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Rhodopseudomonas palustris BisB5 (rpal2)
Gene : ABE39923.1
DDBJ      :             sugar transferase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  7/68 : Bacteria  662/915 : Eukaryota  2/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.2.1
:509 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   361->422 2b0tA PDBj 5e-07 13.1 %
:RPS:PDB   440->486 2a92C PDBj 1e-04 14.9 %
:HMM:SCOP  178->312 1xcbA2 c.2.1.12 * 2.7e-07 28.5 %
:RPS:PFM   314->505 PF02397 * Bac_transf 3e-42 54.5 %
:HMM:PFM   314->508 PF02397 * Bac_transf 4.4e-68 52.7 184/187  
:HMM:PFM   56->136 PF00060 * Lig_chan 0.00025 23.8 80/147  
:HMM:PFM   179->257 PF01408 * GFO_IDH_MocA 0.00075 23.3 73/120  
:BLT:SWISS 45->509 WCAJ_ECOLI 3e-58 32.7 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABE39923.1 GT:GENE ABE39923.1 GT:PRODUCT sugar transferase GT:DATABASE GIB00345CH01 GT:ORG rpal2 GB:ACCESSION GIB00345CH01 GB:LOCATION complement(3009166..3010695) GB:FROM 3009166 GB:TO 3010695 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT sugar transferase GB:PROTEIN_ID ABE39923.1 GB:DB_XREF GI:91683621 InterPro:IPR003362 LENGTH 509 SQ:AASEQ MIEAAAGAAATIEPNRPMVERRKRLSPAALAVANEKVQPAYSPIVIAGLVRLTDFVLIAAVGIALYLGYVARRDGLQWEYIAAILGMTITAVISFQAADLYEVQVFRGTLKQVTRMISAWTLVFLLFIGASFLAKLGGEVSRLWLSSFYLLGLAVLIAERLVLRNMVRHWARQGRLDRRTIIVGSDANGEKLINALRAQQDDDTDIRVLGVFDDRNDSRALATCAGAPKLGKIDDILEFARRTRVDLVLFALPISAETRILDMLKKLWVLPVDIRLSAHTNKLRFRPRAYSYLGNVPTLDVFEAPITDWDQVTKRLFDHVVGGLILLAAAPVMALVALAIKLDSPGPVLFRQKRFGFNNERIDVFKFRSLYHHQADPTASKVVTKNDPRVTRVGRFIRRTSLDELPQFFNVVFKGNLSLVGPRPHAVQGKLQSRLFDEAVDGYFARHRVKPGITGWAQINGWRGEVDSEEKIQKRVEFDLYYIENWSVLFDLFILLKTPWALLKGENAY GT:EXON 1|1-509:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 45->509|WCAJ_ECOLI|3e-58|32.7|446/464| TM:NTM 5 TM:REGION 50->71| TM:REGION 77->99| TM:REGION 117->139| TM:REGION 143->165| TM:REGION 319->341| SEG 4->10|aaagaaa| SEG 324->340|lillaaapvmalvalai| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 361->422|2b0tA|5e-07|13.1|61/735| RP:PDB:REP 440->486|2a92C|1e-04|14.9|47/318| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 314->505|PF02397|3e-42|54.5|178/182|Bac_transf| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 314->508|PF02397|4.4e-68|52.7|184/187|Bac_transf| HM:PFM:REP 56->136|PF00060|0.00025|23.8|80/147|Lig_chan| HM:PFM:REP 179->257|PF01408|0.00075|23.3|73/120|GFO_IDH_MocA| HM:SCP:REP 178->312|1xcbA2|2.7e-07|28.5|123/0|c.2.1.12|1/1|NAD(P)-binding Rossmann-fold domains| OP:NHOMO 1324 OP:NHOMOORG 671 OP:PATTERN ------------------------2111-1--11---------------------------------- 254-11--111-1-1-1----2--11-----12333-3341232311-133-3221----22111-2122-12221-2-1613-11116454-922---22232232412--------------1---1211334-66677---414446442111111132223167772-2111--2-1111211122-1-21111121--1112212222212121111121------131222222222222222--1111-21222111231122121222---111----1--21222222221-------------111121111121-332222222223-1112332313211331122322-111111121121-33442-----223532132121311-11111111-43444744432-533366477744212112112133312--------222--123------------------------------3262-3111-5222451222222753333234483343-11-153121-42231223222211111111122232211312-33212332132312233333433323-2222111111---------2112221--122231312111111112----123112--12112------2113-121111111111-12111111111111111111112-21-2-21222222122211111-11111--------------------------12322111212--1111--1--11112111321-111232111111222222222222123322222223234--2111111111111-1-112233----------1-------------------------2221112111152 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1---- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 108 STR:RPRED 21.2 SQ:SECSTR ########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################ccTTccEEEEcHHHHHHHHHHHHHTTcccEEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHcc#ccccEEEEE#################cEEEEEEEEEEEETTEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTT####################### DISOP:02AL 1-8,11-26,509-510| PSIPRED cccccccccccccccccHHHHHccccHHHHHHHcHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEcccHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEEEccccHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHccccEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHccccEEEcccHHHHHHccccHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEccccccEEEEEEEEccccEEEEEEEEEcccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHcccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccc //