[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Rhodopseudomonas palustris BisB5 (rpal2)
Gene : ABE37305.1
DDBJ      :             chemotaxis sensory transducer
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  19/68 : Bacteria  450/915 : Eukaryota  5/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.138.1a.216.1a.274.1h.4.5
:688 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   340->385 2aswA PDBj 6e-07 43.5 %
:BLT:PDB   561->681 2ch7A PDBj 3e-13 26.4 %
:RPS:PDB   338->385 2aswA PDBj 3e-05 41.7 %
:RPS:PDB   410->681 2ch7B PDBj 1e-24 21.3 %
:RPS:SCOP  340->382 2aswA1  a.274.1.1 * 7e-05 44.2 %
:RPS:SCOP  476->543 1u89A1  a.216.1.1 * 6e-05 13.2 %
:RPS:SCOP  561->663 1oahA  a.138.1.3 * 7e-21 7.8 %
:HMM:SCOP  398->682 2ch7B1 h.4.5.1 * 8.7e-67 34.5 %
:RPS:PFM   319->376 PF00672 * HAMP 5e-07 40.4 %
:RPS:PFM   498->681 PF00015 * MCPsignal 8e-14 31.0 %
:HMM:PFM   481->681 PF00015 * MCPsignal 3e-41 31.3 201/213  
:HMM:PFM   319->385 PF00672 * HAMP 1.5e-15 36.4 66/70  
:HMM:PFM   423->494 PF06008 * Laminin_I 0.00025 20.8 72/263  
:HMM:PFM   91->313 PF10436 * BCDHK_Adom3 2.7e-05 20.8 106/164  
:BLT:SWISS 321->681 Y4FA_RHISN 7e-20 32.1 %
:TM
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABE37305.1 GT:GENE ABE37305.1 GT:PRODUCT chemotaxis sensory transducer GT:DATABASE GIB00345CH01 GT:ORG rpal2 GB:ACCESSION GIB00345CH01 GB:LOCATION 76970..79036 GB:FROM 76970 GB:TO 79036 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT chemotaxis sensory transducer GB:PROTEIN_ID ABE37305.1 GB:DB_XREF GI:91681003 InterPro:IPR000727 InterPro:IPR003660 InterPro:IPR004089 LENGTH 688 SQ:AASEQ MTIKTTRSSEPRTSGLLDLFTNRKIGTKVAVGFVLIQVLMVVLAVLNYFSFENVRQAFVALDQRVQVVGIVRDVDRGFTAFRRFVREYSLTGDEALIHEAESRQNALRESIAQGLKEIHDPSRLAKMREISQTFEAYTTSFADVIRMRREQSTLIREVLDPTGQKARLKLEQLQAATTAEVGGETTSLLVAEAVKQLLLLRIDVNKVLGRHDQAAADAAEKALVDLRGAMSALKIAIGSSAGRKQIGEIEVDIKNYADAYQKASRVAHEVEVLVNGAMPKVATVIADGAASIKQSGIADQQMIAKNTEALLDDTKSQILIITVGAVAIGLVLAWLIGRAISRPIIRMSGAMKELAGGNLRVDVPGSGRLDEIGLMACTVEVFKRNALEVERLKTEQEEAESRVAAEHKAEMHRLADNFEGAVGEIIQTVTSASTELEASAGSLTTTADRSQQLATTVAAASEQASANVQSVASATEEMASSISEISRQVQTSARIAGEAVDQARKTNDRIGQLADAANRIGDVVDLINTIAGQTNLLALNATIEAARAGDAGRGFAVVAQEVKALAEQTAKATGEISQQVSGMQAATQDSVGAIREIGGTIERMSEIASTIASAVEEQGAATQEISRNVQQAAQGTQQVSSNICDVQRGATETGSASTQVLAAVQSLSRDSNRLKDEVTRFVETVRAA GT:EXON 1|1-688:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 321->681|Y4FA_RHISN|7e-20|32.1|343/845| COIL:NAA 33 COIL:NSEG 1 COIL:REGION 448->480| TM:NTM 2 TM:REGION 27->49| TM:REGION 316->338| SEG 175->186|aattaevggett| SEG 214->222|aaadaaeka| SEG 454->475|attvaaaseqasanvqsvasat| SEG 545->559|aaragdagrgfavva| BL:PDB:NREP 2 BL:PDB:REP 340->385|2aswA|6e-07|43.5|46/56| BL:PDB:REP 561->681|2ch7A|3e-13|26.4|121/309| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 338->385|2aswA|3e-05|41.7|48/56| RP:PDB:REP 410->681|2ch7B|1e-24|21.3|272/307| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 319->376|PF00672|5e-07|40.4|57/69|HAMP| RP:PFM:REP 498->681|PF00015|8e-14|31.0|184/210|MCPsignal| HM:PFM:NREP 4 HM:PFM:REP 481->681|PF00015|3e-41|31.3|201/213|MCPsignal| HM:PFM:REP 319->385|PF00672|1.5e-15|36.4|66/70|HAMP| HM:PFM:REP 423->494|PF06008|0.00025|20.8|72/263|Laminin_I| HM:PFM:REP 91->313|PF10436|2.7e-05|20.8|106/164|BCDHK_Adom3| GO:PFM:NREP 6 GO:PFM GO:0004871|"GO:signal transducer activity"|PF00672|IPR003660| GO:PFM GO:0007165|"GO:signal transduction"|PF00672|IPR003660| GO:PFM GO:0016021|"GO:integral to membrane"|PF00672|IPR003660| GO:PFM GO:0004871|"GO:signal transducer activity"|PF00015|IPR004089| GO:PFM GO:0007165|"GO:signal transduction"|PF00015|IPR004089| GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF00015|IPR004089| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 340->382|2aswA1|7e-05|44.2|43/54|a.274.1.1| RP:SCP:REP 476->543|1u89A1|6e-05|13.2|68/138|a.216.1.1| RP:SCP:REP 561->663|1oahA|7e-21|7.8|103/475|a.138.1.3| HM:SCP:REP 398->682|2ch7B1|8.7e-67|34.5|284/0|h.4.5.1|2/2|Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signaling domain| OP:NHOMO 2606 OP:NHOMOORG 474 OP:PATTERN ------------------------9CD9-1-3---1--26521---12--111-1-1----------- -3-1------------------------------------3---I---8-------------5-D---------------1------1--------------------2-------------------------1----------134454411122------211-2232--------------3------61333334435443454454423355431G35311111174------------------------------------------------------------------------------------------1216733323224252---1---644--1642-6925414711-112---17-8EE6-----41Ylt429SYQRb------------SPaOP3Og-1--EKKSKLGLPP88g-9-8-1--1--58---------5443-vUf------------------------------2442252112333224D434422994444132784653--6572373381441133612-175-------11112238C5L-C54CC88817B767B5873233B22-2----------------------1---77-4551412-4234512-54433423344--11484------66CD1A322212-1-22-22122--2-2212222222---991133134434443434344212-2211--211111111111---1---------11AA6---------------111111-1117356657C8F644498AAC---------21344788782259932646451221111--T644212211--11--4---------------------------1-81132323-1- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------1--------------------------1--1-----1---- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 455 STR:RPRED 66.1 SQ:SECSTR #########################################################################################################################################################################################################################################TcHHTcHHHHHHHHHHHHHHTTEEEEcTHHHHHHHHHHHTTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcTTcHHHHHTTcHHHHHHTTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEETTEEEEEEccccccccccTTTccccHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTccGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHccG DISOP:02AL 1-1,3-7,113-126,295-308,391-518,569-569,571-572,574-606,626-676,686-689| PSIPRED ccccccccccccHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcc //