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Rhodopseudomonas palustris BisB5 (rpal2)
Gene : ABE38244.1
DDBJ      :             acriflavin resistance protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  664/915 : Eukaryota  8/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.55.1d.225.1d.58.44f.35.1
:1058 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   10->998 2v50A PDBj 8e-86 27.0 %
:RPS:PDB   6->977 2dhhA PDBj e-152 17.9 %
:RPS:SCOP  65->217 1mwkA2  c.55.1.1 * 2e-24 13.3 %
:RPS:SCOP  230->323 1iwgA2  d.58.44.1 * 8e-14 22.3 %
:RPS:SCOP  317->491 1iwgA7  f.35.1.1 * 1e-35 33.7 %
:RPS:SCOP  547->641 1iwgA3  d.58.44.1 * 2e-09 18.1 %
:RPS:SCOP  691->782 1iwgA6  d.225.1.1 * 1e-13 23.9 %
:RPS:SCOP  787->1000 1iwgA8  f.35.1.1 * 2e-26 23.1 %
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:HMM:SCOP  136->314 1iwgA2 d.58.44.1 * 2.1e-14 35.1 %
:HMM:SCOP  291->491 1iwgA7 f.35.1.1 * 2.3e-42 32.2 %
:HMM:SCOP  547->649 1iwgA3 d.58.44.1 * 7.1e-09 22.5 %
:HMM:SCOP  691->782 1iwgA6 d.225.1.1 * 6.6e-10 34.1 %
:HMM:SCOP  777->1005 1iwgA8 f.35.1.1 * 6.2e-49 30.9 %
:RPS:PFM   5->1000 PF00873 * ACR_tran e-175 37.4 %
:HMM:PFM   6->1000 PF00873 * ACR_tran 1.1e-231 32.2 991/1021  
:BLT:SWISS 9->1006 NOLG_RHIME e-138 32.2 %
:TM
:REPEAT 2|7->485|512->996
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ABE38244.1 GT:GENE ABE38244.1 GT:PRODUCT acriflavin resistance protein GT:DATABASE GIB00345CH01 GT:ORG rpal2 GB:ACCESSION GIB00345CH01 GB:LOCATION complement(1139834..1143010) GB:FROM 1139834 GB:TO 1143010 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT acriflavin resistance protein GB:PROTEIN_ID ABE38244.1 GB:DB_XREF GI:91681942 InterPro:IPR001036 LENGTH 1058 SQ:AASEQ MGLNVSSWSIRHPLPSIVFSIILLALGWISFTKLAVTRLPSADIPVISVAVAQFGAAPAELEAQVTKTIEDGVSGVEGVRHIASSVTDGLSVTTIQFALETNTDRALNDVKDAITRVRSNLPQNVTEPLIQRVDVIGLPIVTYAAISPGKTPEQLSWFVDDVVKRALQGVRGVAQVERIGGVEREILVSLDPDRLKAAGLTALDVSRRLRGTNVDLAGGRAEIGKNDQAIRTLAGAKTLNDLAGTMISLSSGGEIRLDDLGTVTDTIADRRTFARVNGEPVVALGIKRSKGASDVVVASAVQKRIDALKAAHPDVDLKLIDTSVDYTKGNYEAAISTLFEGAILAVIVVFLFLRDIRATVIAAISLPLSIFPAFWAMDMLGFSLNLVSFLAITLSTGILVDDAIVEIENIVRHMRMGKSPYQAAIEAADEIGLAVIAISLTIIAIFAPASFMSGIAGQFFKQFGITVSVQVFFSLLAARFVTPVLAAYFLKHVPHEEKPPGRILRGYTRMVTWSVKHYYLTVLIGLGVFAASIWSIVLLPQGFLPAQDTSRSVMAMELPPGTQIGTTEKITETVVTMLRKRPEVRSVFVDGGRVPPGIHEVRRASLIINYTSKGDRKITQRELELAISKDLDQVPDIRYWFLDENGLRAISLVVTGADSNIVNNVAQELAAQMKRIPILSNVISETSLDRPELRILPRADLAARLGVSTESLSETIRVATIGDVGPALAKFDAGDRLVPIRVQLEDGARGDLSVLEQLQVPIYGGRGSVPLSVVADVKFDQGPTSINRYDRERQATVAADLVGNAALGDAQKRINDLPVMKSLPKGVRVSPSGDAESLNELSDGFATAISAGLMMVYAVLVLLFGTFLQPITILFSLPLSIGGAIGALLITGKQLTTPVWIGILMLMGIVTKNAIMLVEFALESIRDGKNREEAMIDAGQKRARPIVMTTIAMVAGMIPSALAFGAGGEFRSPMALAVIGGLIFSTVLSLIFVPAMFMMMDDVGRVSWSLGKRLLSHHHDDDGDPKPRPPAATPTPAPATATPSSPSPEKGFSFWRSK GT:EXON 1|1-1058:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 9->1006|NOLG_RHIME|e-138|32.2|988/1065| TM:NTM 12 TM:REGION 13->35| TM:REGION 37->58| TM:REGION 128->149| TM:REGION 333->355| TM:REGION 374->396| TM:REGION 431->453| TM:REGION 468->490| TM:REGION 521->543| TM:REGION 857->879| TM:REGION 901->923| TM:REGION 945->966| TM:REGION 980->1002| NREPEAT 1 REPEAT 2|7->485|512->996| SEG 881->890|iggaigalli| SEG 1029->1048|ppaatptpapatatpsspsp| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 10->998|2v50A|8e-86|27.0|979/1005| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 6->977|2dhhA|e-152|17.9|963/1022| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 5->1000|PF00873|e-175|37.4|989/1014|ACR_tran| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 6->1000|PF00873|1.1e-231|32.2|991/1021|ACR_tran| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0005215|"GO:transporter activity"|PF00873|IPR001036| GO:PFM GO:0006810|"GO:transport"|PF00873|IPR001036| GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF00873|IPR001036| RP:SCP:NREP 6 RP:SCP:REP 65->217|1mwkA2|2e-24|13.3|143/163|c.55.1.1| RP:SCP:REP 230->323|1iwgA2|8e-14|22.3|94/104|d.58.44.1| RP:SCP:REP 317->491|1iwgA7|1e-35|33.7|175/199|f.35.1.1| RP:SCP:REP 547->641|1iwgA3|2e-09|18.1|94/107|d.58.44.1| RP:SCP:REP 691->782|1iwgA6|1e-13|23.9|88/88|d.225.1.1| RP:SCP:REP 787->1000|1iwgA8|2e-26|23.1|212/222|f.35.1.1| HM:SCP:REP 42->134|1iwgA1|4.8e-21|41.9|93/0|d.58.44.1|1/2|Multidrug efflux transporter AcrB pore domain; 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