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Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 (pubi0)
Gene : opuAB
DDBJ      :opuAB        glycine betaine/L-proline transport system permease
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  16/68 : Bacteria  470/915 : Eukaryota  1/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.58.1
:717 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   189->315 3dhwA PDBj 4e-07 30.9 %
:RPS:PDB   288->323 3dhwA PDBj 4e-09 36.1 %
:RPS:PDB   609->649 3dhwA PDBj 3e-06 24.4 %
:RPS:SCOP  197->340 2r6gG1  f.58.1.1 * 2e-11 15.5 %
:RPS:SCOP  515->710 2r6gG1  f.58.1.1 * 2e-13 14.9 %
:RPS:PFM   208->323 PF00528 * BPD_transp_1 7e-09 32.7 %
:RPS:PFM   589->704 PF00528 * BPD_transp_1 1e-04 29.5 %
:HMM:PFM   218->375 PF00528 * BPD_transp_1 1.7e-19 25.6 156/185  
:HMM:PFM   539->703 PF00528 * BPD_transp_1 2.2e-24 25.2 163/185  
:BLT:SWISS 156->340 PROW_ECOLI 7e-31 34.1 %
:BLT:SWISS 434->676 PROW_SALTY 5e-32 30.5 %
:TM
:REPEAT 2|138->391|459->715
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAZ22100.1 GT:GENE opuAB GT:PRODUCT glycine betaine/L-proline transport system permease GT:DATABASE GIB00256CH01 GT:ORG pubi0 GB:ACCESSION GIB00256CH01 GB:LOCATION complement(1230571..1232724) GB:FROM 1230571 GB:TO 1232724 GB:DIRECTION - GB:GENE opuAB GB:PRODUCT glycine betaine/L-proline transport system permease GB:PROTEIN_ID AAZ22100.1 GB:DB_XREF GI:71063097 GB:GENE:GENE opuAB LENGTH 717 SQ:AASEQ 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GO:0016020|"GO:membrane"|PF00528|IPR000515| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 197->340|2r6gG1|2e-11|15.5|144/284|f.58.1.1| RP:SCP:REP 515->710|2r6gG1|2e-13|14.9|195/284|f.58.1.1| OP:NHOMO 916 OP:NHOMOORG 487 OP:PATTERN -----------------------1-----------1-1111111-11--3112-------1------- 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cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHcHHHHHccccccEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHcccccEEEHHEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccc //