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Rickettsia conorii str. Malish 7 (rcon0)
Gene : sca4
DDBJ      :sca4         cell surface antigen
Swiss-Prot:SCA4_RICCN   RecName: Full=Antigenic heat-stable 120 kDa protein;AltName: Full=120 kDa antigen;AltName: Full=Protein PS 120;         Short=PS120;AltName: Full=RCA;

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  15/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.50.1
:1026 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   365->424 1ej6B PDBj 8e-07 16.4 %
:RPS:PDB   811->948 1dg3A PDBj 8e-04 21.9 %
:RPS:SCOP  364->419 1r5sA  f.50.1.1 * 3e-04 10.7 %
:RPS:PFM   244->282 PF12574 * 120_Rick_ant 1e-18 100.0 %
:HMM:PFM   244->282 PF12574 * 120_Rick_ant 7.9e-26 71.8 39/39  
:HMM:PFM   312->328 PF10636 * hemP 9.5e-05 47.1 17/38  
:BLT:SWISS 5->1026 SCA4_RICCN 0.0 100.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAL03205.1 GT:GENE sca4 GT:PRODUCT cell surface antigen GT:DATABASE GIB00062CH01 GT:ORG rcon0 GB:ACCESSION GIB00062CH01 GB:LOCATION 648230..651310 GB:FROM 648230 GB:TO 651310 GB:DIRECTION + GB:GENE sca4 GB:PRODUCT cell surface antigen GB:PROTEIN_ID AAL03205.1 GB:DB_XREF GI:15619756 GB:GENE:GENE sca4 LENGTH 1026 SQ:AASEQ MRGFMSKDGNLDTSEFDPLANKEYTEEQKQTLEQEQKEFLSQTTTPALEADDGFIVTSASFAQSTPSMSALSGNISPDSQTSDPITKAVRETIIQPQKDNLIEQILKDLAALTDRDLAEQKRKEIEEEKEKDKTLSTFFGNPANREFIDKALENPELKKKLESIEIAGYKNVHNTFSAASGYPGGFKPVQWENHVSANDLRATVVKNDAGDELCTLNETTVKTKPFTLAKQDGTQVQISSYREIDFPIKLDKADGSMHLSMVALKADGTKPSKDKAVYFTAHYEEGPNGKPQLKEISSPKPLKFAGTGDDAIAYIEHGGEIYTLAVTRGKYKEMMKEVELNQGQSVDLSQAEDIIIGQGQSKEQPLITPQQTTSSSVEPPQYKQQVPPITPTNQPLQPETSQMPQSQQVNPNLLNTATALSGSMQDLLNYVNAGLTKAIDSNKQIDLIKEAATAILNNEKSDIAEKQANIIALAENTVNNKNLKPDAKVTGVNAVLETIKNDQNTPNLEKSKMLEATVAIVLNSENLEPKQKQQMLEKAVDVGLSLKDDASRAAAIDGIKDVVIKSNLSPEDKMLIAVGDKVNVSELSNAEKQKLLGSVLKKGVEAQVLSPAQQQLMQQHLYKIMAEQTKKDTIKKVNDILFDPLSNTELKTTNIQAITSNVLDGPATAEVKGEIIQAITNTIAGSSLEAQDKAAIIKGVGETIATHSDTSLSLPNKALIMASAEKGIAESQTNLPDRELMTKGLVDGIYEGKGGPEITKAVSSGIDNSNINDSEKEALKKAKDAASEAALDRDTQNLTEGFKGQNIEEHKPHDDIYNKAREVINAVNPVIEALEKSKEPVVSAEERIVQETSSILNNISKLAVEKVNNFRAMLSPNGNLKTLEEKKEEAIKKVDELVKAFGTKSSTEEQQSFIKTNLIDDKTLSKEVRLQTIDKLLQEQKRSEAIENPSVKTEDVRVVSGKSKLKPISKDNPDIEKAKMVVGRDRVNIKGNIKIMGALMNARDIIQSENLNKSTPIKRESSPPQR GT:EXON 1|1-1026:0| SW:ID SCA4_RICCN SW:DE RecName: Full=Antigenic heat-stable 120 kDa protein;AltName: Full=120 kDa antigen;AltName: Full=Protein PS 120; Short=PS120;AltName: Full=RCA; SW:GN Name=sca4; OrderedLocusNames=RC0667; SW:KW Complete proteome; Cytoplasm. SW:EXACT F SW:FUNC + BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 5->1026|SCA4_RICCN|0.0|100.0|1022/1022| GO:SWS:NREP 1 GO:SWS GO:0005737|"GO:cytoplasm"|Cytoplasm| SEG 22->38|keyteeqkqtleqeqke| SEG 119->133|eqkrkeieeekekdk| SEG 763->792|ssgidnsnindsekealkkakdaaseaald| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 365->424|1ej6B|8e-07|16.4|55/1031| RP:PDB:REP 811->948|1dg3A|8e-04|21.9|128/540| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 244->282|PF12574|1e-18|100.0|39/39|120_Rick_ant| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 244->282|PF12574|7.9e-26|71.8|39/39|120_Rick_ant| HM:PFM:REP 312->328|PF10636|9.5e-05|47.1|17/38|hemP| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 364->419|1r5sA|3e-04|10.7|56/132|f.50.1.1| OP:NHOMO 17 OP:NHOMOORG 15 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111122111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 183 STR:RPRED 17.8 SQ:SECSTR ############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################EEEcTTccEEcH###HHHHHHHHTcccccEE##cEEEEEEcccccccccccEEEEEEEcc##################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHHHHHcccccTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcTTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH####HHHHHHHHHHHHHHH######HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHH############################################################################## DISOP:02AL 1-7, 26-41, 63-81, 123-129, 293-295, 357-358, 360-364, 374-376, 394-413, 769-783, 805-807, 837-852, 1012-1026| PSIPRED cccccccccccccHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEccccccccccEEEEEcccccccccccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEccccccHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccEEEEEEccccccEEEccccEEEcccEEEEcccccEEEEEcEEEEcccEEEEcccccEEEEEEEEEccccccccccEEEEEEEEccccccccccccccccccEEEEccccHHHHHEEcccEEEEEEEccHHHHHHHHHHHHcccccccHHHcccEEEEccccccccEEccccHHHccccccccccccccccccccccccHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccEEEEccHHHHHHHccccccccEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEccHHHccccccccccHHHHHEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccc //