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Rhodopseudomonas palustris BisB5 (rpal2)
Gene : ABE39790.1
DDBJ      :             Amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  29/68 : Bacteria  696/915 : Eukaryota  4/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.58.1
:502 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   308->429 3dhwA PDBj 2e-06 31.6 %
:RPS:PDB   391->431 3dhwA PDBj 2e-07 43.2 %
:RPS:SCOP  308->498 2r6gG1  f.58.1.1 * 1e-24 13.6 %
:RPS:PFM   308->431 PF00528 * BPD_transp_1 8e-06 32.2 %
:HMM:PFM   308->496 PF00528 * BPD_transp_1 8.9e-23 21.3 178/185  
:BLT:SWISS 11->149 AAPM_RHIL3 6e-12 27.6 %
:BLT:SWISS 256->501 AAPM_RHIL3 2e-64 50.0 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ABE39790.1 GT:GENE ABE39790.1 GT:PRODUCT Amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine GT:DATABASE GIB00345CH01 GT:ORG rpal2 GB:ACCESSION GIB00345CH01 GB:LOCATION 2865939..2867447 GB:FROM 2865939 GB:TO 2867447 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT Amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine GB:PROTEIN_ID ABE39790.1 GB:DB_XREF GI:91683488 InterPro:IPR000515 InterPro:IPR010065 LENGTH 502 SQ:AASEQ MNEPRSTTPAFVRSEMVPERAAPVRTTGFVGLVGGRLFSSPTNILLTIVGALLLYLTIVPSVKFLLVDAVWTGSNRTDCLAETLHRDVGACWPFVQAKFSQFVYGFYPQPERWRVDLTFALAAVLLLPLLIPRAPAKTLNAGLFFIAFPVVAFFLLHGGGLHGFAVSWTADLLSSLVGSLDEAGTKLTRGGVIAVAIGKPVLWIATALYWLIAPLVWLRDWIQASGQPVWIDLGLTAVIVTALVLLIGGGLRNGARAPLMSLALFAGIALVIAVLRLDRGGLPIVGTRQWGGLLVTLVVSVTGIVGSMPIGIALALGRRSTIPLIRLFCIGFIEFWRGVPLITVLFFATYMLPLFLPGNFTIDGLLRVLIGIALFAGAYNAEVVRGGLNAIPRGQGEAASALGLSYAKTTGLIVLPQALRHVIPGLVNSFIALFKDTSLVSIVALFDLLGQLRAAFADPTWSTPNTLFTGFAFTGLIYFVFCFGMSRYSLFVEHRLNAHRRT GT:EXON 1|1-502:0| BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 11->149|AAPM_RHIL3|6e-12|27.6|138/384| BL:SWS:REP 256->501|AAPM_RHIL3|2e-64|50.0|246/384| TM:NTM 11 TM:REGION 47->69| TM:REGION 126->148| TM:REGION 194->216| TM:REGION 231->253| TM:REGION 256->278| TM:REGION 293->315| TM:REGION 327->349| TM:REGION 358->380| TM:REGION 398->420| TM:REGION 428->450| TM:REGION 463->485| SEG 120->136|alaavlllplliprapa| SEG 150->166|vvaffllhggglhgfav| SEG 233->251|lgltavivtalvlligggl| SEG 291->307|ggllvtlvvsvtgivgs| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 308->429|3dhwA|2e-06|31.6|114/203| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 391->431|3dhwA|2e-07|43.2|37/203| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 308->431|PF00528|8e-06|32.2|121/195|BPD_transp_1| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 308->496|PF00528|8.9e-23|21.3|178/185|BPD_transp_1| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0005215|"GO:transporter activity"|PF00528|IPR000515| GO:PFM GO:0006810|"GO:transport"|PF00528|IPR000515| GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF00528|IPR000515| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 308->498|2r6gG1|1e-24|13.6|191/284|f.58.1.1| OP:NHOMO 4404 OP:NHOMOORG 729 OP:PATTERN 11--12----------1-1111114--21-2211----1122--1211--1-1----2---------- ----4313333321411----6--1D------766636C914225283533-769135--222-577B5A4755576631421---------------------------11111111111111-----1--4---222331111-1234223332211121--1--3322-2222--2222-1341111--27455555875566556623398556333654355555396222222222222222222246657AA885676666993756B533388886664AA888777888876666566666666778A988888135475645455232343323333122142331AA-4132-1111111171--11137444422M57222412222375347567Q-22H22D19EJ23nSSNSWTVUhKLN9---26J656835C1111111132511-49----------111111111111111--1-4--21-5HFBFKJJILH96AAACCINBABB8AEEX778412A8C94854A7FEMQ234----944422222---25-11J-996C56CAAA42-23-3-------1--5-3341555553231211111-13----88A-3-----A-1111--11111111-11-1---1--------ABLK8CCAAAAAA8AA9-AACAAAAAAAAAA9AA99BGLENM776A8A7AAAAAAAAAA8AF89899993-DBBBBBAABBBB--5-222221111--78F55553533323333255665-64554-FDDFHNIS9FICE5KIK----------777A99999AA97711---------------2----------------3-------------------------132-115111--1 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----2------6-----------------2---------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 116 STR:RPRED 23.1 SQ:SECSTR ###################################################################################################################################################################################################################################################################################################################GGGGGGGGGGTTccccHHHHHH#HHHHHHHHccHHHHH###HHHHHHHHHTTcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccTTTTTHHHHHTccTHHHHHHTTHHHHH####HHHHHHHH####################################################################### DISOP:02AL 1-6,8-8,18-23,499-503| PSIPRED cccccccccHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHccccccccHHHHHcccccEEEEEccHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccc //