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Ralstonia metallidurans CH34 (rmet0)
Gene : ABF08948.1
DDBJ      :             ATP-dependent helicase HrpA
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  473/915 : Eukaryota  198/199 : Viruses  1/175   --->[See Alignment]
c.37.1c.92.1d.258.1
:1316 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   63->310 2ffhA PDBj 2e-04 28.4 %
:RPS:PDB   70->150 3dnfA PDBj 3e-09 21.0 %
:RPS:PDB   169->557 3dnvA PDBj 9e-55 13.5 %
:RPS:SCOP  66->219 1q1lA  d.258.1.1 * 4e-24 15.2 %
:RPS:SCOP  231->558 1hrkA  c.92.1.1 * 5e-49 11.1 %
:HMM:SCOP  65->623 1lkxA_ c.37.1.9 * 1.6e-94 34.5 %
:RPS:PFM   86->243 PF00448 * SRP54 4e-04 37.6 %
:RPS:PFM   478->556 PF04408 * HA2 1e-21 62.8 %
:RPS:PFM   606->703 PF07717 * DUF1605 2e-11 41.5 %
:RPS:PFM   722->1314 PF11898 * DUF3418 e-159 53.2 %
:HMM:PFM   722->1314 PF11898 * DUF3418 2.3e-238 51.2 584/586  
:HMM:PFM   476->558 PF04408 * HA2 7.6e-26 41.5 82/101  
:HMM:PFM   583->710 PF07717 * DUF1605 3.1e-20 36.9 103/105  
:HMM:PFM   329->414 PF00271 * Helicase_C 3.3e-12 32.4 68/78  
:HMM:PFM   76->231 PF00270 * DEAD 4.7e-08 27.2 147/167  
:BLT:SWISS 60->1314 HRPA_ECOLI 0.0 47.5 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABF08948.1 GT:GENE ABF08948.1 GT:PRODUCT ATP-dependent helicase HrpA GT:DATABASE GIB00349CH01 GT:ORG rmet0 GB:ACCESSION GIB00349CH01 GB:LOCATION complement(2241601..2245551) GB:FROM 2241601 GB:TO 2245551 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT ATP-dependent helicase HrpA GB:PROTEIN_ID ABF08948.1 GB:DB_XREF GI:93354859 InterPro:IPR001410 InterPro:IPR001650 InterPro:IPR003593 InterPro:IPR007502 InterPro:IPR010222 InterPro:IPR011545 InterPro:IPR011709 LENGTH 1316 SQ:AASEQ 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membrane"|PF00448|IPR000897| GO:PFM GO:0004386|"GO:helicase activity"|PF04408|IPR007502| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 66->219|1q1lA|4e-24|15.2|151/336|d.258.1.1| RP:SCP:REP 231->558|1hrkA|5e-49|11.1|307/359|c.92.1.1| HM:SCP:REP 65->623|1lkxA_|1.6e-94|34.5|502/0|c.37.1.9|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 3582 OP:NHOMOORG 672 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 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7857AAB1WDC5A6E7A9899998599AA9989AB9AAAAAAA999AA88BB9A99988999777777277577477477767778A9-BI9AAA9AAA98CAB9A4CR6QMUKQJSGFGGIHGVSFUFy*J6UReEDGHMHHLJBIIHBJDFUGHOHHIXXDEBEHFDFlEBIA69DK*FFGCCDCGM9NJ9B9CCCG --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2---- STR:NPRED 514 STR:RPRED 39.1 SQ:SECSTR ##########################################################HGGGccccHHHHHHHHHHHHHHHTccEEEEEEccTTccHHHHHHHHHHHHHHHHcccTTTHcccccHHHHHHHTTHHHHHHHHEEcccccTTEEccEEEEHHHHHHccEEEEEccccEEEEcTTccEEEEEcHHHHHccccccccTTccccccccccHHHHHHHTTccccHHHHHHHHHTTcccccHHHHHHHHccEEcTTcEEEEccccTHHHTccHHcccccccEEEccHHHHHHHHHHTTccccEEccccccEEEEEEETTEcccccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHTTcccccccEEEEEETTEEEEEEEcccEEEcTTcccEEEccEEEHHHHcGGGccTTTTcccHHHHHHHTcTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcccccGGGcEEcccccccccTTccccccccGGGcEEEEEEEccccEEEEGGGccHHHHHHHHHHHTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTccE######################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 1-54,716-729,1265-1274,1316-1317| PSIPRED ccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHcccccccccccccccccHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEccccccccccEEEEEcHHHHHHHHHcccccccccEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEcccccHHHHHHHHccccccccEEEEcccEEEEEEEEccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEccHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEcccccHHHHHHHHccccccEEEEEccHHHcccccccEEEEEEcccccccccccccccEEEEEEEccHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEcHHHHHcccccccHHHHHccHHHHHHHHHHcccccHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEccccEEEEEcccHHHcccccccEEEEHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHcccEEEccccccHHHccHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEcHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHccHHccccccccHHHHcccccccccHHHcccEEEEccEEEEEEEEccccccccccEEEccHHHcccccHHHccccccHHHHHHHHHHHHHccHHHHcccccccHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHccHHHccHHHEEEEEEEEccccEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccEEEEEEccEEEEEEEEEEEcccEEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHccHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHcc 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