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Ralstonia metallidurans CH34 (rmet0)
Gene : ABF09023.1
DDBJ      :             binding-protein-dependent transport systems inner membrane component
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  54/68 : Bacteria  741/915 : Eukaryota  6/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.58.1
:376 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   247->276 3dhwA PDBj 2e-06 26.7 %
:RPS:SCOP  114->348 2r6gG1  f.58.1.1 * 1e-21 13.2 %
:HMM:PFM   171->352 PF00528 * BPD_transp_1 2.5e-30 31.4 172/185  
:HMM:PFM   29->43 PF11587 * Prion_bPrPp 0.00067 60.0 15/29  
:BLT:SWISS 33->349 YEJE_ECOLI 9e-80 44.3 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ABF09023.1 GT:GENE ABF09023.1 GT:PRODUCT binding-protein-dependent transport systems inner membrane component GT:DATABASE GIB00349CH01 GT:ORG rmet0 GB:ACCESSION GIB00349CH01 GB:LOCATION complement(2335904..2337034) GB:FROM 2335904 GB:TO 2337034 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT binding-protein-dependent transport systems inner membrane component GB:PROTEIN_ID ABF09023.1 GB:DB_XREF GI:93354934 InterPro:IPR000515 LENGTH 376 SQ:AASEQ MNPFKRAPIQNGLPHSLSPRQRAWQRFRRNRLGYWSLILFVALFVLSLCAEVLSSDRPLLVRYKGEYYLPIAKVYPETTFDGDFPTRTDYLDPFILERITTHGNFAIFPLNRYSYDSINYFAKEPNPAPPSAENWLGTDDRGRDVLARLLYGFRVSVLFGLALTVIGVLVGTLTGALMGFFGGRFDLMSQRAIEIWGSMPELYLLIIFASIFEPSLALLIILLSLFGWMGLSDYVRAEFYRNRSLDYVKSARALGLSNVQIMWRHILPNSLTPVITFLPFRMSAAILALTSLDFLGLGVPPTTPSLGELLAQGKANLDAWWISLSTFAVLVLTLLLLTFMGDALRDAFDTRMGLAQMRGRVAPKVPARGGAAEAVR GT:EXON 1|1-376:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 33->349|YEJE_ECOLI|9e-80|44.3|316/341| TM:NTM 4 TM:REGION 32->54| TM:REGION 143->165| TM:REGION 205->227| TM:REGION 322->344| SEG 20->31|rqrawqrfrrnr| SEG 215->225|slalliillsl| SEG 329->338|vlvltllllt| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 247->276|3dhwA|2e-06|26.7|30/203| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 171->352|PF00528|2.5e-30|31.4|172/185|BPD_transp_1| HM:PFM:REP 29->43|PF11587|0.00067|60.0|15/29|Prion_bPrPp| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 114->348|2r6gG1|1e-21|13.2|235/284|f.58.1.1| OP:NHOMO 3146 OP:NHOMOORG 801 OP:PATTERN 44313131434332312333321-3334415211---1-----112-52-DA4-544311122-3-11 11-4B353344-3113322-2311272222223222267816357B84233158532411442365466621111511323-311111--------2--------11--122222222222222211111111121344842216933213332222------32115222--1-------1-A5333541423666664564546445A76663655324C511222222E5155555555655556333222222331-12111--33111111233333333311112211111112222222222222231112211111C35244434541422222111153133A-111BA531-282-2141164311----111-131HHO114754B1AAAAA998AAL-2392382ANM1-hPPUHGCUSKNOK4-1148B96996AD--------13312119--------------------------------1--CFCBC57777544444558855552566B64A5113342352253C5BO241132242-------111111335132352233331111111211----12111-1-------112212221112-12--332-21-1--511111-1-111111-1111--13111------66JC2866666666666-6666666666666666665898B82245655555555545455866556463-444444444444---11-1-1111111746222-1222221312222222121122233233446143322ABA1----1---245566666656688--1-------------12111111111111127-1-12-1-11-1------1--122111323436B655212 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----2------1--1---1-------1------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 30 STR:RPRED 8.0 SQ:SECSTR ######################################################################################################################################################################################################################################################TTTHHHHHTccTHHHHHHTTHHHHHHHHHH#################################################################################################### DISOP:02AL 1-4,8-23,352-377| PSIPRED ccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEccEEEccEEccccccccccccccccccccHHHHHHHHccccEEEEcccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHcccHHHHHcccccccccccHHHcc //