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Rhodopseudomonas palustris BisB5 (rpal2)
Gene : ABE37829.1
DDBJ      :             DNA helicase, putative
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  12/68 : Bacteria  139/915 : Eukaryota  8/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1c.52.1d.26.1d.92.1
:1629 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   425->578,1115->1405 2wjvB PDBj 3e-06 25.6 %
:RPS:PDB   423->463,1077->1341 3d3xB PDBj 6e-16 8.7 %
:RPS:PDB   441->550 3cwqB PDBj 2e-04 15.0 %
:RPS:PDB   1549->1619 3bmbA PDBj 4e-04 18.3 %
:RPS:SCOP  418->502 1w36D1  c.37.1.19 * 3e-07 21.2 %
:RPS:SCOP  1074->1338 1t3aA  d.92.1.7 * 1e-19 8.0 %
:RPS:SCOP  1409->1502 1cw0A  c.52.1.15 * 4e-11 20.9 %
:HMM:SCOP  332->474 1gkuB1 c.37.1.16 * 1.2e-07 20.6 %
:HMM:SCOP  420->1393 1qhh.1 c.37.1.19 * 3e-35 26.8 %
:HMM:SCOP  1410->1528 1cw0A_ c.52.1.15 * 5e-13 23.3 %
:HMM:SCOP  1548->1623 2f23A2 d.26.1.2 * 7.4e-05 25.0 %
:RPS:PFM   401->555 PF01256 * Carb_kinase 3e-04 31.0 %
:RPS:PFM   1549->1619 PF01272 * GreA_GreB 1e-05 28.2 %
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:HMM:PFM   1427->1505 PF04480 * DUF559 6.3e-06 17.6 74/109  
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:HMM:PFM   674->744 PF03441 * FAD_binding_7 0.00051 25.0 68/277  
:BLT:SWISS 415->538 HCS1_SCHPO 1e-05 33.0 %
:BLT:SWISS 1115->1399 YD002_HUMAN 4e-10 34.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABE37829.1 GT:GENE ABE37829.1 GT:PRODUCT DNA helicase, putative GT:DATABASE GIB00345CH01 GT:ORG rpal2 GB:ACCESSION GIB00345CH01 GB:LOCATION 664209..669098 GB:FROM 664209 GB:TO 669098 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT DNA helicase, putative GB:PROTEIN_ID ABE37829.1 GB:DB_XREF GI:91681527 LENGTH 1629 SQ:AASEQ 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1------------------------1------------21-222----------------------1---1-----------------231---------1----121-----------------21-3211-----------------1----------------------1------------------1--------------------------------------1-1---------------------------------------------------------------------------------------------1-1111111-1---111----1----11---------11------1-------------11133-1--11-1------------11-1---1---1-----1-11--------1----1----1-111111-------1----------------------------------11----111-11--------1----------1------------1111---------------------1--------2----1-1-----1------1---1-1-----------1-------1----1-1------1----1121-11-12211--2-----1--1--------------------------------------------------------------------------------------1----------------11---------------------1------------11121----211------------------------1--1-2----------1-----------------1---------1---111-11---11-1------1----- 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DISOP:02AL 1-11,498-516,519-523,822-825,1061-1077,1516-1522,1524-1534,1537-1537,1539-1539,1629-1630| PSIPRED ccccHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEHHHHccccccccccHHEEEEEccccccccccccccEEEEEEEHHHccccccccHHccccEEEcccccccccHHccccccccHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHcccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEccEEEEcccccEEEccEEEEEcEEEEEcccccEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHccccccHHHHHHHHccccccccHHHcccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHcccHHHcccccccHHHccccccccccHHHHHHHHHHHcccEEccccccccHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEcccHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEccHHHHHHcccccccccEEEEEccccccHHHHHHHHHccEEEEEccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEcccccccHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHccccEEEEEEcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHcccccEEEccHHHHccccccEEEEEEEEcccccccccccccccHHHHHHHHHcccEEEEEEccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHcccEEEEccccccEEEEEEEEccccEEEEEEEccHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHccccHHHccccccccccEEEcccEEEEEEcccccEEEEEEEccccccccccccccHHHHHHcccccccEEEEEEccccccEEEEEEcccccccc 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