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Rhodopseudomonas palustris BisB5 (rpal2)
Gene : ABE38432.1
DDBJ      :             condensin subunit Smc
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  40/68 : Bacteria  633/915 : Eukaryota  197/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1d.215.1
:1154 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   3->166 1xexA PDBj 5e-18 32.3 %
:BLT:PDB   928->995 2eqbB PDBj 4e-04 33.8 %
:BLT:PDB   996->1151 1xewY PDBj 4e-31 44.4 %
:RPS:PDB   1->57,1051->1142 1e69A PDBj 5e-15 56.2 %
:RPS:SCOP  2->179 1w1wA  c.37.1.12 * 8e-22 21.1 %
:RPS:SCOP  512->616 1gxjA  d.215.1.1 * 5e-05 19.0 %
:RPS:SCOP  977->1143 1w1wA  c.37.1.12 * 6e-38 28.3 %
:HMM:SCOP  1->1147 1w1wA_ c.37.1.12 * 3.1e-79 30.8 %
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:RPS:PFM   402->501 PF04100 * Vps53_N 4e-05 30.0 %
:HMM:PFM   3->1135 PF02463 * SMC_N 9.1e-62 37.8 217/220  
:BLT:SWISS 1->54 RECF_CORJK 2e-06 43.4 %
:BLT:SWISS 123->199 RAD50_METKA 1e-04 33.8 %
:BLT:SWISS 327->509 CP135_DANRE 5e-06 20.2 %
:BLT:SWISS 904->993 MYS_AEQIR 9e-04 25.8 %
:BLT:SWISS 987->1142 YAT3_RHORU 7e-51 62.8 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ABE38432.1 GT:GENE ABE38432.1 GT:PRODUCT condensin subunit Smc GT:DATABASE GIB00345CH01 GT:ORG rpal2 GB:ACCESSION GIB00345CH01 GB:LOCATION complement(1350963..1354427) GB:FROM 1350963 GB:TO 1354427 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT condensin subunit Smc GB:PROTEIN_ID ABE38432.1 GB:DB_XREF GI:91682130 InterPro:IPR001687 InterPro:IPR003395 InterPro:IPR003439 InterPro:IPR010935 InterPro:IPR011890 LENGTH 1154 SQ:AASEQ 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3->166|1xexA|5e-18|32.3|161/166| BL:PDB:REP 928->995|2eqbB|4e-04|33.8|68/93| BL:PDB:REP 996->1151|1xewY|4e-31|44.4|151/160| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 1->57,1051->1142|1e69A|5e-15|56.2|146/263| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 3->229,897->1129|PF02463|1e-40|48.9|453/536|SMC_N| RP:PFM:REP 402->501|PF04100|4e-05|30.0|100/373|Vps53_N| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 3->1135|PF02463|9.1e-62|37.8|217/220|SMC_N| GO:PFM:NREP 2 GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF02463|IPR003395| GO:PFM GO:0005694|"GO:chromosome"|PF02463|IPR003395| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 2->179|1w1wA|8e-22|21.1|152/274|c.37.1.12| RP:SCP:REP 512->616|1gxjA|5e-05|19.0|105/161|d.215.1.1| RP:SCP:REP 977->1143|1w1wA|6e-38|28.3|152/274|c.37.1.12| HM:SCP:REP 1->1147|1w1wA_|3.1e-79|30.8|412/0|c.37.1.12|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 1536 OP:NHOMOORG 870 OP:PATTERN -----------------------111111111---111111111111111111-11111111111-11 1111111111111111111-11111111111111111111111111-111111111-1--111-1111111----1111111111111-----------------11-1---------------111111111-1111111---11111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11-1-111111111-111111111-----111111111111111111111111---1-11--111-1111111111111111111111111111111111111111111-----------------------------11111-1111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111-1-----------111111111111111---------------------------1111-111-111-1111111111111111121--11111--------------------------------------------------------------------------------------------11111111111111----------------11111111111111111111111111111------------------------11111111111111---11111111111111111-----1-11111111111111111111111111111-1- 2234422-83423343234444444444434554444434444444343344144444443344444414444433414433344444-3542344333442334434334565884141145376391DY817694324515562333472273A34459J243445558H7323234X4433234263414334554 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 393 STR:RPRED 34.1 SQ:SECSTR cEEEEEEEEccTTccccEEEEccccEEEEEccTTTccTHHHHHHHHTcccccTTccccccGGGGcccccTTccccccEEEEEEEEccccccccEEEcccEEEEEEEEcTTccEEEEETTEEEcHHHHHHHHHHTTccGGGTccccTTHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHc######################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################ccEEEcTTTccEcccccccccccccccHHcEEEEEEccTTccHHHHHHHHHHHTTccEEEEEHHHHHHHHHcccccGGGGcTTcHEEEEccHHHHTTcGGGHHGHHHHHHHHHHHcccTTcEEccHHHHHHHHHHHHHHHTTTccccEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHTGTTTcEEEEEcccTTGGGGccEEEEEEEcccccEEEEEcccHHHHHHcTT### DISOP:02AL 56-65,244-273,308-308,311-312,352-365,473-485,672-672,677-680,682-699,731-742,881-896,919-929,1046-1051,1153-1155| PSIPRED cEEEEEEEEEEEEcccEEEEEccccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHcccccccccccEEEEEEEEEccccEEcccccHHHHHHHHHHHHHccccEEEEccEEccHHHHHHHHHHHcccccccEEEcccHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHccccccHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHcccccEEEcccccEEEEccEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEccccccccccEEEEEEccccccccHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEcccHHHHHHcccEEEEEEEcccEEEEEEEEHHHHHHHHHHHcc 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