[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Rickettsia conorii str. Malish 7 (rcon0)
Gene : valS
DDBJ      :valS         valyl-tRNA synthetase
Swiss-Prot:SYV_RICCN    RecName: Full=Valyl-tRNA synthetase;         EC=6.1.1.9;AltName: Full=Valine--tRNA ligase;         Short=ValRS;

Homologs  Archaea  68/68 : Bacteria  910/915 : Eukaryota  197/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.27.1b.51.1b.63.1c.26.1
:812 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   27->764 1gaxA PDBj 3e-74 29.3 %
:RPS:PDB   6->808 2bteA PDBj 1e-84 18.7 %
:RPS:SCOP  35->107 1euqA2  c.26.1.1 * 6e-12 17.8 %
:RPS:SCOP  83->190 1a1xA  b.63.1.1 * 1e-24 19.8 %
:RPS:SCOP  191->340 1gaxA2  b.51.1.1 * 2e-46 32.7 %
:RPS:SCOP  315->584 1ileA3  c.26.1.1 * 1e-31 23.3 %
:RPS:SCOP  587->797 1gaxA5  a.27.1.1 * 7e-37 27.6 %
:HMM:SCOP  5->584 1h3nA3 c.26.1.1 * 9.4e-111 35.9 %
:HMM:SCOP  586->805 1ffyA1 a.27.1.1 * 1.7e-39 30.4 %
:RPS:PFM   39->571 PF00133 * tRNA-synt_1 4e-93 39.0 %
:RPS:PFM   624->764 PF08264 * Anticodon_1 2e-18 35.3 %
:HMM:PFM   16->573 PF00133 * tRNA-synt_1 5.2e-120 32.4 550/601  
:HMM:PFM   624->771 PF08264 * Anticodon_1 2.7e-33 35.0 143/152  
:BLT:SWISS 1->812 SYV_RICCN 0.0 100.0 %
:PROS 46->57|PS00178|AA_TRNA_LIGASE_I
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAL03591.1 GT:GENE valS GT:PRODUCT valyl-tRNA synthetase GT:DATABASE GIB00062CH01 GT:ORG rcon0 GB:ACCESSION GIB00062CH01 GB:LOCATION 976191..978629 GB:FROM 976191 GB:TO 978629 GB:DIRECTION + GB:GENE valS GB:PRODUCT valyl-tRNA synthetase GB:PROTEIN_ID AAL03591.1 GB:DB_XREF GI:15620172 GB:GENE:GENE valS LENGTH 812 SQ:AASEQ MKEFPKNYNFTENEKKWQQIWQEKQIYAYNPNAAKEETYVIDTPPPTVSGQLHIGHVYSYTQTDFIVRFQRMMGKNIFYPMGFDDNGLPTERLVEKQKQIKAYNMDRSEFIKICEEVVESEEEKFRSLFNQIALSVDWSLEYQTISPLSRKISQMSFLDLVQKEEIYRTNQPILWDPVDGTALAQADIEDKEKTSFMNYITFKTEQGDPLTIATTRPELLPACVAVFYHPDDGRYKHLAGKSAITPLFNEQVPLLTDPLVRQDKGTGLVMCCTFGDQTDITWWKTHNLPLKTIITKKGTIDFQHETSIDGLKIKEARTKIIDILKEQELLIKQEDITHTVKCAERSGAPLEILTVPQWFVKTISHKEELLKRANELNWHPKHMKIRLENWINAISWDWCISRQRYFGVPFPVWYSKRVGEEGKILYADVTQLPIDPLKDLPMGYSKEEVEPDYDVMDTWATSSVSPQLSTHGISDDFAVNKDRHDKLFPMDLRPQAHEIIRTWAFYTILKAHLHQNTLPWKNIMVSGWCLAEDRSKMSKSKGNVLVPEKLLEQYGSDVIRYWSANSKLGADTAYSEDVMKNGKRLVNKLWNAAKFVFIHFDKLKGEDKKASLLDIKEKITNEFDKWMVNKLVELVKLATNELQNYEYANAMHLTEKFFWVVLCDNYLEISKTRSYDEEHKNPQGQYSSILTLYHVMQTLLKLFAPFMPHITEELYQILYSENSIHVKGSWVNYSDLNYEINAKGAEGLLEILDIVRKFKAEKNLSIKTPIKLLEVSGIVLSAELTEDLKNVTSAEEIQFEMKDDKIKVNIIL GT:EXON 1|1-812:0| SW:ID SYV_RICCN SW:DE RecName: Full=Valyl-tRNA synthetase; EC=6.1.1.9;AltName: Full=Valine--tRNA ligase; Short=ValRS; SW:GN Name=valS; OrderedLocusNames=RC1053; SW:KW Aminoacyl-tRNA synthetase; ATP-binding; Complete proteome; Cytoplasm;Ligase; Nucleotide-binding; Protein biosynthesis. SW:EXACT T SW:FUNC + BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->812|SYV_RICCN|0.0|100.0|812/812| GO:SWS:NREP 6 GO:SWS GO:0004812|"GO:aminoacyl-tRNA ligase activity"|Aminoacyl-tRNA synthetase| GO:SWS GO:0005524|"GO:ATP binding"|ATP-binding| GO:SWS GO:0005737|"GO:cytoplasm"|Cytoplasm| GO:SWS GO:0016874|"GO:ligase activity"|Ligase| GO:SWS GO:0000166|"GO:nucleotide binding"|Nucleotide-binding| GO:SWS GO:0006412|"GO:translation"|Protein biosynthesis| PROS 46->57|PS00178|AA_TRNA_LIGASE_I|PDOC00161| SEG 14->26|ekkwqqiwqekqi| SEG 115->123|eevveseee| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 27->764|1gaxA|3e-74|29.3|702/862| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 6->808|2bteA|1e-84|18.7|748/876| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 39->571|PF00133|4e-93|39.0|521/593|tRNA-synt_1| RP:PFM:REP 624->764|PF08264|2e-18|35.3|136/153|Anticodon_1| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 16->573|PF00133|5.2e-120|32.4|550/601|tRNA-synt_1| HM:PFM:REP 624->771|PF08264|2.7e-33|35.0|143/152|Anticodon_1| GO:PFM:NREP 12 GO:PFM GO:0000166|"GO:nucleotide binding"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0004812|"GO:aminoacyl-tRNA ligase activity"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0005737|"GO:cytoplasm"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0006412|"GO:translation"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0006418|"GO:tRNA aminoacylation for protein translation"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0000166|"GO:nucleotide binding"|PF08264|IPR013155| GO:PFM GO:0004812|"GO:aminoacyl-tRNA ligase activity"|PF08264|IPR013155| GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF08264|IPR013155| GO:PFM GO:0005737|"GO:cytoplasm"|PF08264|IPR013155| GO:PFM GO:0006412|"GO:translation"|PF08264|IPR013155| GO:PFM GO:0006418|"GO:tRNA aminoacylation for protein translation"|PF08264|IPR013155| RP:SCP:NREP 5 RP:SCP:REP 35->107|1euqA2|6e-12|17.8|73/331|c.26.1.1| RP:SCP:REP 83->190|1a1xA|1e-24|19.8|96/106|b.63.1.1| RP:SCP:REP 191->340|1gaxA2|2e-46|32.7|150/153|b.51.1.1| RP:SCP:REP 315->584|1ileA3|1e-31|23.3|266/452|c.26.1.1| RP:SCP:REP 587->797|1gaxA5|7e-37|27.6|192/218|a.27.1.1| HM:SCP:REP 5->584|1h3nA3|9.4e-111|35.9|410/495|c.26.1.1|1/1|Nucleotidylyl transferase| HM:SCP:REP 586->805|1ffyA1|1.7e-39|30.4|214/273|a.27.1.1|1/1|Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases|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n*62756544394583355326116443448IG67563857D96555355r5555556BA5555585645 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 807 STR:RPRED 99.4 SQ:SECSTR #ccEEccccHHHHHHHHHHHHHHHTcccccccccTTcEEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcEEEcccccccccHHHHHHHHHTTccHHHHHHHHHHHHHHTTTcTTHHHHHHHHHHHTTccccGGGcccTTcHHHHHHHHHHHHHHHHTTcEEEEEEEEEEETTTTEEEcGGGcTTcEEEEEEEEEcGGGGHHcEEEEEEccGGGGGGccEEEEcTTcTHHHEEEEEEEEcTTTccEEEEEEcTTccTTcTTcEEEEcGGGcHHHHHHHHHTTccccccEEcccccEEcccGGGTTccHHHHHHHHHHHHHHHTcEEEEEEccccccccEEcccccccHHccEEEETTEcccTTccccHHHHccccccGGGGcHHHHEEEccccccEEEcHHHEccTTTHHHHTTcccccHHHHHHHccccEETTTHHHHHHHHHHHHHHTTcccccccccccEEcccEEEcccHEEEEEEEEETTEEEccHHHHHHHcccccEEEHHHHHHTTcEEEEcTTccEEEEEcccccTTTTccccHHHHHHHccHHHHHHHHHcccTTccEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHTcccccccTTcHHHHHTcccTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHTTTcHHHHHHHHHTTcHHHHHHHcccGGGTccccccHHHHccccEEEEEEETTEEEEEEEEcccccHHHHHHHHHTTccccHHHHHcccccEEEEETTTEEEEEc#### DISOP:02AL 1-2| PSIPRED cccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccEEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEccEEEEEEccccccccHHHHHHccccccEEEEEEEEcccccccEEEccHHHHHHccEEEEccccccHHHHcccEEEEccccccccEEEccEEcccccccEEEEcccccHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccEEHHHHHHHHHHHHHcccEEEEcccccEEEEEcccccEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEcccHHHHHHHHHHHccccccHHcccccccccccEEEEccccccccEEEEEHHHHHcccHHHcccccccccccccHHHHHHcccccccHHHHcccccccHHHHHHHHHHcccEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHEEEccEEccccEEEEccccccccHHHHHHHccHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHccccEEEEEcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEccccEEEEEEc //