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Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 (pubi0)
Gene : rrf
DDBJ      :rrf          Ribosome recycling factor
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  907/915 : Eukaryota  75/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.67.3
:183 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:BLT:PDB   1->183 1is1A PDBj 3e-37 41.0 %
:RPS:PDB   5->181 1eh1A PDBj 6e-48 39.0 %
:RPS:SCOP  5->181 1dd5A  d.67.3.1 * 2e-45 37.3 %
:HMM:SCOP  5->182 1eh1A_ d.67.3.1 * 9.4e-57 50.6 %
:RPS:PFM   19->181 PF01765 * RRF 3e-32 46.0 %
:HMM:PFM   18->181 PF01765 * RRF 3.6e-61 54.3 164/165  
:BLT:SWISS 4->183 RRF_RICBR 3e-46 49.4 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAZ21722.1 GT:GENE rrf GT:PRODUCT Ribosome recycling factor GT:DATABASE GIB00256CH01 GT:ORG pubi0 GB:ACCESSION GIB00256CH01 GB:LOCATION 874959..875510 GB:FROM 874959 GB:TO 875510 GB:DIRECTION + GB:GENE rrf GB:PRODUCT Ribosome recycling factor GB:PROTEIN_ID AAZ21722.1 GB:DB_XREF GI:71062719 GB:GENE:GENE rrf LENGTH 183 SQ:AASEQ MFNEKSYSQKMDKTIEVFQKELTSLRTGRANSSMLDLVKVDVYGQAMPLNQVSSITTPDARTINIQVWDLNNVPLVDTAIKKSELGLNPQIDGQLIRLPVPDLNEERRTEIKKLIKSMGEKCKISIRNIRREANDDLKNLVKEKIISEDEEKINEKLVQSFTDEHIKIIDTKVEVKEKEIMTI GT:EXON 1|1-183:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 4->183|RRF_RICBR|3e-46|49.4|180/186| SEG 142->156|kekiisedeekinek| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 1->183|1is1A|3e-37|41.0|183/185| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 5->181|1eh1A|6e-48|39.0|177/185| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 19->181|PF01765|3e-32|46.0|163/165|RRF| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 18->181|PF01765|3.6e-61|54.3|164/165|RRF| GO:PFM:NREP 1 GO:PFM GO:0006412|"GO:translation"|PF01765|IPR002661| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 5->181|1dd5A|2e-45|37.3|177/184|d.67.3.1| HM:SCP:REP 5->182|1eh1A_|9.4e-57|50.6|178/185|d.67.3.1|1/1|Ribosome recycling factor, RRF| OP:NHOMO 1018 OP:NHOMOORG 982 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 1111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111 ----111-----111-------------------------------------------------------1-11-------------------------11--111-14111---111-1-11111-1-431-121-1111-111-1---1--1-11-1-----1--1-1----121229222212222-214221111 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 183 STR:RPRED 100.0 SQ:SECSTR cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccccccccGGGTccEEEETTEEEEGGGTcEEEcccTTEEEEEcccHHHHHHHHHHHcccTTcccEEEETTEEEEEcccccTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcc PSIPRED cccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHccEEEEEccccEEHHHEEEEEcccccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcc //