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Streptomyces avermitilis MA-4680 (save0)
Gene : BAC67901.1
DDBJ      :             putative membrane protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  13/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.7.1
:1155 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   247->331 2djpA PDBj 4e-06 15.3 %
:RPS:SCOP  171->231 1e0gA  d.7.1.1 * 6e-04 23.0 %
:RPS:SCOP  258->315 1e0gA  d.7.1.1 * 6e-06 25.6 %
:HMM:PFM   260->315 PF01476 * LysM 1.8e-05 32.6 43/44  
:BLT:SWISS 117->182 CAMKV_HUMAN 9e-04 37.9 %
:BLT:SWISS 239->316 Y888_DEIRA 1e-04 44.8 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID BAC67901.1 GT:GENE BAC67901.1 GT:PRODUCT putative membrane protein GT:DATABASE GIB00135CH01 GT:ORG save0 GB:ACCESSION GIB00135CH01 GB:LOCATION 215158..218625 GB:FROM 215158 GB:TO 218625 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT putative membrane protein GB:NOTE PF01476: LysM domain GB:PROTEIN_ID BAC67901.1 LENGTH 1155 SQ:AASEQ MRTTHSPATAAGRTLGRVLKAVLSLLVLAAAVAGLPLLLAWVTPAIWASSHDDLTHLLDRQDTGAAFLLLLVAVGWIGWAQFAFCAVRELIAQVGGRSWQAPRRLGASQRAAALLVGSILVLLPTSSALASDAHASPATTEARVPGQAPAPQTAEPDQTLPDSASTPASRTSYTVRATRPAQSLWGIAERELGDGERWREIAALNEGRTMVDGQVFRAHGFLQPGWQLEMPDTAAAAGGIRTQLGRAAPTAEGKNEHVVTVHSGDYLSKIAEEELGDGGEWPRLFKASRGKTQPDGLPAISDPDVIYAGQQVTVPGAQPDPHTPPRDGDNGDEAGSQETTPPATQKPDGKQKPGDDRRDEQAPAPGTTTAPAPESSAPSTPASRPAEQPGQEQGSPSATASATPRPGTSPAPSAAAPSATAEAPGSADSSPATTASETPPPAPAPAPASSPLNLRTVLGAGTLLAAAITGALALRRTLQRRRRTPGEKIAIASETSPAEAKLAAAAEPGGAARLDVALRTLAHQVAHEKAADLPPIRAARIGTRTVEVLPEGLARKPQAPFVAGQAGWWVLPAEAVLLDEETAREVPAPYPGLVTIGSTESGDLLLLNLPQVAALLLDGNPVHITEVCTSLALELGMSPWASEAEIVTIGFGEDLPQLLPTSRIAHMRHARHALRDLSERLLEAHQMPETSHQPYLLLCASTLDADLAWQFADIIDKAQHVPVTLIAPASAAAASFPDAEILNASLSKPQQFDYIGSEITVQRLEHAAYLQITTALAISAQPADPAEGPWEEVPHEPDTPQRPRPLDLAKPTQSGDGEKPVPASPFTAGTGDSEIYPALLAASTDPASLKLLPDPKAPGKAPAEPGTEPAEMTPDGRAPQKAAEATGRPQETPAAEAVGEDTQAQDLHAPEIRVLGPVEVTGVATTGHGPSQARLAALLYFRPGRSADVLCADMDPVSPWSTATLNARLQGLRRALGNDPAGNAYVPRRRSGDDPYELSEAVRCDWARFTQLAQRALPQGTAGLPDLEKALGLIRGRPFGTRPLPWAEPYQQEMSTRIIDVAHTVATYRTPTGPHHDLTAARQAIATGLDVDDSAELLYRDWMRIEHAAGNRAGLHTAITRIQDINRKIDCSLENETEQLINDLLGPTGGRARGR GT:EXON 1|1-1155:0| BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 117->182|CAMKV_HUMAN|9e-04|37.9|66/100| BL:SWS:REP 239->316|Y888_DEIRA|1e-04|44.8|67/253| TM:NTM 3 TM:REGION 21->43| TM:REGION 66->88| TM:REGION 107->129| SEG 18->42|vlkavlsllvlaaavaglplllawv| SEG 68->71|llll| SEG 362->386|apapgtttapapessapstpasrpa| SEG 394->451|gspsatasatprpgtspapsaaapsataeapgsadsspattasetpppapapapassp| SEG 454->484|lrtvlgagtllaaaitgalalrrtlqrrrrt| SEG 497->512|paeaklaaaaepggaa| SEG 604->617|llllnlpqvaalll| SEG 727->739|apasaaaasfpda| SEG 849->874|lkllpdpkapgkapaepgtepaemtp| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 247->331|2djpA|4e-06|15.3|72/77| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 260->315|PF01476|1.8e-05|32.6|43/44|LysM| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 171->231|1e0gA|6e-04|23.0|44/48|d.7.1.1| RP:SCP:REP 258->315|1e0gA|6e-06|25.6|43/48|d.7.1.1| OP:NHOMO 17 OP:NHOMOORG 13 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 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DISOP:02AL 1-8, 100-113, 123-559, 732-753, 765-832, 837-910, 925-930, 1016-1021, 1149-1155| PSIPRED cccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHcccccccccccHHHHHHHHccccEEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEccccccccccccccccccccHHHHcccccccccHHHHcHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEcccccHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHccccccccccccccHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEcEEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccEEccHHHccHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHccccccccccc 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