[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Rhodopseudomonas palustris BisB5 (rpal2)
Gene : ABE38035.1
DDBJ      :             ATP dependent helicase, Lhr family
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  67/68 : Bacteria  298/915 : Eukaryota  3/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1
:904 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   56->437 2p6uA PDBj 8e-10 28.8 %
:RPS:PDB   15->235 3dkpA PDBj 2e-12 22.1 %
:RPS:PDB   292->474 3earA PDBj 7e-10 21.0 %
:RPS:SCOP  33->154 1gkuB1  c.37.1.16 * 4e-11 23.2 %
:RPS:SCOP  292->479 1gkuB2  c.37.1.16 * 6e-10 10.2 %
:HMM:SCOP  59->444 2bmfA2 c.37.1.14 * 2.7e-47 34.6 %
:RPS:PFM   56->210 PF00270 * DEAD 4e-08 33.1 %
:RPS:PFM   679->868 PF08494 * DEAD_assoc 5e-17 39.2 %
:HMM:PFM   679->868 PF08494 * DEAD_assoc 3.5e-58 40.1 182/187  
:HMM:PFM   54->228 PF00270 * DEAD 4.6e-25 31.2 160/167  
:HMM:PFM   349->420 PF00271 * Helicase_C 2e-15 34.7 72/78  
:BLT:SWISS 35->870 HELX_SULSO 2e-53 27.7 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABE38035.1 GT:GENE ABE38035.1 GT:PRODUCT ATP dependent helicase, Lhr family GT:DATABASE GIB00345CH01 GT:ORG rpal2 GB:ACCESSION GIB00345CH01 GB:LOCATION 895564..898278 GB:FROM 895564 GB:TO 898278 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT ATP dependent helicase, Lhr family GB:PROTEIN_ID ABE38035.1 GB:DB_XREF GI:91681733 InterPro:IPR001410 InterPro:IPR001650 InterPro:IPR011545 LENGTH 904 SQ:AASEQ MAACAGDLRRDDLDSEGANAYLRRVIIADSDVPPDLLPDRFRHWFAARGWSPRAHQLELLEKARAQRSALLIAPTGAGKTLAGFLPTLVELAETSLRAGPEGRGLHTLYISPLKALAVDIARNLEAPIAQMNLPIRVETRTGDTPVSRRTRQRKYPPDILLTTPEQLALLLASDDAPYLFSSLQRIVLDELHALVTSKRGDLLSLGLARLWRIAPDLRATGLSATVADPDELARFLVPQPVSPSPLVGEGGSRGLPGEGEATSAEPAAYPRPSPARGEGEARADIVVAGGAVQPIVEMLDTKERLPWAGHSARHALAEIYDLIKGNKTTLVFVNTRSQAEMLFQELWRMNDDNLAIALHHGSLDVAQRRRVEDAMAAGKLRGVVCTSSLDLGIDWGDIDLVINVGAPKGASRLMQRIGRANHRIDEASRAVLVPANRFEVLECAAAIDAVAENAQDTLPQRKGALDVLAQHILGCACGEPFFANDLYSEVRSAAPYADLTRADFDDTLDFVATGGYALKSYERFARIKLDKQGRWRVANPKVRQGYRLNVGTIVEEAMLKVKLVRSSRSSGTGATGAIARGGRMLGQIEEYFIEGLTPGDTFVFGGEVVRYEAMMEDQVYVSRAADKDARVPSYMGGKFPLSTYLAERVRGLLDDRRAWQGLPEQVRDWLALQSKASRVPGRRELVVETFPRAAKYYLVCYPFEGRLAHQTLGMLLTRRLERSRARPLGFVANEYALAVWGLGDMSQMIRQGRLDLDALFDPDMLGDDLEAWLAESALMKRTFRYAAIISGLIARRFAGEEKSRRQVLFSTDLVYDVLNKHQPDHVLLRAARADAATGLLDLRRLSDMLTRIKGRIVHKELDRVSPLAVPVMLEIGREAVYGEASDELLAEAAEELVREATQRS GT:EXON 1|1-904:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 35->870|HELX_SULSO|2e-53|27.7|773/875| SEG 160->172|llttpeqlallla| SEG 236->260|lvpqpvspsplvgeggsrglpgege| SEG 389->400|ldlgidwgdidl| SEG 565->583|rssrssgtgatgaiarggr| SEG 883->900|easdellaeaaeelvrea| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 56->437|2p6uA|8e-10|28.8|319/671| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 15->235|3dkpA|2e-12|22.1|213/240| RP:PDB:REP 292->474|3earA|7e-10|21.0|167/206| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 56->210|PF00270|4e-08|33.1|145/167|DEAD| RP:PFM:REP 679->868|PF08494|5e-17|39.2|186/190|DEAD_assoc| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 679->868|PF08494|3.5e-58|40.1|182/187|DEAD_assoc| HM:PFM:REP 54->228|PF00270|4.6e-25|31.2|160/167|DEAD| HM:PFM:REP 349->420|PF00271|2e-15|34.7|72/78|Helicase_C| GO:PFM:NREP 5 GO:PFM GO:0003676|"GO:nucleic acid binding"|PF00270|IPR011545| GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF00270|IPR011545| GO:PFM GO:0008026|"GO:ATP-dependent helicase activity"|PF00270|IPR011545| GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF08494|IPR013701| GO:PFM GO:0016818|"GO:hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides"|PF08494|IPR013701| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 33->154|1gkuB1|4e-11|23.2|112/237|c.37.1.16| RP:SCP:REP 292->479|1gkuB2|6e-10|10.2|167/242|c.37.1.16| HM:SCP:REP 59->444|2bmfA2|2.7e-47|34.6|283/0|c.37.1.14|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 482 OP:NHOMOORG 368 OP:PATTERN 2223233333333333322222212112222111211-121113222121111122222222222111 222-11111111-111112-12--1111111-1111111111211121111-1111-1--111-12223311111111--1------------------1-1-11111-1--------------1----1-------1111-----1----------111111--------1---111-1--1--------1-1---------------1-1111---111--1-------11---------------------1-1--1-1-1---------------------------------------------------------------1----------1-------1--1-1---1211--------------1-11111-----11111211111221111111-111-11123211111-11111111111111-1111121112-1--------11--1-1-------------------------------1121------1--1112111111221111-111211--------111111--1---2-----------------1--1----1--11----1--------3122331-------------------------------1--------------------------------1-------------111-1---11-11111--1111-11111111--1---------------------1----1----------------------------1-1-----------------------------11111122122223111------------------------1122222111---------------------------------------------------1---------1- --------21----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 462 STR:RPRED 51.1 SQ:SECSTR ######HHHHHHHHcHHHHHHHHHEEEEccccccccccHHHHHHHHHTTccccHHHHHHHHHHHTTccEEEEccTTccHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHcccccccEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHTTTccHccEEcccHHHHHHTTTcTTccccccEEEEcHHHHHHHHHccccccccTTccEEEEccHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHcccTTcEEEEEEccccHHHHHHHHccc##########################EEcccccHHHHHHccccEEEcccTTEEcEEEEEEccGGGHHHHcccccHHHHHHHHHHHccccEHHHTcccccccccccHHHcHHHHTTccccTTTTcccHHHHHHHHHHHHTTcccHHHHHHHHHTTccTTccGGGTcccGGGcccccccccEEEccTTccEEEccccccccHHHHHHHHTcHHTcccEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHTTccHHHHGGGHHHHHHH########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 1-1,570-573,900-905| PSIPRED cccccccccccccccccccccHHcccccccccccHHccHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEccccHHHHHHHHHcccEEEEEcHHHHEEEEEcccHHHHHHcccEEEEcHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEcccccHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEcccccccEEEEcHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHcccccEEEEccHHHcccccccEEEEEEccccccHHHHHHHHcccccccccccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHcccccHHccccccEEEEcccccEEccccHHHHHHHHccccccccccEEEEEEEcccccccccccHHccccEEEEEEcHHHHHHcccccEEEEcccEEEEEEEEccEEEEEEcccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEEEEEccccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEccEEEEEEcccccccHHHHcccHHHcccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHccEEEEEEccccccccHHHHEEEcccEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcc //