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Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 (pubi0)
Gene : slt
DDBJ      :slt          putative soluble lytic murein transglycosylase precursor (slt)
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  553/915 : Eukaryota  2/199 : Viruses  4/175   --->[See Alignment]
a.118.5d.2.1
:737 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   535->720 1qsaA PDBj 3e-26 41.0 %
:RPS:PDB   584->719 1d0lA PDBj 1e-18 16.9 %
:RPS:SCOP  584->720 1qsaA2  d.2.1.6 * 6e-25 42.1 %
:HMM:SCOP  101->564 1qsaA1 a.118.5.1 * 6.2e-47 18.9 %
:HMM:SCOP  566->736 1qsaA2 d.2.1.6 * 1.2e-40 35.3 %
:RPS:PFM   584->674 PF01464 * SLT 2e-12 44.8 %
:HMM:PFM   584->687 PF01464 * SLT 9.7e-24 37.6 101/121  
:HMM:PFM   430->457 PF07719 * TPR_2 0.0001 28.6 28/34  
:BLT:SWISS 535->720 SLT_ECOLI 9e-26 41.0 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAZ21868.1 GT:GENE slt GT:PRODUCT putative soluble lytic murein transglycosylase precursor (slt) GT:DATABASE GIB00256CH01 GT:ORG pubi0 GB:ACCESSION GIB00256CH01 GB:LOCATION 1029539..1031752 GB:FROM 1029539 GB:TO 1031752 GB:DIRECTION + GB:GENE slt GB:PRODUCT putative soluble lytic murein transglycosylase precursor (slt) GB:PROTEIN_ID AAZ21868.1 GB:DB_XREF GI:71062865 GB:GENE:GENE slt LENGTH 737 SQ:AASEQ MPRKIIFFIKSLLLSLVIIGNIFAAEISIIPLKKPILDEEVKKQKISQGILKPKPKPSQKKEEVKIVTVKKNKKKINFLIPKSKPLIVKSEKSVVQKRSKYYSQKDYDIAKKSIQAMEKSQWTTALKNSKNAKDKSIYNFIQWRHLLTTGNQATFYDYMTFIQNNKHYPRISRIKYLAEQKLSTDKISPKKIINWFGVDEPLSGYGMLVLGESFIQTGDNEKGIALIKRGWITAELSRASMKSLSKKYRKYLDSKDYINRADYLAWENKYWDLKRMLPYLPKDYQLLYTARQILMSKSYGVDQAIKNVPQKFKNDAGLNHDRLKWRRKRGRIDSSLEILFSIKNNKDYLVRPDKWWVERAIMTRALIYKNKYETAYKVASQHSLDKGSEFAEAEWLSGWIALSFLNDPILAVDHFNNFYQNVSYPISLARGAYWLGRSYEKIGDKRQSEDWYREATKYLTTYYGQLAFLKINPSQNFELEEQADVEDDYRKYFYNKELVKITHLLNELNKDKYTKNILRHLANDNIASGSEILAAELATNISRYDFAIQISKLASYEKRFHNTFNYPIISVPQYVNGRKIPETAFILSLIRQESEFDMRANSHVGAQGLMQIMPYTAKLVAKQAKLPYSKSRLTSDPEYNINLGSHYIAGLILQYDGAYPFATAAYNAGPKRVKHWKKINKDPQKKQIDFVDWVELIPFKETRNYVQRVMENYNVYRYILEKKPIKIKDFFKDQPLF GT:EXON 1|1-737:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 535->720|SLT_ECOLI|9e-26|41.0|178/645| TM:NTM 1 TM:REGION 9->31| SEG 4->19|kiiffikslllslvii| SEG 52->77|kpkpkpsqkkeevkivtvkknkkkin| SEG 722->733|kkpikikdffkd| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 535->720|1qsaA|3e-26|41.0|178/618| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 584->719|1d0lA|1e-18|16.9|130/314| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 584->674|PF01464|2e-12|44.8|87/113|SLT| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 584->687|PF01464|9.7e-24|37.6|101/121|SLT| HM:PFM:REP 430->457|PF07719|0.0001|28.6|28/34|TPR_2| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 584->720|1qsaA2|6e-25|42.1|133/168|d.2.1.6| HM:SCP:REP 101->564|1qsaA1|6.2e-47|18.9|445/0|a.118.5.1|1/1|Bacterial muramidases| HM:SCP:REP 566->736|1qsaA2|1.2e-40|35.3|167/168|d.2.1.6|1/1|Lysozyme-like| OP:NHOMO 750 OP:NHOMOORG 559 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- -22-------------------------------------------------------------------------------111111------------------------------------------------1--11---111111111111111111111111111-1-----1------------211-----1--1------111112---11111--11111122------------------------------------------------------------------------------------------23123222222222221222111-22111-122222222-2222222----2-22221111111211121111111111-111111-11112111112-111211111121111114111211331222222222222221211--------111111111111111----122222111111111111111111111111111112221112221122222222121112111211111111121125111112--2-111-22122222333334232-1-1-11111-111111111-----11121111211122222222222222222222--1-111------11112111111111111-111111111111111111111111111111111111111111121111111--111111111111---1-----1111-1-1-111111111111--1222222222222111121212222211112111111111333211-111111111111111111111--332211221111111111--------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1---- ------------------------------------------111---------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------ STR:NPRED 188 STR:RPRED 25.5 SQ:SECSTR ####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################ccHHHHGGGTcccccHHHHHHHHHTHHHHHTTHHHHHHHHTcTTcTTccHHHHHHHHHHHHTTccTTTEcTTcccTTTTccHHHHHHHcccTTccccccTTGGcHHHHHHHHHHHHHHTTccTTccHccEEEEEcccccccccTTccEEHHHHHHTTcEEccccccTTccEEEEEEEEccccEEEEET################# DISOP:02AL 36-60| PSIPRED ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHccccccccHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccHHcccccccHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEEEcHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHcccHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccc //