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11117111111121-2-------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 137 STR:RPRED 19.9 SQ:SECSTR ###########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################cccHHHHHTTccc##cccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccHHHHHHHHHHTTTTHHHHccccTTTTTTccHHHHHHHHHHHTcGGGHHHHHHHHHTccHHHHHHHHH####HHHHHHHHHHHHHHTTccccGGGGGHHHHH####################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 68-69| PSIPRED ccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEcccEEEEEEEcccccccccEEEcccccccccHHHHHHHHHHccccHHHcEEEEccccEEEEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEccccEEEEEHHHHHHHHcccEEEEEEEEcEEEccEEEccEEEccccEEEccHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEccHHHHHHHHHHHcccEEEEEEEcHHHHcccHHHHHHHHHHcccEEEEEcccccEEccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHcccHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHEEcc //