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Streptomyces avermitilis MA-4680 (save0)
Gene : BAC67909.1
DDBJ      :             putative large secreted protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  2/68 : Bacteria  113/915 : Eukaryota  7/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.86.1
:2370 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   1358->1714 3ckaA PDBj 6e-13 10.4 %
:RPS:PDB   2120->2303 1ef0B PDBj 8e-10 12.7 %
:RPS:SCOP  2137->2267 1dq3A1  b.86.1.2 * 4e-10 17.6 %
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:RPS:PFM   331->570 PF03534 * SpvB 1e-07 33.7 %
:RPS:PFM   2140->2267 PF07591 * DUF1557 4e-09 35.8 %
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:HMM:PFM   1365->1395 PF05593 * RHS_repeat 7e-05 53.3 30/38  
:HMM:PFM   1407->1442 PF05593 * RHS_repeat 0.00034 30.3 33/38  
:HMM:PFM   1684->1702 PF05593 * RHS_repeat 0.00012 47.4 19/38  
:HMM:PFM   1773->1810 PF05593 * RHS_repeat 1.9e-06 38.2 34/38  
:BLT:SWISS 1147->1665 RHSD_ECOLI 2e-11 29.8 %
:BLT:SWISS 1905->1967 YIBJ_ECOLI 8e-04 39.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAC67909.1 GT:GENE BAC67909.1 GT:PRODUCT putative large secreted protein GT:DATABASE GIB00135CH01 GT:ORG save0 GB:ACCESSION GIB00135CH01 GB:LOCATION complement(229825..236937) GB:FROM 229825 GB:TO 236937 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT putative large secreted protein GB:NOTE PF05593: RHS Repeat GB:PROTEIN_ID BAC67909.1 LENGTH 2370 SQ:AASEQ 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DISOP:02AL 1-3, 16-218, 234-235, 239-322, 357-369, 2005-2016, 2285-2286, 2288-2294| PSIPRED cccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEcccccccccccccccEEccccccccccccccccccccEEEEEEEcccccEEEEcccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEcccEEEEEEEcccccEEEEEcccEEEEEEccccccccccccEEEEEcccccEEEEEccccccccccccEEEEEEEEEccccccccccccccccEEEEEEEEEEEEccccEEEEEEEEcccccccccccccccEEEccccHHHHHHccccccccccccEEEEEccccEEEEEccccccccccccccccccccccccccccEEEEEcccccccccccccccccEEEEEEEEEEEEEEEccccccccHHHHHEEEccccccccccccEEEEEEHEEccccccccEEEccEEEEEEEccccccccccccEEEEEEEcccccEEEEEEEEccccccccccccccccccEEEEEEcccccccccccccEEEEEEEEEccccEEcccccEEEEEEEEEEccccccccccccccccccEEEEEHHcccEEEEEEcccccEEEEEEEEEEcccccEEEcccccEEEEEEEEccccEEEEEEEcccccEEEEEEEccccEEEEEEEEcccccEEEEEEccccccEEEcccccEEEEEEcccEEEEEEEccccccccEEEcccEEEEccccccccccccEEEcccccEEEEEEcccccEEEEEccEEEEEEEccccccccccccEEEEEEcccccEEEccEEccccEEEEEEEcccccEEEEEEEcccccEEEEEEccccEEEEEEccccccccccEEEEEEccccEEEccccEEEEEEEccccccEEEEEcccccEEEEEEcccccEEEEEEcccccccEEEEEEEEcccccEEEEEEcccccccEEEEEEEccccEEEEEEEEEccccEEEEEEcccccEEcccccEEEEccEEEEEEEcccccEEEEccccccEEEEcccccEEEEEcccccEEEEEEcccccEEEEEEEccccccccEEEEEEEcccEEEEEEccccEEEEEEEcccccccEEEEEccccEEEEEEEcccccEEEEEcccccEEEEEEcccccEEEEEEccccEEEEEEcccccEEEEEEccccEEEEEEEEEcccccEEEEEEccccEEEEEEcccccccccccEEEEEEEcccccEEEEEEEEEcccccEEEEEEEEccccccccccEEEEEEEcccccEEEEEEcccccccccEEEEEEcccccEEEEEEcccccEEEEEEEEcccccEEEEEEEcccccccEEEEEEEEEEcccEEEEEEEEEcccEEEEEccccEEEEEEEcccccEEEEEEcccccEEEEEEEEEcccccEEEEEEcccccEEcccccccccccccccEEEEEEEcccccEEEEEEccccccEEEEEEEEEcccccccEEEEcccccccEEEEEcccccccccccEEEEEccccEEEEEcccEEEEEEEcccccEEEEEEEcccccEEEEEEEcccccEEEEEEcccEEEEEcccEEEEEcccccEEEEEEccccEEEEEEEcccccccccEEEEEEEcccccEEEEEEccccEEEEEEEcccccEEccccccccccEEccccccHHHHHHHHccccccHHHccEEcccccccccccccccEEEEEccccccEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHcccccccccccccccEEEEEccEEcccEEEEEEcccccccccccEEEEEcccEEEcccccccHHHccEEEEEEEEccccccccccccccccHHHHHHccEEEccccccccccccccccccccccEEEEccccccccHHEEEEccEEEEccccccccccEEEEEEEEEccccEEEEEEEEcccccccEEEEcccccEEEccccEEEEEEEEccccEEEcccccEEEEccEEEcccccEEEEEEEcccEEEEEEcccccEEEEcccccccccccccccccccccccccccccEEccccEEEEccccccccccccEEEEEccccEEEEEcccccEEEEEcccccEEcccccccccccccccccEEccc 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