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Ralstonia metallidurans CH34 (rmet0)
Gene : ABF09535.1
DDBJ      :             Phage/plasmid primase P4-like protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  9/68 : Bacteria  168/915 : Eukaryota  1/199 : Viruses  16/175   --->[See Alignment]
a.4.5c.37.1d.90.1
:632 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   384->548 3gyuA PDBj 6e-04 27.3 %
:RPS:PDB   547->593 1dp7P PDBj 2e-07 21.3 %
:RPS:SCOP  263->336 2ifaA1  d.90.1.1 * 6e-04 16.4 %
:RPS:SCOP  364->521 1s9hA  c.37.1.20 * 7e-09 17.0 %
:RPS:SCOP  547->593 1dp7P  a.4.5.20 * 3e-08 21.3 %
:HMM:SCOP  318->517 1tueA_ c.37.1.20 * 6.1e-10 18.9 %
:RPS:PFM   262->335 PF08706 * D5_N 4e-08 29.7 %
:RPS:PFM   541->593 PF03288 * Pox_D5 6e-05 32.1 %
:HMM:PFM   218->334 PF08706 * D5_N 8.2e-13 22.2 117/150  
:HMM:PFM   540->593 PF03288 * Pox_D5 7.1e-10 27.8 54/86  
:BLT:SWISS 260->508 PRIM_BPP4 7e-24 30.9 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ABF09535.1 GT:GENE ABF09535.1 GT:PRODUCT Phage/plasmid primase P4-like protein GT:DATABASE GIB00349CH01 GT:ORG rmet0 GB:ACCESSION GIB00349CH01 GB:LOCATION complement(2896361..2898259) GB:FROM 2896361 GB:TO 2898259 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT Phage/plasmid primase P4-like protein GB:PROTEIN_ID ABF09535.1 GB:DB_XREF GI:93355446 InterPro:IPR004968 InterPro:IPR006500 LENGTH 632 SQ:AASEQ MPYLSFFENIHQVKNFDGDECSFETLVETFKEDEREEKEKKGGFVFNGSVYPVGASRVLKNIKEVRLIILDYDNLGPDDPETLWRQLKSYQSVLYTTHRHTIEKPKLRAIVVPSKPIPPSEYKTAVTRLGQHIGLEYDPVSKNPNQVYYFPTCPPGTKEMHFTRINADGSELDLESLPPVTMTKATTKGKRVVSSEEDEKNLYTLATQVVETEFPDGLVFVRDVFYEYRDGYWQEVDNWSLKQKLTNDDSPYAALLPNPGAVNSLIDALKARTSLVKFPDPKPLTLCLQNAVLDIATGSQMPHAPDYWHRNLLDIQYHEDDVCPLWQRFLDETFAGDADGSEKKLFLQEFMGYLLVPSTEAQMMLWMIGSGANGKSVVIEVMQSLLGADNHSSVPLDSLGQDFKKAVLQGKLANFCPEISGSRRIDEATIKSIVGGDEIYAEKKGKDGFSFRAYARIVAAGNALPDVGDTSHGFFRRLTILRFNRQLSVEEMDRELPEKLKNELSGILAWALAGLKRFREQKRFTDVPSSRAFVSSYKLQSNPVEVFLTECTKVVAGKKTLKSDVYASYKAFCQEGGHQPLANNKFGAALSELGYAAKASNGKGYYPLVLAGGNATAYSRKLDVVEVLEDDE GT:EXON 1|1-632:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 260->508|PRIM_BPP4|7e-24|30.9|243/777| SEG 28->41|etfkedereekekk| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 384->548|3gyuA|6e-04|27.3|161/234| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 547->593|1dp7P|2e-07|21.3|47/76| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 262->335|PF08706|4e-08|29.7|74/145|D5_N| RP:PFM:REP 541->593|PF03288|6e-05|32.1|53/69|Pox_D5| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 218->334|PF08706|8.2e-13|22.2|117/150|D5_N| HM:PFM:REP 540->593|PF03288|7.1e-10|27.8|54/86|Pox_D5| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 263->336|2ifaA1|6e-04|16.4|67/199|d.90.1.1| RP:SCP:REP 364->521|1s9hA|7e-09|17.0|153/268|c.37.1.20| RP:SCP:REP 547->593|1dp7P|3e-08|21.3|47/76|a.4.5.20| HM:SCP:REP 318->517|1tueA_|6.1e-10|18.9|196/205|c.37.1.20|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 246 OP:NHOMOORG 194 OP:PATTERN --------1-----12---------1--1---------------11-1----1--------------- --------11-------1--------11-1-------------1----------------2--1----2---------------------------------1---------------------------1------------1---12----------1---------1---------------------32--------------1-1-11--------21--1---21-----1-----1----11--211----1-11----11--13-1--113-2---1---------1--2----3121-231221-111--1111-----------1--1--331-----4-----1---1--1------------------------11-2--------------------1121-2-1-----------------1-----211-----11111111----------------------------------------1--------22---1---------------1----1----2----11-1----1----1------------------12----3123-----1----1-----1--------------------------------------------1------1---------------------1---1--111-------12--212-2-1-------1----21--11-1---2---1-11--1--1111---11111111111-------------1-1------1-------1-------------------------------------------------------1---------2111------------------------------1---------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------1---------------------111----------------------------------------1------------11----------1------------------11111--------------11-1----------------------- STR:NPRED 206 STR:RPRED 32.6 SQ:SECSTR ###############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHccccc##HHHHHHHHHHHHHHHHHTcTTGGGccHHHHHHHHHHHHHHHHHHTEETTTTEEEcTTcTTcEEEGGGGGcTTTHHHHHHHHHHHHTccHHcTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcGGGHHHHHHHHH##HHHHHHHHHHHTTTTTHHHHHEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHTTcccccHHHHHHHHHHH####################################### DISOP:02AL 1-1,32-42,190-191,630-633| PSIPRED ccHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEccccccccccHHccccccEEEEEEEcccccccHHHHHHHHHccccEEEEccHHcccccccEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHccccccccccHHEEEEEEccccccccccccccccHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccEEEccccEEEEEccEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEccEEEEccccEEcccccccEEEEccccccccccccHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHcccccEEEccHHHHcccccHHHHHccEEEEEEcccccEEEEHHHHHHHccccEEEEEEcccccEEEEEccEEEEEcccccccccccccEEEEEEEEEccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHccccccEEEHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEEEccccccccEEEEEEEEEccccc //