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Rhodopseudomonas palustris BisB5 (rpal2)
Gene : ABE38413.1
DDBJ      :             (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  40/68 : Bacteria  301/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.115.1d.58.10g.50.1
:763 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   28->84 1gxuA PDBj 6e-08 48.2 %
:RPS:PDB   28->95 1apsA PDBj 3e-13 20.6 %
:RPS:PDB   114->192 2a3mA PDBj 2e-06 13.3 %
:RPS:SCOP  28->96 1gxtA  d.58.10.1 * 7e-16 42.6 %
:RPS:SCOP  122->195 1dvpA2  g.50.1.1 * 4e-08 20.0 %
:RPS:SCOP  195->403 1jcuA  d.115.1.1 * 3e-30 20.8 %
:HMM:SCOP  11->98 1w2iA_ d.58.10.1 * 2.4e-23 54.0 %
:HMM:SCOP  182->403 1jcuA_ d.115.1.1 * 1.8e-45 35.0 %
:RPS:PFM   28->91 PF00708 * Acylphosphatase 8e-10 50.8 %
:RPS:PFM   115->146 PF07503 * zf-HYPF 8e-08 53.1 %
:RPS:PFM   164->195 PF07503 * zf-HYPF 1e-08 56.2 %
:RPS:PFM   203->387 PF01300 * Sua5_yciO_yrdC 3e-14 40.0 %
:HMM:PFM   204->388 PF01300 * Sua5_yciO_yrdC 1.5e-52 43.8 169/179  
:HMM:PFM   114->147 PF07503 * zf-HYPF 2.5e-16 41.2 34/35  
:HMM:PFM   164->195 PF07503 * zf-HYPF 2.9e-18 59.4 32/35  
:HMM:PFM   14->96 PF00708 * Acylphosphatase 1.4e-21 42.7 82/91  
:HMM:PFM   472->511 PF00814 * Peptidase_M22 9.6e-05 30.8 39/268  
:BLT:SWISS 28->757 HYPF_RHILV e-176 49.9 %
:PROS 19->29|PS00150|ACYLPHOSPHATASE_1
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABE38413.1 GT:GENE ABE38413.1 GT:PRODUCT (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF GT:DATABASE GIB00345CH01 GT:ORG rpal2 GB:ACCESSION GIB00345CH01 GB:LOCATION 1332500..1334791 GB:FROM 1332500 GB:TO 1334791 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF GB:PROTEIN_ID ABE38413.1 GB:DB_XREF GI:91682111 InterPro:IPR001792 InterPro:IPR004421 InterPro:IPR006070 InterPro:IPR006071 InterPro:IPR011125 LENGTH 763 SQ:AASEQ 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122->195|1dvpA2|4e-08|20.0|70/72|g.50.1.1| RP:SCP:REP 195->403|1jcuA|3e-30|20.8|192/208|d.115.1.1| HM:SCP:REP 11->98|1w2iA_|2.4e-23|54.0|87/0|d.58.10.1|1/1|Acylphosphatase/BLUF domain-like| HM:SCP:REP 182->403|1jcuA_|1.8e-45|35.0|203/208|d.115.1.1|1/1|YrdC/RibB| OP:NHOMO 359 OP:NHOMOORG 341 OP:PATTERN --11111---------1--11111-----1--1111111111111111--11111111111---1--- 111---1--------------1--12------2111-111-222---------------------111-----------111-1122------1-------1--1--------------------111111-111111-11111-11111111--11------11--1111-----------------111---111111---1-1----------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1--2111111111-11-------1-1-----1111--1-1-11--111--11----------12213---111-1---------------------------------1--11-----11111-----------1----1-1---------------------------------1--------------------2-------11--32-----11----1-1----11----1---------1-11-11-111111111111111111-11121-11111111111111111111111111111111-1------111111-111111111111-----1-1------111111-1111111111-11111-11111111111111111---1111111111111111111111111--1--------------------11111-1--111111-------------------1------------------1--------1------------------------------1--------------------------------------------1--------111 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 186 STR:RPRED 24.4 SQ:SECSTR 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