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Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 (pubi0)
Gene : pilMN
DDBJ      :pilMN        Type II Secretion
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  36/915 : Eukaryota  1/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:847 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   148->230 3ecrA PDBj 5e-04 13.6 %
:RPS:PFM   359->492 PF11104 * Competence_A 3e-10 28.7 %
:RPS:PFM   664->821 PF05137 * PilN 3e-08 30.0 %
:HMM:PFM   369->501 PF11104 * Competence_A 4.6e-15 23.1 130/146  
:HMM:PFM   664->821 PF05137 * PilN 3.4e-14 20.0 155/162  
:BLT:SWISS 72->173 EBH_STAAW 4e-05 41.0 %
:BLT:SWISS 157->242 RRF2M_VANPO 3e-04 34.7 %
:BLT:SWISS 498->638 TTL3B_TETTH 9e-06 30.4 %
:TM
:REPEAT 2|13->77|78->142
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAZ20888.1 GT:GENE pilMN GT:PRODUCT Type II Secretion GT:DATABASE GIB00256CH01 GT:ORG pubi0 GB:ACCESSION GIB00256CH01 GB:LOCATION complement(73227..75770) GB:FROM 73227 GB:TO 75770 GB:DIRECTION - GB:GENE pilMN GB:PRODUCT Type II Secretion GB:NOTE Type IV pilus biogenesis protein, PilM/PilN fusion GB:PROTEIN_ID AAZ20888.1 GB:DB_XREF GI:71061885 GB:GENE:GENE pilMN LENGTH 847 SQ:AASEQ MDEDNKDKFDYKEEDTLKSDQENQSENDSTDTLNPQETDNNESEKSNENDNLTENSETLQSQDESVEQNVSASNTNNDEETLKSDQENQSENDSTDTLNPQETDNNESEKSNENDNLTENSETLQSQDESVEQNVSASNTNNEEQKKEHEVIHKKDGRLHIYVRQDKYKGELKSRNWVGRLYIDGKQKISSSGTTNLDDAIPILEKWFDDVHEESKKLKIEENIKPEEGESSQIDISTTNQSNNEAQPQTSSVPLNENSEISTQDQVKSKLSNIFGKIKEIKIKKPDFAKNIKKSSFNNSKVGNYKSKIQNFFKSKLGKSSVQGEEIIGIELANKEIRIVQVSSNKANQWVLEKLHIHPVDITDDSTPIDNADKFSEELVLAIQKYKITSPNAAIAIPVTSAIIRVVTAPLMKEDELNKAIETNSLWENLVQLTDSLEDYSIFHQVINRNDKENTMDILFVASKLTDINSYTSIIKNAGLNPVIIDVKCFALKSSVDQVNQITNKTEDANLTAVLEFGLDENYLMILYNNNPIITDIFIRGQDRKILQDSQDTEEKEGLVRRYVTQVKQAIQDFETKYEKRIRNIKVVSDIKNVDEYLGSFRKILMNVGFNTFDPTEGLKIPSQYQQILDNKLNRSYLSTSVGLAFRKLDVFGYYKFVTAVKNINLLPDRSNVMKQKKMKAISGFAFKGITAAVVAIYVVLFGLSFWNIASYNKKLKQYETVKIDHAKIIKQKKIVSKELSVINTSLKLSRTLKSNKELTYRILAQVASSVPNRVKFDQVEFNGSRRLTIQGIAASDQDILKFIENLGNQKLVEQASLSSMRLPKSTAGGATMKGFRVFVKIKTGKI GT:EXON 1|1-847:0| BL:SWS:NREP 3 BL:SWS:REP 72->173|EBH_STAAW|4e-05|41.0|100/9904| BL:SWS:REP 157->242|RRF2M_VANPO|3e-04|34.7|72/799| BL:SWS:REP 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-1-----------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------1------1--1111-1--11-1-----------------1-1-----------111111111-11-11-1---------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------1111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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###################################################################################################################################################HHHHHHHHcccccEEEEEEEETTEEEEEEEEEcT##TcccEEEEEEEEEcccccccccccTTccccTTcccTTccHHHHHHHH######################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-5, 8-291, 318-330, 542-557, 820-822, 824-825| PSIPRED ccccccccHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHcccccccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHccccccccccccHHHHHHcccccccHHHHcccHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHcccccccccccccEEEcccccEEEEEEEEccccEEEEEEEEEcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEccccEEEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHccccccccEEEEEEEEccHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEEEEcccEEEEEEEEccEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHEEcccccccccHHHccccccccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEcccEEEEEEEEccccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHccccccccccEEEEEEEEEEEEcccc //