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Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 (pubi0)
Gene : yjcG
DDBJ      :yjcG         Na+/solute symporter (Ssf family)
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  16/68 : Bacteria  484/915 : Eukaryota  23/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:602 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   72->236 3dh4A PDBj 1e-08 26.0 %
:RPS:PFM   68->532 PF00474 * SSF 1e-34 35.4 %
:HMM:PFM   68->339 PF00474 * SSF 5.1e-39 25.4 248/406  
:HMM:PFM   417->532 PF00474 * SSF 1e-18 31.9 116/406  
:BLT:SWISS 32->258,293->519 Y2524_RALEH 5e-58 48.5 %
:PROS 388->400|PS00018|EF_HAND_1
:PROS 514->534|PS00457|NA_SOLUT_SYMP_2
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAZ21139.1 GT:GENE yjcG GT:PRODUCT Na+/solute symporter (Ssf family) GT:DATABASE GIB00256CH01 GT:ORG pubi0 GB:ACCESSION GIB00256CH01 GB:LOCATION 313133..314941 GB:FROM 313133 GB:TO 314941 GB:DIRECTION + GB:GENE yjcG GB:PRODUCT Na+/solute symporter (Ssf family) GB:PROTEIN_ID AAZ21139.1 GB:DB_XREF GI:71062136 GB:GENE:GENE yjcG LENGTH 602 SQ:AASEQ MIKGKFIDNLPKVYGIYTGGFIGFIILMAIGEQMGMTAKAIGVAFVAFTIFIYALIGYLSRTAQADAYYVAGRQVPTVFNGMATAADWMSGASFVAMAGGIYFKGYGYMALLVGWTGGYILVATLLAPYLRKFGCYTVPDFVGTRYGGNLARLCAVIVLTVASFTYVTAQINATGTIASVALDIDFKYAVYIGLISILLCSMLGGMRAVTWTQVAQYIVLIIAYLLPIFWISNKMGAGFFPHFMLADEVARIGELEQQFGFVKNSAADLATVPKGLAGITKAHSAVNATPWAFISLALAMMMGTASLPHVMMRYFTTPSVKAARKSVGWSLFFIFLLYSSAPMLATLSKLSLIDPTLPTGIIGKSFAEVQSIDWFQNWNQANLMFISDFNGNGTLELNEFFMGGKAVVLATPEIAGLPYVISGLVAAGGMAAAMSTADGLILAIANAISHDVYYKMIDPKAETAKRLLVARVLLVIIGFAGATIAAMEIQGILGSVIWAFDFAMSGLFFPLVLGVWWKRANREGAIAGMVLGLGSAIWYLVWVRNGGSGFLGLTQLTFGIFGAAVSFVSMVVVSLMTQEPDKSIQKMVDEVRIPSGKTVTGK GT:EXON 1|1-602:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 32->258,293->519|Y2524_RALEH|5e-58|48.5|447/683| PROS 388->400|PS00018|EF_HAND_1|PDOC00018| PROS 514->534|PS00457|NA_SOLUT_SYMP_2|PDOC00429| TM:NTM 14 TM:REGION 29->51| TM:REGION 78->100| TM:REGION 109->130| TM:REGION 147->169| TM:REGION 187->209| TM:REGION 212->234| TM:REGION 286->308| TM:REGION 328->350| TM:REGION 401->423| TM:REGION 428->450| TM:REGION 467->489| TM:REGION 494->516| TM:REGION 522->544| TM:REGION 552->574| SEG 14->26|ygiytggfigfii| SEG 426->434|aaggmaaam| SEG 466->475|rllvarvllv| SEG 565->574|vsfvsmvvvs| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 72->236|3dh4A|1e-08|26.0|154/512| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 68->532|PF00474|1e-34|35.4|398/401|SSF| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 68->339|PF00474|5.1e-39|25.4|248/406|SSF| HM:PFM:REP 417->532|PF00474|1e-18|31.9|116/406|SSF| GO:PFM:NREP 4 GO:PFM GO:0005215|"GO:transporter activity"|PF00474|IPR001734| GO:PFM GO:0006810|"GO:transport"|PF00474|IPR001734| GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF00474|IPR001734| GO:PFM GO:0055085|"GO:transmembrane transport"|PF00474|IPR001734| OP:NHOMO 927 OP:NHOMOORG 523 OP:PATTERN ---1-------------------21--1--11------1111--------221-2--11--------- -11--112111112-------1---1------2---32441---1111-11-122111----1-4355342--------12121-111111--2-11----2-23112-2---------------1112124311222222----11-1------------------1112------------11111----123333333343333321244233332233533------3-2111111111111112---1------------------------------------------------------------------------1--------------------1----1-12211--1--21------1-2221---------11----------------------23222511--1--------------22222-22222111-------------421----------23---------1-------11-1--111112222222222222332222124322432-1221221334242-12231---2211111-1---443-----222-11111-4443343--22421---3--2-11112212111111113211--22-412213222222212122212121112---1211------22213222222222222-222222222222212222222212223222222222222222222211112--122222222222--11----------113222211111111111211211112222212123211153433111---------113311111131211--111111111111--1-------------------------------------------------------1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------11311-1------1-1-1121-11-----2-----------1--1-----2-13--------1--1-----------2---------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 154 STR:RPRED 25.6 SQ:SECSTR #######################################################################cccccHHHHHHHHHHHHccHHHHTHHHHcGGGHHHHHHHHHH#####HHHHHHHTHHHHHHTTcccHHHHHHHHTcHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHTTccHHHHH#HHHHHHHHHTTc#####cccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 1-7, 598-602| PSIPRED ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHccHHHHHHHHHccEEEEEEEcccccEEHHHEEEcccEEEEccccHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHccccccccccc //