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Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 (pubi0)
Gene : leuS
DDBJ      :leuS         Leucyl-tRNA synthetase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  67/68 : Bacteria  911/915 : Eukaryota  197/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.102.1a.27.1c.26.1c.47.1
:844 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   1->844 2bteA PDBj e-157 38.0 %
:RPS:PDB   1->844 2bteA PDBj e-137 37.5 %
:RPS:SCOP  1->332 1f9dA  a.102.1.2 * 1e-47 9.7 %
:RPS:SCOP  324->417 2a4hA1  c.47.1.23 * 5e-17 8.6 %
:RPS:SCOP  416->664 1h3nA3  c.26.1.1 * 5e-35 37.9 %
:RPS:SCOP  665->783 1h3nA1  a.27.1.1 * 4e-10 18.6 %
:HMM:SCOP  1->664 1h3nA3 c.26.1.1 * 6.8e-137 39.7 %
:HMM:SCOP  666->842 1rqgA1 a.27.1.1 * 4.5e-17 21.8 %
:RPS:PFM   12->647 PF00133 * tRNA-synt_1 3e-66 39.2 %
:HMM:PFM   12->364 PF00133 * tRNA-synt_1 3.5e-46 28.4 299/601  
:HMM:PFM   419->575 PF00133 * tRNA-synt_1 3.6e-13 21.8 142/601  
:HMM:PFM   615->655 PF00133 * tRNA-synt_1 4.6e-12 46.3 41/601  
:HMM:PFM   695->804 PF08264 * Anticodon_1 1e-16 32.1 109/152  
:BLT:SWISS 1->844 SYL_BARBK 0.0 50.3 %
:PROS 41->52|PS00178|AA_TRNA_LIGASE_I
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAZ21179.1 GT:GENE leuS GT:PRODUCT Leucyl-tRNA synthetase GT:DATABASE GIB00256CH01 GT:ORG pubi0 GB:ACCESSION GIB00256CH01 GB:LOCATION complement(348696..351230) GB:FROM 348696 GB:TO 351230 GB:DIRECTION - GB:GENE leuS GB:PRODUCT Leucyl-tRNA synthetase GB:PROTEIN_ID AAZ21179.1 GB:DB_XREF GI:71062176 GB:GENE:GENE leuS LENGTH 844 SQ:AASEQ 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727->741|ikeidkpikkeilie| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 1->844|2bteA|e-157|38.0|837/876| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 1->844|2bteA|e-137|37.5|838/876| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 12->647|PF00133|3e-66|39.2|518/593|tRNA-synt_1| HM:PFM:NREP 4 HM:PFM:REP 12->364|PF00133|3.5e-46|28.4|299/601|tRNA-synt_1| HM:PFM:REP 419->575|PF00133|3.6e-13|21.8|142/601|tRNA-synt_1| HM:PFM:REP 615->655|PF00133|4.6e-12|46.3|41/601|tRNA-synt_1| HM:PFM:REP 695->804|PF08264|1e-16|32.1|109/152|Anticodon_1| GO:PFM:NREP 6 GO:PFM GO:0000166|"GO:nucleotide binding"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0004812|"GO:aminoacyl-tRNA ligase activity"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0005737|"GO:cytoplasm"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0006412|"GO:translation"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0006418|"GO:tRNA aminoacylation for protein translation"|PF00133|IPR002300| RP:SCP:NREP 4 RP:SCP:REP 1->332|1f9dA|1e-47|9.7|309/629|a.102.1.2| RP:SCP:REP 324->417|2a4hA1|5e-17|8.6|93/117|c.47.1.23| RP:SCP:REP 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3342233333333343344-44334434434434444444222334223323434433223332243334333333334334354544222333224223232232422243333333333333344444444443333334443233433333333333333333333333333333333334234444344466666665466666644444466644445444444445444444444454444454444444444444444444444444444444444444444444544544444444444444444434444444443544333333343443444555344344444444444454444444344243333333333444444444444444434344343-4434444433434444444554334433333333333334444444433333434334444443344443444444444444444444343333333333343443443344443333322334422233333334333433333332333333322333333224333232333344444434433335142333432222232333333333344422222232332332222222222223222232212222223233323222232222222222-22322222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222333322222222222223222233232323222333433233323333333233333323332333333332333233333333333333333333333333343333123333333333444344-44443344444444434444444443444343 3343444-83332232234434433343313334432444334233534432543354554445344513444324415443443355-3132333222223255523957696847233235576363dp62755343284252353235126435435CF58662735575364245h5664455893556597753 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 844 STR:RPRED 100.0 SQ:SECSTR 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cccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccEEEEEcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEccccccccccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEccEEEEEEccccccccHHHHHcccccccccccEEEEcccEEEEccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHccccccccEEEEEEccccccccEEEEEEccccHHHHccEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEccccccEEEEEEEEcccccccccEEEEEcccccHHHHHHHHHcccccEEEEccccccccccccHHHccccEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccEEEEEccccEEEccccHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccEEcccccHHHHccHHHHHHHccccHHccccccHHHHHHccccEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHccEEEccccEEcccccccccccEEcccccHHHHHcccccccccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHcHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHcccccEEEEEEccEEEEEEc //