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Rickettsia conorii str. Malish 7 (rcon0)
Gene : sca2
DDBJ      :sca2         190 kD antigen precursor
Swiss-Prot:SCA2_RICCN   RecName: Full=Putative surface cell antigen sca2;Flags: Precursor;

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  13/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.151.1f.4.5
:1795 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   212->292 3eetA PDBj 1e-04 14.1 %
:RPS:PDB   1155->1282 1e3pA PDBj 7e-04 12.8 %
:RPS:SCOP  152->459 1i9yA  d.151.1.2 * 1e-08 9.5 %
:RPS:SCOP  1501->1794 1uynX  f.4.5.1 * 2e-20 13.0 %
:HMM:SCOP  200->1795 1uynX_ f.4.5.1 * 4.8e-28 18.2 %
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:HMM:PFM   1519->1779 PF03797 * Autotransporter 1.6e-37 21.0 252/265  
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:REPEAT 3|212->253|254->296|297->338
:REPEAT 2|1177->1267|1268->1355
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAL02648.1 GT:GENE sca2 GT:PRODUCT 190 kD antigen precursor GT:DATABASE GIB00062CH01 GT:ORG rcon0 GB:ACCESSION GIB00062CH01 GB:LOCATION complement(105109..110496) GB:FROM 105109 GB:TO 110496 GB:DIRECTION - GB:GENE sca2 GB:PRODUCT 190 kD antigen precursor GB:PROTEIN_ID AAL02648.1 GB:DB_XREF GI:15619151 GB:GENE:GENE sca2 LENGTH 1795 SQ:AASEQ MNLQNSHSKKYVLTFFMSTCLLTSSFLSTSARAASFKDLVSKTPAWEKHNSTQQQNIWKDLTPNEKIKKWQEAALVPSFTQAQNDLGIKYKETDLSSFLDNTRHKARQARAEILLYIERVKQQDFDTKKQAYINQGVVPTDIEAATNLGISYDPSKIDNNVEHDQKVRRAEKDKKAVIELYVSSINRGIKYKHYVDNDIIPEIQEVRTALNMNKDDAQSFVASIRTEIMENAKGQYIADSHIPTEKELKKKFGISRDDNRDGYIKSIRLKVMDKEKPQYIADSHIPTEKELEQKFGADKGEATNYIASIATQMMLDKKSYYIDNNIIPNADELMNEFKIGPVKATSYINQIRAGIEANQFLNNNDTTKPSTGRSQKKSGSKNDHWYMSNQSINNTGTSARIVTGREKKQRYFFDPISTFKTYFNTKASKGNLTQSQHNINRIIQQEENIEEFKNLIKTDPIAALTLQVDSSYKQEAVTTILSDFNDDTIQRVLFSNDKGKLDFNTNIDVKNRPILQELLENSSSEEKTKFAERIQDYATRNISNSQFEEKARLDLIKLAASKDKSSVENFLTLQLELKNRMQPYVVNSVYILTPEIVKEINIELKNKGLIRDSLTKDYMIKLAKEVNNHTLNSVIKVILSDSKILSNETNKILGLAVSNNANNLEQTQSGIPNPPPLPLNGGIPNPPPLPLNGSMPPPPLHSQGFSSNSKHFDLNQLQTEYPHIHSLYVQFTHNTTVQSKAPLQPTASSATSTGRSTPETAYAKLYAEYRTETGGTKANDLQDQLIKRQADLTNVIRQILTESYANQGADEKTLLNLFSISTPEIAEKAKEAFNTLAQDQYIKDITVNGKKTITSEEIIKNLFNEDTDDAIKRILLSSCKISEELKRPIKLEFNKSELIRELQGKQNPFKQLEFAYINTKNFDQDIFGNRIDELINNPNILTIVQQATFLTKEDTNLRKTINSDQAQAKLDDLRTAILSTIKIEELITANLPQHDFIAIVKEKDPELLKEFLKATTLTVTGNNNLDQLRLALPSFTGMSNEQIRILSNKLKMSIILKALKECSQEKATQYIHTGNMPPPPPPPPPLPDSQDLELAYLKSLGITKANTSTFKTTPKTYHFSSDIALRYKEFTLSGQKSAGYKAKYSDADLLKKAIVESVAFEHSKNLSKAHQNNKYFEQIQKAVNTMYSSFIGHRTELEQKIHNIYTSKLLELTKDKEFIKYVEDNIILNKKLTKAFTSADSDFIDSRTELEQKIHNIYIQQLTKYPEEEVKEAFNTASLDFIGPRTEIGQEVHNIYKSQLLELTKDTELCLFTQQVLAEATELEQKYGSDIQSENSNNEKKVERLDQEKLQLFKQENEATNDESSTKDDTQPEDSNKKSEQSDSKTALSPRLLSSNDSKNDKSSDDKKSLLALRSSDEDDTGYATDEEELEESNSTTDEELKKDVVLESEDEAIDVSFKTEAITEQDEVTQRQQVSDDTSGKVAILVQATSTLHKPVHYNINDRLTVAAIGAGDEETSINRGVWISGLYGINKQRIWKNIPKYQNRTTGITIGTDAEFINSHDVIGIAYSRLESQIKYNKKLGKTTVNGHLLSIYSLKELIKGFSLQTITSYGHNYIKNRSKNINNIIGKYQNNSLSFQTLLNYKYRTKYDLHFIPNIGFQYDYSRASNYKEYNVDIENLMIQKKSNQLFESSLGGKIVFKPIVTTNNIVLTPSLYGNIEHHFNNKNTKVNAKATFKGQTLQETIITLKQPKLGYNIGSNILMSRKNINVLLEYNYYTHRKYQSHQGLIKLKVNL GT:EXON 1|1-1795:0| SW:ID SCA2_RICCN SW:DE RecName: Full=Putative surface cell antigen sca2;Flags: Precursor; SW:GN Name=sca2; OrderedLocusNames=RC0110; SW:KW Cell membrane; Cell outer membrane; Complete proteome; Membrane;Signal. SW:EXACT T SW:FUNC + BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->1795|SCA2_RICCN|0.0|100.0|1795/1795| GO:SWS:NREP 3 GO:SWS GO:0005886|"GO:plasma membrane"|Cell membrane| GO:SWS GO:0009279|"GO:cell outer membrane"|Cell outer membrane| GO:SWS GO:0016020|"GO:membrane"|Membrane| NREPEAT 2 REPEAT 3|212->253|254->296|297->338| REPEAT 2|1177->1267|1268->1355| SEG 13->36|ltffmstclltssflstsaraasf| SEG 436->451|qhninriiqqeeniee| SEG 515->526|lqellensssee| SEG 669->700|sgipnppplplnggipnppplplngsmppppl| SEG 746->757|tassatstgrst| SEG 1077->1087|ppppppppplp| SEG 1392->1417|llssndskndkssddkksllalrssd| SEG 1615->1630|nyiknrskninniigk| SEG 1723->1737|fnnkntkvnakatfk| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 212->292|3eetA|1e-04|14.1|78/238| RP:PDB:REP 1155->1282|1e3pA|7e-04|12.8|125/645| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 1520->1776|PF03797|3e-08|21.2|250/263|Autotransporter| HM:PFM:NREP 4 HM:PFM:REP 1519->1779|PF03797|1.6e-37|21.0|252/265|Autotransporter| HM:PFM:REP 669->699|PF06346|1.3e-06|61.3|31/160|Drf_FH1| HM:PFM:REP 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DISOP:02AL 1-10, 166-171, 365-384, 520-530, 666-671, 743-759, 1078-1087, 1135-1141, 1234-1235, 1239-1251, 1292-1299, 1301-1302, 1316-1384, 1388-1440, 1471-1480, 1506-1516, 1578-1585| PSIPRED cccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHcccccHHcccHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHcccEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHccccccccHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEccccccccHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEccccccHHHHHHHcccccccccccEEEEEEEEEEcccccccccccccccHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHccccEEEcccccccHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccEEEEccccccccccEEEEEccHHcccEEccHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHcccEEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHcccccccEEEcccccccccHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHccEEEEEcHHHHHHHccEEccccEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEcccccEEEEEEEccccHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHEEHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEcccccccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHccHHHHHccHHHHHccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEEEEEEEcccHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEcccHHHHHHHHcccEEEEEEcccccEEEEEccccccccccHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEccccccccccccccccccccHHHHHHHHcccHHHHHHHcccccEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHcccEEEEEEccccccccccHHHHHccHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccHHHHccccHHHHccHHHHcccHHHccccHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHEEHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccEEEEEEEccccccccccccccEEEEEEEEEEEEEEEEccccEEEEEEEEEEEEEEccccccccEEEEEEEEEEEEEEccccEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHccEEEEEEccEEEEEEEEEEEEEEccccEEEEEEEEEEEEEEEccccccccccEEEEEEEcccccEEEEEccEEEEcccEEEEccEEEEEEEEEEEEEEEccccccEEEEEEEEccEEccccccccccccHHHHHHHHHEEccEEEEEEEEEEEEcccEEEEEEEEEEEEEc 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