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Streptomyces avermitilis MA-4680 (save0)
Gene : BAC67956.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  11/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1
:738 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   127->156 3cw2B PDBj 3e-05 20.0 %
:RPS:PDB   131->169 1ek0A PDBj 9e-05 25.0 %
:RPS:SCOP  122->155 1sulA  c.37.1.8 * 3e-04 14.7 %
:RPS:SCOP  133->195 1zd9A1  c.37.1.8 * 9e-06 12.7 %
:HMM:SCOP  99->309 1w5sA2 c.37.1.20 * 9.8e-07 21.6 %
:HMM:PFM   134->301 PF05729 * NACHT 1.9e-15 24.5 151/166  
:BLT:SWISS 131->199 RSGA_OPITP 3e-04 39.4 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAC67956.1 GT:GENE BAC67956.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00135CH01 GT:ORG save0 GB:ACCESSION GIB00135CH01 GB:LOCATION 284429..286645 GB:FROM 284429 GB:TO 286645 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT hypothetical protein GB:NOTE PF05729: NACHT domain GB:PROTEIN_ID BAC67956.1 LENGTH 738 SQ:AASEQ MLAQSSGQSVAAVGMGLLTALGGFYLAWKAFQQDRDQVTAMSLGTAVDQLAEAVKKQWDAEASVRRLNDPYPLPVAWRAADADLVQPWTLLADVARGWPGGPPGDPAQWPTDAAGLAGADAQIGEVFAQRVPTRRLVVLGDPGSGKSMLLIRLLHDLIAQRPDDGPVPVLFSLASWNPTHRPLQSWLADQLRHTYPGLRAPAPSAAPQAGQIDLAQALLDTRRILPLVDGFDELPPALHAIALDALNQALPAKQPLVLASRAAAYREALARSEVLVRPLNGAAGIHLLPLPADQAATYLRHDAGGEHTPAADRWNSVAAHLGTNTLVGQALSTPLGLFLARTIYNPRPDILGAPAPVPHPDELYDTTIFPTRAALDTHLFNAYIPAAYTRHQPNPLRWSPSQAYRTLVFLARHLETNRNGSPDLAWWELHHANPAYIRRLTAGLMVGLGPGLLLGLVYGVGLGLAAGIGLAAGLTYGLIGGGLGSAPSNIPSTRLRWSRRRFAGWLGAGLALGLVGGLAFGLGIAGERGAWLATGILPGEHGFVGWLAFGLALGLIAGLACGLTFGLTGEKPALTTMIGPATLLIQDLRTFLGGGLAYGLGAGFVGGFIGWLVSWLAFGAEDGLAFGQAFGLAFGLGASLEQTAWGDWVIAKAYLAMWRRAPWDLMTFLQDAHQHRGVLRQVGAVYQFRHLDLQRHLAQQPRSLPTYAGQPDSPSRLTGEQARSIHRRGNTRTGSLFD GT:EXON 1|1-738:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 131->199|RSGA_OPITP|3e-04|39.4|66/100| TM:NTM 6 TM:REGION 5->27| TM:REGION 440->462| TM:REGION 464->486| TM:REGION 503->525| TM:REGION 544->565| TM:REGION 593->615| SEG 200->209|apapsaapqa| SEG 258->273|lasraaayrealarse| SEG 442->484|aglmvglgpglllglvygvglglaagiglaagltygliggglg| SEG 503->526|agwlgaglalglvgglafglgiag| SEG 542->563|gfvgwlafglalgliaglacgl| SEG 591->610|flggglayglgagfvggfig| SEG 623->638|glafgqafglafglga| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 127->156|3cw2B|3e-05|20.0|30/400| RP:PDB:REP 131->169|1ek0A|9e-05|25.0|36/168| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 134->301|PF05729|1.9e-15|24.5|151/166|NACHT| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 122->155|1sulA|3e-04|14.7|34/186|c.37.1.8| RP:SCP:REP 133->195|1zd9A1|9e-06|12.7|63/164|c.37.1.8| HM:SCP:REP 99->309|1w5sA2|9.8e-07|21.6|199/0|c.37.1.20|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 17 OP:NHOMOORG 11 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ----1------------------------------------1-2----------------1---2--3------------------------------------------------------------------------------311-------------------1-1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 78 STR:RPRED 10.6 SQ:SECSTR #########################################################################################################################HHHcccccccccEEccEEcccTTTTHHHHHHHHccGcccccTTcccccEEEEEEEEEETTTccEEccccccccccccc########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-11, 707-729, 732-738| PSIPRED ccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHcccccHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccHHHHHHcccHHHHHHHHHcccccccEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHccHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccHHHHHHHHccccccccccc //