[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Ralstonia metallidurans CH34 (rmet0)
Gene : ABF09215.1
DDBJ      :             conserved hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  13/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1
:874 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   580->705 1e69A PDBj 4e-04 26.8 %
:RPS:PDB   583->696 1e69A PDBj 2e-06 19.6 %
:RPS:SCOP  81->128,535->707 1w1wA  c.37.1.12 * 2e-12 21.3 %
:HMM:SCOP  81->724 1w1wA_ c.37.1.12 * 1.2e-23 16.2 %
:HMM:PFM   83->707 PF02463 * SMC_N 4.9e-15 20.2 208/220  
:BLT:SWISS 82->198 RECF_CHLT3 9e-06 34.6 %
:BLT:SWISS 465->568 KLC_CAEEL 6e-05 28.4 %
:BLT:SWISS 641->716 AB4C_ARATH 1e-05 33.3 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABF09215.1 GT:GENE ABF09215.1 GT:PRODUCT conserved hypothetical protein GT:DATABASE GIB00349CH01 GT:ORG rmet0 GB:ACCESSION GIB00349CH01 GB:LOCATION complement(2551962..2554586) GB:FROM 2551962 GB:TO 2554586 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT conserved hypothetical protein GB:PROTEIN_ID ABF09215.1 GB:DB_XREF GI:93355126 InterPro:IPR003439 LENGTH 874 SQ:AASEQ MASIRSEYHRFLAHLAQRHVHDDVRRLAHLVLDHLQPLAEVGAARRGRSTRLAPLAIAHLAQMPVAYDGDARGPENGPALGRLHQLEVGPFRGFMRQETFDLSHDITLVYGANGTGKSSFCEALEVAMLGSISEAQAKRVDQRTYCNNARLRRHVAPVLSSTAAGEAQAVQPDEAEYRFCFIEKNRLDDFARIAARTPSDQRQLIATLFGVDQFSEFVRGFNPSLDQDLMLAGVQAAQLAQRRLRLANSEQTIAAYPQKIAAVEGLEQALAQRMSPGATYQACVDWLLGTPQQQGRLPYVQAQLDANPPAIHEVTQARLQALLAEAYRVQGLWQASSAQLAARAGEVSYAKLYEAVQALADGATACPACGTGLAAVAQDPFARARMGLEQLAQLAVLQQQEAGHRTQLSEAVRALWDEMRRVVAAAGVACPAESQAAGLPLLPPTSAGNWLGGWVNGDQRAWQALLRIAQIIEGFDAQARDVHAQRGAMAQERDRLQQHQLEIERLRTMRTTADQELAAARQTVAQFDDANRGLIQAATDEMPVVVHHQRVKAAYDGFLPEIQAYLTALPGVLLQGLGDQARHLYNAFNRADPPGDLLHALWLPVAENGKIEVEFAGEPGVRYDALIVFSEGHIKCLGLAILLAKNLAQGCPVVIFDDVVNAIDDDHRDGIWRTFFEDGLLHGKQVILTSHAEEFLHRIQQELGVRRAAAIKRYKFLPHQGEHELRVDSDPPAKNYVLLAQQALAADEKREALRQARPALESLTDRLWTWLGRRADGRIDIKLSGPRAPWELNNKCTKLRSAVERIAAQHAGAPDAVGALVRLLNVSGTSIEWGYLNSGVHDAQRDHEFDRATVRTVVEAVTALDAALDTLQNR GT:EXON 1|1-874:0| BL:SWS:NREP 3 BL:SWS:REP 82->198|RECF_CHLT3|9e-06|34.6|107/368| BL:SWS:REP 465->568|KLC_CAEEL|6e-05|28.4|102/540| BL:SWS:REP 641->716|AB4C_ARATH|1e-05|33.3|75/1516| COIL:NAA 31 COIL:NSEG 1 COIL:REGION 493->523| SEG 235->247|qaaqlaqrrlrla| SEG 388->402|leqlaqlavlqqqea| SEG 851->871|ratvrtvveavtaldaaldtl| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 580->705|1e69A|4e-04|26.8|123/263| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 583->696|1e69A|2e-06|19.6|112/263| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 83->707|PF02463|4.9e-15|20.2|208/220|SMC_N| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 81->128,535->707|1w1wA|2e-12|21.3|217/274|c.37.1.12| HM:SCP:REP 81->724|1w1wA_|1.2e-23|16.2|377/0|c.37.1.12|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 13 OP:NHOMOORG 13 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------1--------1---1---1--------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1--1--1------1------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 212 STR:RPRED 24.3 SQ:SECSTR ###################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHTccHHHHHHHHHHHHHHHTccEEEcccEEEcTTcccccGGGccHHHHHHHHHHHHHHHTTTccccEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHTcHTTTcEEEEEcccTTGGTccccEEEEEEEEccTTcccccEEEEEEHTTcccccccEEEEEEccccHHHH#THHHTccEEcGGGGccTGGTccccccccEEEEcccHHHHHHHH################################################################################## DISOP:02AL 1-6,398-407,873-875| PSIPRED cccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccEEEEEEcccccccccccccccccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHccccHHHcccccEEEccccccccEEccccccccHHHEEcHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHcccccEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHccccccHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHcccccccEEEEEEcccccccccHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHccccEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHcccccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcc //